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  • 来自专栏刷题笔记

    7-3 打印沙漏

    点这里 7-3 打印沙漏 本题要求你写个程序把给定的符号打印成沙漏的形状。

    70720发布于 2019-11-08
  • 来自专栏繁花云

    7-3笔记

    对数的定义:一般地,如果ax=N(a>0,且a≠1),那么数x叫做以a为底N的对数,记作x=logaN,读作以a为底N的对数,其中a叫做对数的底数,N叫做真数。

    56400发布于 2018-07-31
  • 来自专栏以终为始

    7-3 情人节 (15 分)

    输入按照点赞的先后顺序给出不知道多少个点赞的人名,每个人名占一行,为不超过10个英文字母的非空单词,以回车结束。一个英文句点.标志输入的结束,这个符号不算在点赞名单里。

    20820编辑于 2023-03-09
  • 来自专栏刷题笔记

    7-3 约瑟夫环 (25 分)

    本文链接:https://blog.csdn.net/shiliang97/article/details/101472782 7-3 约瑟夫环 (25 分) N个人围成一圈顺序编号,从1号开始按1、

    1.1K10发布于 2019-11-08
  • 来自专栏DrugOne

    bioRxiv | 抗体的幻想设计

    在这篇文章中,作者团队提出了一个用于抗体设计的快速、通用的深度学习框架,旨在缩短抗体库生成和抗体亲和力成熟的周期。 介绍 抗体被广泛开发并作用于治疗癌症、传染病和炎症等疾病。 抗体以更高的亲和力和特异性与抗原结合的进化过程被称为亲和力成熟。增加抗体的亲和力成熟的实验方法昂贵、复杂且耗时。而深度学习(DL)模型正在改变蛋白质结构预测、工程和设计领域的工作。 作者团队受到精确结构预测DL模型——幻想框架的启发,提出了FvHallucinator这一DL框架,以目标抗体结构为条件,设计抗体(特别是CDR环上)的序列。 此外,FvHallucinator在VH-VL界面设计了富含人类抗体复合物和治疗性抗体的氨基酸替换。最后作者还设计了一个管道,针对目标抗原虚拟筛选幻想序列。 图1 用于生成以结构为条件的抗体Fv库的FvHallucinator框架 在抗体设计的特定目的下,一个预先训练好的DeepAb模型组合被用来预测所设计的序列的结构。

    59620编辑于 2022-11-28
  • 来自专栏刷题笔记

    7-3 电话聊天狂人 (25 分)

    点这里 7-3 电话聊天狂人 (25 分) 给定大量手机用户通话记录,找出其中通话次数最多的聊天狂人。 输入格式: 输入首先给出正整数N(≤10​5​​),为通话记录条数。

    1K20发布于 2019-11-08
  • 来自专栏刷题笔记

    7-3 寻找大富翁 (50分)

    胡润研究院的调查显示,截至2017年底,中国个人资产超过1亿元的高净值人群达15万人。假设给出N个人的个人资产值,请快速找出资产排前M位的大富翁。

    1.5K10发布于 2020-06-23
  • 来自专栏以终为始

    7-3 树的同构 (25 分)

    7-3 树的同构 (25 分) 给定两棵树T1和T2。如果T1可以通过若干次左右孩子互换就变成T2,则我们称两棵树是“同构”的。

    22910编辑于 2023-03-09
  • 来自专栏AI机器学习与深度学习算法

    机器学习入门 7-3 求数据的主成分pca

    首先创建一个虚拟的测试样本,样本具有两个特征,并且两个特征之间具有相应的线性关系。这里之所以让两个特征之间具有一定的线性关系是因为对这样的两个特征进行降维效果会比较明显。

    80350发布于 2019-11-13
  • 来自专栏刷题笔记

    7-3 堆栈操作合法性 (20 分)

    本文链接:https://blog.csdn.net/shiliang97/article/details/98609302 7-3 堆栈操作合法性 (20 分) 假设以S和X分别表示入栈和出栈操作。

