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Science | SARS-CoV-2和SARS-CoV受体结合域中高度神秘保守的抗原表位
77%，如此高的序列相似性增加了SARS-CoV-2和SARS-CoV之间的引起交叉反应（两种来源不同的抗原，彼此之间可以有相同的抗原决定簇，由此决定簇产生的抗体不仅可分别与其自身表明的相应抗原表位结合 ，而且还能与另一种抗原的相同表位结合发生反应）的抗原表位存在的可能性。 2和SARS-CoV中都保留了，表位位点的高保守性解释了CR3022的交叉反应，尽管如此，CR3022结合SARS-CoV RBD的能力高于其结合SARS-CoV-2的RBD，这种差异可能是由于两者抗原表位上的非保守的氨基酸位点 SARS-CoV-2与SARS-CoV具有相同的宿主受体ACE2，CR3022的抗原表位与ACE2结合位点不重叠（图3），这意味着CR3022中和SARS-CoV的机制不依赖于直接阻断受体结合；事实上， ，已经报道的就有流感病毒、疱疹病毒、登革热病毒等，故CR3022抗原表位有可能在生物体内具有辅助效果；抗原表位的可用性不仅可以用于SARS-CoV-2的疫苗设计，还可以用于应对未来冠状病毒流行病和传染病对应的交叉保护抗体的设计
79870发布于 2021-02-01 - 来自专栏DrugOne
arXiv | 预测抗体抗原结合位点的神经消息传递模型
抗体-抗原相互作用中的结合位点分别称为互补位和表位，本文认为互补位和表位的预测器需要不对称处理，因为互补位是高度连续的，可以很好地单独预测，而表位本质上是结构性的，并且固有地受互补位的制约。 由此提出了不同的神经信息传递架构Para-EPMP和Epi-EPMP，分别针对互补位和表位特定方面的预测。本文在这两个任务上的都得到了显著的提升效果，并进行了covid-19相关的抗原的定性预测。 本文将抗体的互补位和相应抗原的表位预测转化为一个二元分类问题：对于抗体和抗原中的每个氨基酸残基，它们分别参与了结合吗？ 图2 Epi-EPMP多任务体系结构 表位模型 表位模型结构图如图2所示，是一个只利用结构信息的模型。 这个表位模型可以同时预测抗原和抗体的结合氨基酸。 ? 表1表位预测为基准的模型 结果 多任务不对称预测器的结果如表1所示，明显优于目前其他的先进技术。
1.6K60发布于 2021-07-05 - 来自专栏生信修炼手册
HLA Epitope Registry-HLA抗原表位数据库
抗原表位指的是抗原分子中决定抗原特异性的特殊化学基因，抗原通过抗原表位与对应的抗原受体想结合，从而引起免疫应答反应。 一个抗原分子可以含有多个抗原表位，抗原表位的性质，数目和空间结构决定了抗原的特异性。 多种抗原分子之间会存在共有的抗原表位，由这些共同的抗原表位刺激机体而产生的抗体可以与多种抗原分子相结合，这种想象叫做交叉反应。 HLA Epitope Registry 是一个在线的数据库，存储了HLA Allel 对应的抗原表位信息。 ,其他则为provisional; 第六列表示抗原表位的结构，第七列表示Luminex 芯片中对应的HLA Allel; 第八列表示抗原表位对应的所有的Allel。
1.3K50发布于 2020-05-11 - 来自专栏爱可生开源社区
第11期：压缩表
{MYD,MYI} 3539537 116M -rw-r----- 1 mysql mysql 116M 3月 31 11:46 n1.MYD 3539536 1.4M -rw-r----- 1 mysql mysql 1.4M 3月 31 11:48 n1.MYI 对 MyISAM 表的压缩，MySQL 通过自带程序 myisampack 来压缩，仅仅压缩表数据，不对索引进行压缩。 {MYD,MYI} 3539542 31M -rw-r----- 1 mysql mysql 31M 3月 31 11:46 n1.MYD 3539536 1.4M -rw-r----- 1 mysql mysql 1.4M 3月 31 11:48 n1.MYI MyISAM 压缩表非常适合只读的场景！ 压缩率大约为 50% root@ytt-pc:/var/lib/mysql/3304/ytt# ls -sihl 总用量 11M 3539513 11M -rw-r----- 1 mysql mysql
