跟着nature communications学绘图(10) ggplot2绘制菌群分布图

❝本节来进行论文图表的复现，下面来介绍NC上一张菌种组成图的绘制方法，在作者原有的基础上做了一些细微的改动，下面来看具体案例； ❝A highly conserved core bacterial microbiota

细菌完成图

一、细菌基因组 细菌基因组按照拼接基因组完整性，可以分为草图，精细图和完成图。 一般要求基因组覆盖度达到95%以上，基因区覆盖度 98%以上，单碱基错误率在十万分之一； 精细图（fine genome）：一般采用 illumina 多个文库，通常一个小片段文库+一个大片段建库 基因组覆盖度达到 98%以上，基因区覆盖度达到 99%以上，单碱基错误率在十万分之一； 完成图 （complete genome）：也称为 perfect map；得到完整的基因组，包括完整的染色体 完成图包含物种全部遗传信息，是基因组拼接的终极目的。 二、细菌基因组为什么可以做完成图？ 三、细菌完成图方案 目前主要的细菌完成图拼接方案可以选择 illumina 测序+纳米孔测序的方案。

新品首发｜VITA GutMicrobiome：解锁肠道菌群的单细菌转录组

而传统的检测和分析方法对此并不敏感（图2）[4-6]。 图2. 临床对细菌耐药性的常规检测难以发现耐药异质性的菌群 肠道菌群中有很多菌种难以体外培养，因此纯培养后进行功能研究并不可行，只能借助于其他技术。 1、基础性能优越 在捕获细胞数为10000的人体肠道菌群样本中，VITA GutMicrobiome产品本次实测得到的中值UMI数为473，中值基因数为147（图3），和其它文献中培养单菌的单细菌转录组的较高水平相当 人体肠道微生物组样本UMI数（左）及基因数（右）小提琴图 同时，通过VITA GutMicrobiome产品测得的单细菌转录组数据，M20在样本中共鉴定得到67个不同的肠道细菌物种（图4），其中既有普雷沃氏菌属和毛螺菌属等已知肠道核心菌属的物种 其中，亚群1在两个样本中均有较多细胞，而亚群0在9时的样本中更为富集（图6右红色箭头），亚群2仅在18时样本中出现（图6右蓝色箭头）。 图6.

JS判断单、多张图片加载完成

在实际的运用中有这样一种场景，某资源加载完成后再执行某个操作，例如在做导出时，后端通过打开模板页生成PDF，并返回下载地址。 试想，如果模板中有图片，此时如何判断图片是否加载完成？ 在此之前来了解一下jquery的ready与window.onload的区别，ready只是dom结构加载完毕，便视为加载完成。 this.readyState||this.readyState=='loaded'||this.readyState=='complete'){ // 加载完成 } };}) 注： 1、IE8及以下版本不支持onload事件，但支持onreadystatechange事件； 2、readyState是onreadystatechange事件的一个状态，值为 3、以下内容省略兼容 （2）、单张图片（图片动态生成） //js var xiu = new Image() xiu.src = 'http://www.daqianduan.com/wp-content

图图细谈设计模式——单例模式

图图在为毕业设计的事忙来忙去，有时间就回来讲故事。 图图在为面试做准备，今天图图给大家细说一番单例模式。 ，也是很常见的设计模式， java中一般体现在框架的整体架构，面向接口编程，用这种思想完成某个领域的解决方案。 单例模式自身的初衷在于应用程序一启动，单例资源一次性永久驻留内存的思想， ---- package org.huey.pattern.singleton1; /** * 懒汉式单例模式 * @author 其枚举类型的单例 优点 线程安全，高效， 缺点是 没有延迟加载（可通过反编译代码看出）,还有就是只有这种方式，可以避免反射(不考虑特殊处理)和反序列化漏洞，其他的形式的单例模式做不到这一点，换句话说反射和反编译能破解其他形式的单例模式 注： 一般单例用途就是用在他的功能，只加载一次就够。

