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文献分享-----10X Visium HD & Stereo-seq图像分割（nature文献）
作者，Evil Genius今日我们分享文献，先看看正文部分，代码后续更新补充大家看到没，这些核心的算法都有中国人的参与。知识积累空间转录组学的一个开放性问题是单细胞水平上的信息推断。
42510编辑于 2024-12-12- 来自专栏单细胞天地
文献分享——SingleR包来源
DCPART4：其他模型中也发现C1、C2和C3PART5：C2位于纤维化niche中PART6：表达CX3CR1的巨噬细胞促进肺纤维化进展一些小问题关于SingleR工具安装新单词后记 前言 今天和大家分享一篇文献 macrophage》 下载地址：https://www.nature.com/articles/s41590-018-0276-y.pdf 也有比较多的推文中介绍过这个工具的用法，今天我就先读读这个文献 先简单看看文献吧！ 又或者难道我找错了文献？？不太清楚，毕竟我没用过。
3.8K21发布于 2020-03-30 - 来自专栏生信菜鸟团
分享| PyPubMed文献搜索整理小工具
欢迎回来，科研的日常总避不开要查阅、下载整理文献。之前我们推荐过不同的方法，例如NCBI加谷歌助手、SCI-hub代替网站、中文期刊下载方法等。 但都还是停留在手动层面，今天分享一个最近看到自动化小工具，不仅在下载中添加了条件筛选，将文献检索与摘要输出excel表格，我扒了它的github仓库，一起来看看吧~ ? Desktop\pmid-NGSTitleAb-set.txt 翻译一下几个关键的参数 -min, --min-factor FLOAT（设置最小影响因子） -l, --limit INTEGER（设置输出文献数量 pubmed.xlsx） -c, --cache（输出缓存文件） advance-search** pypubmed advance-search 这项搜索中会出现一问一答的交互，例如下图，但是作者并不建议在文献数量过多的时候使用该方法
84640发布于 2021-03-23 - 来自专栏量化小白上分记
文献分享(二)：深究低BETA异象
这周认真写一篇 上周的Quantocracy里面有一篇感觉挺有意思，A Deep Dive into the Low Beta Premium ，文章链接可以去翻翻上周的推文，里面介绍了许多关于beta的文献及研究结论 ，以后有空可以找找看 1970年代，菲舍尔·布莱克（Fischer Black）等人首次在文献中记录了低波动率股票的优异表现——甚至在规模和价值溢价被“发现”之前，低波动异常现象已被证明存在于世界各地的股市中 2018年，Time-Varying Leverage Demand and Predictability of Betting-Against-Beta这篇文献得到了类似的结论，过去高/低市场收益，BAB
96720编辑于 2023-03-19 2024空间转录组分析方向和文献分享
10X空间转录组技术创新之同时测RNA和TCR（BCR） 10X空间转录组之免疫组库分析 实验方案也是现成的，Localization of T cell clonotypes using the Visium Tumour tissues were trimmed to fit the capture area (6.5 mm x 6.5 mm) on the 10x Visium slide. 由此可以获得肿瘤组织空间微生物分布信息 方向三、空间邻域方向 10X空间转录组之构建邻域通讯网络 空间组学邻域分析方法更新之BANKSY 空转数据分析之细胞“社区” 10X空间转录组数据分析之细胞单元 空间转录组的几个分析要点及经典文献分享 空转数据分析之关于细胞空间邻近的分析文章总结 10X空间转录组数据分析之同型分数（细胞网络）和异型分数（临近网络）计算 邻域分析包括分子邻域和细胞邻域，对应的空间分子 系统整理10X单细胞空间数据中可检测到的有害突变位点（OncoKB） 单细胞、空间、外显子解析TP53突变重构肺腺癌细胞图谱 多组学（单细胞、空间转录+蛋白、外显子、甲基化）揭示神经母细胞瘤异质性图谱
70320编辑于 2024-03-21- 来自专栏生信技能树
Github带有全套代码分享的文献复现2025
我们生信技能树在前面给大家整理过大量的带有全套代码在 github 上分享的文献，还有一个专门的共享表格：自带图表复现代码及数据集的单细胞及多组学文章-V1 https://docs.qq.com/sheet 我们秉承着一切分享学习的态度，即将开启2025年的新专辑《Github带有全套代码分享的文献复现2025》，我们以学习文献中的思路，代码技巧为主，带领大家攻破一篇篇文献，将其运行到自己的科研课题中。 下面第一篇学习的文章非常好，作者的数据，代码整理的非常详细见以前的分享： 代码分享|| 见过将代码整理成wiki资源的吗？这是篇极好的学习单细胞与scATAC-Seq组学以及联合分析的文献资源！ ，代码，提前熟悉文献内容！ 上面说的有点绕，代码运行来看看很快就会明白： # Load the RNA dataset # counts <- Read10X_h5(filename = ".