    1.5K20发布于 2019-11-08
  • 来自专栏DrugOne

    AntiBERTy-抗体预训练模型

    前几天,在NeurIPS 2021上,RosettaCommons的Gray Lab团队展示了抗体预训练模型AntiBERTy,相对于AntiBERTa的参数量增加了10倍,并展示了如何用于分析抗体在体内的亲和成熟轨迹以及抗体 在后续分析抗体的亲和成熟轨迹,作者采用了多示例学习(Multiple instance learning)来分类预测一条抗体序列为binder的概率。 ,其中有3位都进化出了类似的VRC01组抗体序列,通过统计冗余度,作者发现embedding空间的序列分布较为均一,这一现象可能与抗体的多轮迭代的亲和成熟有关,从而产生了足够的抗体多样性。 使用MIL model进行弱监督式学习,预测VRC01抗体的补位信息:为了验证MIL模型学到了抗体的结合性质,作者搜集了10个VRC01抗体-复合物的晶体结构。 四、AntiBERTy应用展望: 在收集了免疫血清的前提下,可以使用AntiBERTy在缺乏抗体抗原复合物的前提下,分析出抗体中的CDR的关键热点残基信息,在后续的抗体性质优化过程中可避免这类位置的突变

    1.2K20编辑于 2021-12-29
  • 来自专栏数据结构和算法

    7-3 调查电视节目受欢迎程度 (15分)

    7-3 调查电视节目受欢迎程度 (15分) 某电视台要调查观众对该台8个栏目(设相应栏目编号为1~8)的受欢迎情况,共调查了n位观众(1≤n≤1000),现要求编写程序,输入每一位观众的投票情况(每位观众只能选择一个最喜欢的栏目投票

    32210编辑于 2023-11-30
  • 来自专栏freesan44

    PTA 7-3 拼题 A 是真爱 (20 分)

    如果一个人在一段话里很多次提到 pintia,那对拼题 A 就是真爱啦~ 本题就请你检查一下给定的文字中出现了几次 pintia。

    41910编辑于 2021-12-06
  • 来自专栏DrugOne

    . | 机器学习优化抗体得到高度多样和亲和力抗体

    编译 | 曾全晨 审稿 | 王建民 今天为大家介绍的是来自Lin Li研究团队的一篇关于抗体优化的论文。治疗性抗体是一种重要且迅速增长的药物模式。 由于抗体序列的庞大搜索空间使得对整个抗体空间进行详尽评估变得不可行,因此通常从合成产生、动物免疫或人体供体中筛选相对较少的抗体来识别候选抗体。 筛选出的抗体库仅代表整体搜索空间的一小部分,导致得到的候选抗体通常结合能力较弱或存在可开发性问题。需要优化这些候选抗体以提高结合能力和其他开发特性。 由于序列空间的组合爆炸,常常采用逐步迭代的方法来优化抗体与目标分子的结合,但这样做耗时且需要大量精力来验证无功能的抗体。 现有的基于机器学习的抗体优化已经显示出在设计针对特定目标的抗体时,可以提高其结合特性,并且可以仅基于序列数据学习抗体的结合情况,而无需目标的结构。

    1.3K30编辑于 2023-09-19
  • 来自专栏freesan44

    PTA 7-3 拼题 A 是真爱 (20 分)

    如果一个人在一段话里很多次提到 pintia,那对拼题 A 就是真爱啦~ 本题就请你检查一下给定的文字中出现了几次 pintia。

    57900发布于 2021-09-10
  • 来自专栏DrugOne

    . | 评估抗体和纳米抗体用于筛选有效候选物

    单克隆抗体已成为关键的治疗药物。特别是纳米抗体,这种小型的、单域的抗体自然表达于骆驼科动物中。自2019年首个纳米抗体药物获批后迅速受到关注。然而,将这些生物制品作为治疗药物开发仍然具有挑战性。 纳米抗体(Nb),即单域抗体(VHH),自然表达于骆驼科动物中的。它们因其独特的结构特性而日益受到欢迎。 在这项工作中,作者引入了一种新的深度学习方法来解决这些挑战,使计算工程能够处理与免疫系统获得的抗体和纳米抗体序列几乎无区别的的抗体和纳米抗体序列。 在抗体治疗的应用 图 3 在抗体药物开发中,评估抗体人类可用性是一个关键步骤,目的是确保药物候选物对患者的最小风险。 天然骆驼科纳米抗体 图 4 自2019年首个基于纳米抗体的治疗药物Caplacizumab获批以来,单域抗体的发展势头更加强劲。