72320发布于 2020-08-21 位逻辑计算真值表
1变成0，0变成1 ---- 异或：^ : (相同的就为0，不同的为1) 真值表; 1 ^ 0 1 1 ^ 1 0 0 ^ 0 0 0 ^ 1 1 ---- 很久之前的知识，最近使用居然忘了
94720发布于 2020-12-30- 来自专栏DrugOne
. | 宋江宁团队合作开发CD8+ T细胞受体识别抗原表位的预测新方法
准确、高通量地识别与特定抗原表位结合的TCR能够帮助理解 T细胞免疫反应的机制，并支持开发基于TCR的免疫疗法。 然而，现有方法大多仅关注TCRβ链上的互补决定区3（CDR3），并且在预测新生抗原（neoantigen）或不常见的抗原表位时效果并不理想。 EPACT模型整合了成对的αβ T细胞受体、抗原表位和人类白细胞抗原（HLA）的输入，输出TCR和抗原表位-MHC的结合特异性以及CDR区域和表位间氨基酸残基水平的相互作用。 在TCR-pMHC复合物的三维结构数据上进行微调后，EPACT通过CDR和抗原表位氨基酸水平特征的外积和二维卷积层预测了两者间的距离矩阵和接触位点，不仅更准确地识别了TCRβ链上CDR3区域和抗原表位的结合热点 图 1 CD8+ T细胞受体识别抗原表位预测方法EPACT的模型框架和应用场景。
58510编辑于 2024-11-23 - 来自专栏一条IT
【每日leetcode】11.比特位计数
这道题有两种位运算思路，都是利用数组前面已经算好的数来计算当前数的1的个数 ——leetcode此题热评 前言 哈喽，大家好，我是一条。 比特位计数 难度：简单 给定一个非负整数 num。对于 0 ≤ i ≤ num 范围中的每个数字 i ，计算其二进制数中的 1 的数目并将它们作为数组返回。
41550发布于 2021-08-12 - 来自专栏Jenkins
API Testing v0.0.17 新增 11 位 contributor，1 位 committer
诞生了第二位项目 Committer @yuluo-yx 非常期待 atest 可以帮助更多的项目持续提升、保持 API 稳定性。 官方的依赖库替换当前实现 (#439) @dshyjtdes8888 增加 issue comment github actions (#382) @yuluo-yx 致谢 本次版本发布，包含了以下 13 位 yuluo-yx @zhouzhou1017 相关数据 下面是 atest 截止到 v0.0.17 的部分数据： watch 8 fork 47 star 209 (+86) contributor 24 (+11
28110编辑于 2024-06-24 - 来自专栏从零开始的Code生活
LeetCode 找不同(位运算)(哈希表)
思路 方法1：位运算 ^运算符：0与任何数ch做^运算都是ch 相同字符异或为0 因为t中的字符是s + ch，所以s与t做异或剩下的就是ch class Solution { public: 0; for(char c : s + t) { res ^= c; } return res; } }; 方法2：哈希表 把s中所有元素存到一个哈希表mpS里，t中所有元素存到一个哈希表mpT里 然后比较两个哈希表每个元素个数，不一样的就是题目所求 char findTheDifference(string s, string
40410编辑于 2022-01-13 - 来自专栏梧雨北辰的开发录
iOS11后32位应用升级
今天接受了一个改造旧项目的任务，据说项目唯独在iOS11上无法运行。这很容易就让我们想到与最近苹果iOS11放弃支持32位应用的事件有关。 一、iOS11停止支持32位的来由 苹果于2013年9月推出了iPhone 5S新手机，采用的全新A7处理器其最大特色就是支持64位运算。 因为即使64位的处理器再出色，如果还是安装32位的应用，那么64位处理的性能也不能发挥出来。 2018年1月1日开始，苹果在iOS 11系统上停止了32位应用程序的服务支持，使用iOS11系统的用户将无法再在Appstore中搜索到32位应用。 二、了解iOS的CPU架构 我们说到了32位和64位的处理器，它们本质的区别还是在于，64位多出2个寄存器，而这两个寄存器在运行32位应用的时候是关闭的，只有在运行64位应用的时候才会激活，才会用上。