单页模板：右键一下，完成开发

「单页模板」使用指南 下载最新的预发布版微信开发者工具（版本号1.05.2203251），在编辑器中 miniprogram 下的任意路径「右键一下」，选择配置“单页模板”，即可进入单页模板功能页面。 当前单页模板已支持“签到打卡”、“积分中心”和“邀请有礼”三个模块，更多模块将陆续上线。 除了代码开发，单页模板还提供了单独的控制台。小程序开发者在微信开发者工具内开通单页模板后，可进入对应的模块控制台页面查看接入指引、导入小程序组件和查询模块提供的接口。 有奖 话题 你还希望云开发推出哪些单页模板？ 除了已上线的三种小程序常用模块 你还期待云开发推出哪些单页模板 点击下方小程序卡片参与互动话题 优质回答可获得精美微信周边礼品 实际奖品选择与发放将以官方周边存货情况为准 公测期间，欢迎开发者免费体验单页模板功能

图（2）

图的深度优先遍历 所谓图的遍历，及时对节点的访问。一个图有很多节点，如何遍历这些节点需要特定策略。 一般有两种访问策略： （1）深度优先遍历 （2）广度优先遍历 1.图的深度优先搜索（Depth First Search）DFS （1）深度优先遍历，从初始访问节点出发，初始访问节点可能有多个邻接点，深度优先遍历的策略就是首先访问第一个邻接点 例如：v1作为第一个初始访问节点，再假设的下一个节点是v2 那么就是 v1 -> v2。如果需要继续往下访问邻接点，则从v2开始作为初始节点继续往下找到v3，而并非重新回到v1。 顶点个数 int n = 5; string[] vertexs = { "A", "B", "C", "D", "E" }; //创建图对象 图的广度优先搜索（Broad First Search）BFS 类似于一个分层搜索的过程，广度优先遍历需要使用一个队列保持访问过的节点顺序，以便按这个顺序来访问这些节点的邻接节点。

腾讯云OCR助力完成快速录入工单

难的是另外一部分客户投诉，由于是门店POS点单，往往客户只有一张小票。在这种情况下，客户投诉只能提供小票，门店只能拍照或者截图，将问题上报，再由总店运营人员将问题录入系统。 但公司在这一块，采用了其他方案进行录入，但我个人推荐更优秀成熟的产品来完成这一步操作，腾讯云OCR完美匹配我的需求。 header":{},"skipSign":false,"x":656,"y":70,"stream":false},{"header":{},"skipSign":false,"x":609,"y":2, },"skipSign":false,"x":0,"y":29,"stream":false}],"words":[],"advancedInfo":"{\"Parag\":{\"ParagNo\":2} data": "14Q46AEK9KEM8" }针对更复杂的场景，最好通过ItemPolygon来确定目标位置，还有文本结合处理的情况，也需要坐标固定四、最后在上面的示例中，仅仅只需要简单的代码，就能完成对腾讯云

3D 饼环图初步完成

我顺着自己 3D 饼图（ECharts 3D 饼图近似实现）的思路想了想，发现这条路不好走…… 正发愁中，突然想到了一个新思路：之前不是把一个球拍扁再切分得到了 3D 饼图么，那我这次可以把一个类似手镯的东西拍扁 （又来了）再切分啊~ 饼环图的思路 1、为了得到一个『手镯』，先准备了一个圆（参考了圆的参数方程） 圆的参数方程 x=a+r cosθ y=b+r sinθ（θ∈ [0，2π) ） (a,b) 为圆心坐标 let startRadian = startRatio * Math.PI * 2; let endRadian = endRatio * Math.PI * 2; let midRadian = midRatio * Math.PI * 2; // 如果只有一个扇形，则不实现选中效果。 pieData（object）：饼图数据 internalDiameterRatio（0~1之间的浮点数）：内径/外径的值（默认值 1/2），当该值等于 0 时，为普通饼图 备注：饼图数据格式示意如下