1.2K01编辑于 2025-02-10 - 来自专栏生命科学
MG-132 顶刊引用文献分享｜MCE
/10ScSn DMD mdx 小鼠)[9]。 文献验证Cancer Cell. 2023 Jun 12;41(6):1073-1090.e12.Representative immunoblot for total p65 and β-ACTIN (3):814-831.e21.MG132 (42 μM; 12 h) almost completely blocks mouse embryonic development.MG-132 顶刊引用文献精选 文献标题ZDHHC20 mediated S -palmitoylation of fatty acid synthase (FASN) promotes hepatocarcinogenesis摘要背景 参考文献[1].
41910编辑于 2025-08-14 - 来自专栏用户7627119的专栏
文献速递 | 6月单细胞测序文章分享
大家好，每月的单细胞文献速递栏目又来啦，6月份单细胞领域又有哪些新的成果呢？ 本期小编一共为大家统计了94篇6月份发表的9分以上单细胞测序相关文章，其中影响因子15.0以上的文章有41篇！
62431编辑于 2022-09-21 - 来自专栏空间转录组数据分析
空间转录组的几个分析要点及经典文献分享
1.3 SPOTlight分析 每个空间spot大约包含1-10个细胞，因此需要解析每个spot内的细胞组成，这种分析一般称为去卷积分析（deconvolution）。 同时计算出互作对的score值，值越大表示互作越强烈，并在空间切面上展示其相应p值、矫正后的p值和-log10（p_adjs）。 我们再来几篇文献 1、空间推动对肿瘤亚结构的认知 人类肿瘤图谱网络（HTAN）计划有一个远大的目标：“构建人类癌症的三维图谱，反映从癌前病变发展到晚期疾病的动态的细胞、形态和分子特征。” 对于部分肿瘤（共有15张Visium玻片），他们还生成了相匹配的10x Genomics空间转录组学数据。这种多维方法揭示出有着不同组织学特征的细胞亚群，它们代表了癌症进展的过渡阶段。 复旦大学和江西农业大学的研究团队利用10x Genomics的Visium空间基因表达分析构建了兰花多个发育阶段的花器官发生的综合时空图谱。
3.1K31编辑于 2023-02-13 文献分享--口腔黏膜免疫受独特的空间结构调控
作者，Evil Genius今天我们分享文献知识积累屏障组织（如皮肤、胃肠道和呼吸道）持续暴露于外界环境中。
17420编辑于 2026-02-21- 来自专栏wayn的程序开发
分享10个高级sql写法
进而分享给大家。 10、存在就更新，不存在就插入 MySql 中通过on duplicate key update语法来实现存在就更新，不存在就插入的逻辑。 `) VALUES ('新闻4', '小花', 'wx-0003') on duplicate key update news_title = '新闻4'; 结果如下： 图片 总结 到这里，本文所分享的 10个高级sql写法就全部介绍完了，希望对大家日常开发 sql 编写有所帮助，喜欢的朋友们可以点赞加关注。
1.7K41编辑于 2023-03-13 - 来自专栏Sign
web版《合成10》代码分享
正文 这个游戏，我提了好几次了，公众号SignACG回复『合成10』可以获取游戏链接。 前面有一篇讲『合成10』的游戏实现逻辑。 这次来直接分享代码吧。 我把代码放到github上了，阅读原文可查看，或访问这个链接 https://github.com/ccx01/get10 ? index-done.html就是完整的代码了，无注释。 最后，增加一些判定条件，比如每个方块的set值都不一样，这说明已经没有方块可以再进行合成了，那么此时就可以提示游戏结束，然后做一些『别的事情』，比如提交分数到排行榜，设置分享参数之类的。 比如这个『合成10』，如果现在的我来写的话，我可能就不会在这些代码上进行扩展了，而是重新开始从0写一份。
1.3K60发布于 2018-04-18 - 来自专栏生信菜鸟团
每周文献分享第一季完结撒花暨第65期分享
今天，2020年6月20日，我们的每周文献分享已经陪大家度过了65周，或者，至少陪生信菜鸟团文献分享小组的几位成员真真切切的走过了65个周末。 在每周文献分享第一季结束之际，我们要特别感谢如下几位成员。 六六从文献分享的中后期开始，肩负起每周文档发布、排版以及公众号推送的任务。 lakeseefly目前在澳洲读博，从第一期文献分享至今，他的文献分享数量应该可以排进前三名，而且在大家有事的时候，都是他顶上保证正常推送。 冰糖、大吉、鲍志炜和Sunshine是最早参与到每周文献分享的几位作者，如果没有他们一开始的加入就不会有每周文献分享这个项目。 另外，来留言说说你和每周文献分享的故事吧！