    48810编辑于 2024-02-23
  • 来自专栏刷题笔记

    【2020HBU天梯赛训练】7-3 阅览室

    7-3 阅览室 天梯图书阅览室请你编写一个简单的图书借阅统计程序。当读者借书时,管理员输入书号并按下S键,程序开始计时;当读者还书时,管理员输入书号并按下E键,程序结束计时。

    49030发布于 2020-06-23
  • 来自专栏智药邦

    Nat Biomed Eng:利用深度学习从抗体序列中预测抗原特异性,优化抗体药物

    测序结果显示,分别有11,300和27,539个独特的结合抗体变体和非结合抗体变体。然后,所有结合抗体变体和非结合抗体变体的序列被用来训练深度神经网络。 该算法预测了相应抗体与抗原的结合程度,当置信度大于0.5时,通过预测筛选出10.6×106个潜在的结合抗体变体;当置信度大于0.7时,通过预测筛选出6.39×106个结合抗体变体。 为了进一步证明深度学习识别新的抗体变体序列的能力,作者随机选择了42个不同的抗体变体序列,其中30个是结合抗体变体,12个是非结合抗体变体。 发现改良的抗体药物 研究人员对经过计算优化的候选抗体变体序列进行实验表征,确定了高亲和力、高表达力、热稳定性良好和去免疫化的抗体变体。经过单细胞分选,选择了55个抗体变体。 发现其中五个抗体变体显示出与曲妥珠单抗相当或更好的表达量;所有十个抗体变体的热稳定性与曲妥珠单抗相当或更好;值得一提的是抗体变体1,其表达量与曲妥珠单抗相当,热稳定性有所提高,并且与曲妥珠单抗相比,抗体变体

    4.3K51发布于 2021-06-07
  • 来自专栏智药邦

    腾讯AI Lab|自适应自回归扩散模型设计活性人源化抗体和纳米抗体

    引言 1.1 抗体和纳米抗体概述 传统抗体具有典型的Y型结构,包括两对相同的蛋白质链,每对由一个重链和一个轻链组成。 由于其高度特异性和强大结合能力,抗体在多种疾病(如癌症、自身免疫性疾病和感染性疾病)治疗中具有重要应用。 单域抗体(VHH),通常被称为纳米抗体,其结构仅包含单一的重链,但功能上与传统抗体相似。 1.2 抗体人源化的挑战 抗体的人源化是抗体药物开发中的重要环节。未经人源化的鼠源抗体在人体内可能引发人抗鼠抗体(HAMA)反应,降低抗体的治疗效果。 结果表明,HuDiff-Ab设计出的抗体在这些评估指标上与实验数据非常接近,展示了其在设计人源化抗体方面的有效性。AbLSTM得分用于评估抗体序列的稳定性,而H得分则反映了抗体的总体人源化水平。 结论 本文提出了一种基于自回归扩散模型的人源化抗体和纳米抗体设计方法HuDiff,并通过多组实验验证了其有效性和实用性。HuDiff在人源化抗体和纳米抗体方面表现出色,具有显著的应用潜力。

    1.3K10编辑于 2024-12-06
  • 来自专栏生命科学

    靶向抗体偶联药物 (ADC)——抗肿瘤 | MedChemExpress

    肿瘤靶抗原 理想的靶抗原应该是:1、在肿瘤中高表达,异质性有限,正常组织中低表达;2、尽量减少抗原脱落,以防止抗体在循环中与其结合;3、抗体应通过受体介导的内吞作用很好地被内化,并且在内吞作用期间不应被调节 抗体 理想的抗体需要对肿瘤相关抗原具有较高的特异性和亲和力,血浆中稳定性好,免疫原性低,较低的交叉反应,较长的循环半衰期和有效的内化等特点。 目前,所有临床和临床前发展的 ADCs 都含有免疫球蛋白 G (IgG) 同种型的抗体。IgGs 可分为四个亚型:IgG1、IgG2、IgG3 和 IgG4 (如图 5)。 相关服务 ADC Cytotoxin Mertansine (DM1) 是一种微管蛋白抑制剂,可以通过连接子偶联到单克隆抗体上,形成抗体偶联药物 (ADC)。 Trastuzumab deruxtecan 是一种抗人表皮生长因子受体 2 (HER2) 抗体-药物偶联物 (ADC)。由人源化抗 HER2 抗体,酶促裂解的肽接头和拓扑异构酶 I 抑制剂组成。

    1.3K20编辑于 2023-03-07
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