单图训GAN！如何改进SinGAN？

而自从去年那篇best paper的SinGAN之后，如何使用单图训练GAN已经成为一个研究热点或趋势。 但样本的缺乏，对模型学习能力提出了更高的要求。 特别地，在给定时间里，仅训练一个阶段（固定别的）会限制不同阶段之间的交互，并且在从一个生成器阶段到下一个生成器阶段的传播如果是使用图像，而不是特征图的话，将对学习过程产生负面影响。 而另一方面，端到端地同时训练所有阶段会导致过拟合（单图数据实在太少，模型又庞杂），在这种情况下，网络会崩溃、可能直接生成输入图像。

单基因TCGA的Cox森林图

Profile Cox Analysis 输入一个你想要的基因，比如RAC3，`Select Measure for plot可以设置OS，PFI，DSS和DFI`，然后点上方的搜索，就可以看到出的图了 由于是log过的结果，所以森林图的X轴不再是HR=1为分界线了，而是以log2HR=0为分界线。。。 unicox <- read_csv("~/Desktop/RAC3_mRNA_OS_pancan_unicox.csv") ##加载csv数据 library(ggplot2) ggplot(RAC3 upper_95_log, xmin = lower_95_log), height = 0.4)+ ##设置95%CI区间，就是误差线 scale_x_continuous(limits= c(-2, 2), breaks= seq(-1, 1, 1))+ ##设置X轴范围，分割点从-1到1，以1为分界，具体分界看数字分布 geom_vline(aes(xintercept = 0))+ #以0

作业-原生js完成轮播图与悬停

这里我们先让他展示出一张图片即可，为了方便，我们直接把图片名字改为1到5 +后缀的形式，比如1.jpg，2.jpg … 并且放在与html同级，便于我们观看。 我们把列表也加上吧

• 1
• 2
• 3
那么就是一个简单的将1改变为2的过程并循环，我们如何去判断这个循环的次数呢，这里有很多种思路。 为了效果一致且方便维护，我将列表的长度作为我图片的数量即可。 } html
• 1
• 2
• 3
• 4

快速排序(动图单趟展示)

动图展示： 这里最后key移到了L和R相遇的位置，从动图中可以看到，如果我选择首元素作为基准的话，那么我们就得让R先移动，这样才能保证R和L相遇的位置比key小，这里我们来证明一下： 假设有两种情况 所以基于这两种情况的讨论，我们可以简单的得出：R和L相遇的位置肯定比Key小 注意：以上分析是建立在排升序的基础上讨论的 快速排序的实现 注意：我们上面实现的是单趟排序 接下来我们将对剩下的两个区间进行讨论 就分成了两个区间，[begin,key-1]和[key+1,end],接下来递归的思路就清晰了，我们可以不断进行分治直到区间的长度为0就是L==R还有就是L>R也是也是停止的情况 准备工作完了，接下来完成代码

单基因差异分析并绘制火山图和热图

介绍下绘制火山图和热图的方法，如何在火山图或者热图中标记特定的基因，顺便学习下EnhancedVolcano包绘制火山图。 前面已经介绍了单基因富集分析：单基因富集分析 数据准备 使用TCGA黑色素瘤的转录组数据，使用easyTCGA，1行代码下载，即可得到6种表达矩阵和临床信息，而且是官网最新的数据： library(easyTCGA ZBED2 ggplot2绘制火山图 绘制火山图需要差异分析的结果，我们再增加一列信息展示这个基因是上调、下调还是没意义。 NULL, subtitle = NULL ) plot of chunk unnamed-chunk-8 pheatmap绘制热图 首先是准备热图需要的数据，其实就是表达矩阵的可视化而已。

完成一个精美饼图，还会动！

就拿做一个小小的柱状图而言，如果不考虑最终交付质量，我们很快就能做出一个来。 这是一周前做好的一个柱状图，我不是专门做UI设计的，但我很用心的去做，觉得不错的可以直接拿我的源码： ? 这两天，我又完成一个饼状图，其最大特点2个：每个色快标记非常清晰，一看便知机型的名称、数量、占比。其次，分别展示了2016-2018三年的机型对照timeline图： ? 这些图全部使用pyecharts绘制，它最大优势API易用、可配置性极强、基本能与广泛使用的echarts打通。 image.png