68740发布于 2020-06-24 文献分享--大B细胞淋巴瘤微环境archetype profiles
作者，Evil Genius今天我们分享文献，大家多多学习，早日发文章。知识积累大B细胞淋巴瘤（LBCL）是临床和生物学异质性淋巴恶性肿瘤，具有复杂的微环境，是疾病病因学的核心。
27610编辑于 2025-06-22- 来自专栏量化小白上分记
文献分享(一)：你的风险模型能预测你的风险吗？
新开一个文献分享系列。今天分享一篇UBS的研报，获取原文后台回复“paper1”。 按照报告的顺序来写吧。 01 Summary 开篇三个要点 风险模型非常重要。
87510编辑于 2023-04-03 - 来自专栏AI算法与图像处理
沐神（李沐）分享如何快速阅读和整理文献的技巧
本文整理自 B 站视频：https://www.bilibili.com/video/BV1nA41157y4 由李沐大神分享关于如何快速阅读和整理文献的相关经验。 以后看到一些优质的内容，我也会努力分享给大家，无论大家是在科研或者工作中，希望都能有所收获。 ? ）在工作之后，目的是对 5-10 个我比较感兴趣的研究方向了解他们的最新的进展，这样子我能够去思考我们团队接下来的研究方向，以及在技术讨论的时候，我能给大家指出这是一篇相关的论文，大家可以去看一下 二、 （未分享出来） 小技巧： 有时候一个领域里面的重要论文比较多的时候，我也会去画一个图，把比较重要的论文之间相互联系起来 ? 三、工具的整理和相关的入门教程 上面的内容就是李沐大神的分享，下面是我针对视频中提到的一些工具，进行相应的整理。
1.4K30发布于 2021-05-10 文献分享---乳腺癌复发肺转移的空间多组学分析
作者，Evil Genius今天我们分享文献，虽然IF不高，但是很多分析方法很好。知识积累原发性乳腺癌（BC）和转移性肿瘤具有不同的肿瘤微环境（TME）生态系统。
30220编辑于 2025-04-24- 来自专栏全栈程序员必看
LaTeX 参考文献_论文参考文献外文文献格式
这篇好棒，但是代码写在什么位置看下一篇(26条消息) Latex中如何制作参考文献_bluenight专栏-CSDN博客_latex中参考文献 https://blog.csdn.net/chl033 /article/details/5927207 这篇有代码位置 (26条消息) Latex引用bib文件步骤_一个人漫步走-CSDN博客 【Latex】如何同时引用多篇参考文献_一千零一夜的博客-CSDN 博客_latex怎么连续引用多个文献这篇也可以，写了几个细节：1.cite包一定要导入 2. 写了里面的cite（好几篇都提到cite，），目前所有参考文献最下面（多余的不知哪来的怎么删）[1,2]变成了[2,1]不知为什么。 这篇没用到里面的内容，不知道为什么要写在这(26条消息) latex参考文献格式与宏包应用_weixin_34107955的博客-CSDN博客 版权声明：本文内容由互联网用户自发贡献，该文观点仅代表作者本人
1.4K20编辑于 2022-10-01 文献分享---恢复单细胞批量整合中丢失的生物信号（CellANOVA）
今日分享文献单细胞研究中的批效应包括什么？单细胞数据整合分析已经是普遍的分析内容，目前，对于样品之间的生物差异何时可以从批效应中分离出来，还没有指导方针。
25720编辑于 2024-12-02- 来自专栏Data分析
【分享 10 个日常使用的脚本】
分享 10 个日常使用的脚本 1、测网速，选择最佳服务器 这个脚本可以测试上传、下载速度，也提供了函数 get_best_server 来选择最佳服务器，在客户端和多服务器模式中非常实用。 3、Web 机器人 这个咱之前已经分享过了，selenium 和 playwright 都可以，我个人更喜欢 playwright selenium 示例代码： # pip install selenium 2, 4)) print(Hex_to_Rgb('#c96d9d')) # (201, 109, 157) print(Hex_to_Rgb('#fa0515')) # (250, 5, 21) 10
60010编辑于 2024-01-30
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