1.1K30发布于 2018-04-24 - 来自专栏DrugOne
Sci. Adv. | AbEpiTope-1.0：结合AlphaFold与反向折叠提升抗体靶点预测精度
抗体药物的功能依赖于其识别抗原表位的能力。传统表位预测软件在面对天然结构未知或无抗体共晶结构的新抗原时，表现仍不理想。 抗体作为治疗性药物的核心工具，其特异性和亲和力主要由其结合抗原的“表位”所决定。因此，准确预测抗体识别的抗原表位，是疫苗设计、抗体药物开发与免疫应答机制研究中的关键任务。 预测抗体特异性需求：许多工具侧重于泛化表位预测，而非具体抗体–抗原对之间的个性化识别。 输出每个抗原残基作为表位的概率。 这一部分结果证明：AbEpiTope-1.0 具有良好的泛化能力，可拓展至尚无实验结构的新型抗原上进行表位预测与抗体筛选。
26721编辑于 2025-07-16 - 来自专栏Debian中国
JDK 11 版本时间表公布
在 JDK 10 发布两天之后，Oracle Java 平台组首席架构师 Mark Reinhold 提出了 JDK 11 GA 发布的时间表： 6 月 28 日：第一阶段开发（从主分支 fork） 7 到目前为止，包含在 JDK 11 中的 JEP 有： JEP-309：动态类文件常量 JEP-318：Epsilon：一款低开销的垃圾收集器 JEP-320：移除 Java EE 和 CORBA 模块 JEP-323：Lambda 参数的局部变量语法 JDK 11 的 早期体验版本 在 JDK 10 发布前的一个月就有了。 Reinhold 之前发了推文： JDK 11 版本包括 JEP 320（移除 Java EE 和 CORBA 模块），因此它们体积更小：减少了 9 个模块，文件大小少了 22 MB。 计划在 JDK 11 中移除的模块包括： java.xml.ws（JAX-WS，以及相关的 SAAJ 和 Web 服务元数据） java.xml.bind（JAXB） java.activation（JAF
1.3K10发布于 2018-12-21 - 来自专栏大数据文摘
11位巡逻世界的警察机器人
机器人多格重26磅，高11英寸， 还配备有9毫米格洛克手枪。它由以色列General机器人有限公司与警方反恐单位联合设计。 ◆ ◆ ◆ 11希腊难民救生机器人 ? 希腊最近开始在莱斯沃斯岛海岸部署一种救生机器人，来救助冒险横跨地中海而来的叙利亚难民。难民船往往动力不足，严重超载，并且没有配备足够的救生衣。 原文链接：https://www.wired.com/2016/07/11-police-robots-patrolling-around-world/
1.3K40发布于 2018-05-24 - 来自专栏iSharkFly
Windows 11 修改 PIN 的长度为 4 位
Windows 最近不知道抽了什么风，要求 PIN 的长度至少有 6 位。 太难了，我们就喜欢 4 位的。 其实这个是可以修改的。 然后再修改用户的 PIN 就可以设置为 4 位密码了。 https://www.ossez.com/t/windows-11-pin-4/13926
1.3K00编辑于 2022-04-25 - 来自专栏新智元
11位机器学习大牛最爱算法全解
【新智元导读】“你最喜欢的机器学习算法是什么？”这个问题有些像“你最喜欢的颜色是什么？”说不重要吧，细究起来，颇有深意。本文摘选一些机器学习大牛在 Quora 的回答，看看他们爱用的算法和原因。 Yann LeCun，Facebook AI研究总监，纽约大学教授 Backprop。 Carlos Guestrin，机器学习 Amazon 教授，Dato CEO 和看电影一样，没有哪个机器学习算法是我的唯一最爱，但有若干的算法是我最喜欢的，每个有每个的理由。下面是我最喜欢的几个算法和模型： 最简洁的：感知器算