【DG】DataGuard搭建-11gR2单主单备

整理一份DG的搭建流程，参考了一些教程及文档，环境是Oracle 11gR2 1+1。DG计划整理三篇：搭建、概念、维护。 pxk2 instance_name pxk2 sbdb db_unique_name pxk2 sbdb tnsname tnspxk2 tnssbdb 服务名 pxk2 pxk2 提前准备 安装数据库软件 11.2.0/db_1) ) ) 配置完成： 状态为UNKONWN代表静态监听 ? VALID_FOR=(ALL_LOGFILES,ALL_ROLES) DB_UNIQUE_NAME=pxk2' scope=both; --5.配置log_archive_dest_2,备库归档参数 'SERVICE=tnspxk2 LGWR ASYNC VALID_FOR=(ONLINE_LOGFILES,PRIMARY_ROLE) DB_UNIQUE_NAME=pxk2' db_file_name_convert

线性表（2）——单链表

LinkList(LinkNode head, int size) { super(); this.head = head; this.size = size; } } 2， list, 0, "A"); linkListDao.Insert_LinkList(list, 1, "B"); linkListDao.Insert_LinkList(list, 2, linkListDao.Print_LinkList(list); System.out.println(); //删除指定位置的值 linkListDao.RemoveByPos_LinkList(list, 2)

Grafana单图表告警邮件&面板图（Dashboard）

Grafana是一套开源的监控图表显示框架，可以很方便地和监控框架结合来显示精美的监控图，比如常见的基于Zabbix监控来显示图表，这方面本文不细说了。 单图表（panel）告警邮件 说到监控就一定会有告警邮件，否则如果要人每时每刻去关注图标是否超出指标，那也太累了。 设置完成并保存后，一旦触发异常条件，就会发邮件告警了： 如果你收到的邮件中只有图表，没有文字，那很可能是服务器上没有安装字体库，参考这里的解答：https://github.com/grafana/grafana 面板图（Dashboard）日报邮件 上面的做法有两个限制，第一是只有在出发告警的情况下才会发邮件，而且发一次后除非你处理了，否则不会继续发了。 如果我想要发面板图的日报邮件呢？ 这是一个很常见的需求，但是目前Grafana并没有直接支持。所以需要一些特别的方法。 方案之一 首先，有一个开源工具叫Grafana reporter。

Comfyui如何3秒完成PS抠图功能

前言最近在某平台看到一位摩友，根据其他摩友的追缴照片进行手绘，这不禁让我觉得非常有意思，所以我就像是不是使用stable diffusion就可以完成照片转手绘的工作。 PS抠图分离说的简单一点就是抠图，说起抠图就想到了ps，而ps常用的磁性索套、魔棒、色彩范围抠图我都学过，但是细节处理的不到位。 于是后来又去学通道抠图，各种涂涂抹抹，最后人物的头发丝抠出来就算是出师完美。我用ps的磁性套索大致抠图了一下，如图所示：除了耗费很多的时间，很多细节也很难一下子抠图成功，例如车轮就很抠出来。 2. 模型下载下载ZhengPeng7/BiRefNet模型。 总结通过 ComfyUI 和 BiRefNet 的结合，可以轻松完成高质量的图像抠图任务。

设计模式2：单例模式

单例模式单例模式属于创建型模式，⼀个单例类在任何情况下都只存在⼀个实例，构造⽅法必须是私有的、由⾃⼰创建⼀个静态变量存储实例，对外提供⼀个静态公有⽅法获取实例。 完成后释放锁，其他线程获取锁后会被判定非空拦截，直接返回单例对象synchronized同步代码块作用，防止有多个线程同时调用时，导致生成多个实例。有了同步块，每次只有1个线程能访问同步块内容。 用new创建对象时，其实是三步操作，不是原子操作：1.在堆内存申请空间2.调用构造方法，初始化对象3.将引用变量指向堆内存空间 为提高性能，处理器可能对代码执行顺序重新排序，如果运行顺序为1 3 2，