78980发布于 2018-03-23 - 来自专栏算法channel
11位粉丝留言给我的11种入门Python与算法的方法
答 11 公众号粉丝：超 从爬虫开始入门python，后来逐渐接触了数据处理和机器学习，学习了pandas，numpy，sklearn等工具的使用。偶然看到博主的公众号，收获很大。 请以上11位同学添加管理员微信（注明：送书）；感谢以上11位同学的用心总结，希望能帮助到更多的你们。
74260发布于 2018-12-29 - 来自专栏Java项目实战
1100万大表11秒SQL优化
= te.Dwhere t.A = '' and t.B = ''and te.C = '' and t.D = 0group by t.B,t.C,te.X,te.id,te.Y分析执行计划因为te表未用到索引造成全表扫描大表总数据条数那就看看为什么没走索引 先强制走te表索引或者覆合索引效果显著但是现在在模拟生产数据后te表仍然无法走任何索引思路一：查询t表，te表，全部索引show index from tshow index from te字段索引都有为什么不走
27830编辑于 2023-06-30 - 来自专栏Java项目实战
1100万大表11秒SQL优化
因为te表未用到索引造成全表扫描 大表总数据条数 ? 那就看看为什么没走索引 怎么才能走索引 业务能不能优化 影不影响主数据？ 先强制走te表索引或者覆合索引 效果显著 ? 但是现在在模拟生产数据后te表仍然无法走任何索引 思路一： 查询t表，te表，全部索引 show index from t show index from te 字段索引都有为什么不走？
44520发布于 2021-07-22 - 来自专栏逆向技术
64位内核开发第四讲,查看SSDT表与showSSDT表
SSDt表与ShadowSSDT表的查看. 一丶SSDT表 1.什么是SSDT表 SSDT表示系统服务表,我们ring3调用的很多函数都会调用这个SSDT表 2.查看步骤 1.使用 x命令 前提需要加载好符号. x nt! 首先可以看选中的位置.这个是SSDT表的起始地址. 后面*0x11C 是这个表的个数 我们可以使用dds命令来查看这个表. dds命令可以看第三讲.关于windbg调试命令 dds Address L11C 这个命令的意思就是显示地址里面值指向的地址. 以4个字节显示. 显示如下: ? 不管是SSDT还是shodowSSDT表.都是有这个表的大小. 在32位下.函数地址是4个字节. 所以用表的大小 / 4 = 函数个数. ? 这个表中的函数都是做绘图用的.
2.5K30发布于 2019-06-14 - 来自专栏JiekeXu之路
Oracle 11g 临时表空间管理
来源 | JiekeXu之路（ID: JiekeXu_IT） 转载请联系授权 | (微信ID：xxq1426321293) 大家好，我是 JiekeXu,很高兴又和大家见面了，今天分享Oracle 11g ： SQL> create temporary tablespace temp1 tempfile '/u01/app/oracle/oradata/orcl/temp11.dbf' size 10M; shrink 操作 对临时表空间进行shrink（11g新增功能） 排序等操作使用的临时段，使用完成后会被标记为空闲，表示可以重用，占用的空间不会立即释放，有时候临时表空间会变得非常大，此时可以通过收缩临时表空间来释放没有使用的空间 收缩临时表空间是 ORACLE11g 新增的功能。 Oracle 12c 及以上版本补丁更新说明及下载方法（收藏版） Oracle 11.2.0.4 RAC 最新补丁下载（11.2.0.4.200714） 11g RAC 在线存储迁移实现 OCR 磁盘组完美替换
2.8K41发布于 2020-10-30
腾讯云开发者
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