首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
    • 综合排序
    • 最热优先
    • 最新优先
    时间不限
  • 白细胞介素-10信号通路的分子机制与免疫调节功能

    基于对IL-10信号通路的系统解析,人IL-10试剂盒(HICA)已成为免疫调节机制研究及炎症相关疾病评估的重要检测工具。 二、IL-10信号通路的分子组成IL-10家族细胞因子:IL-10属于Ⅱ类细胞因子家族,其成员包括IL-10、IL-19、IL-20、IL-22、IL-24及IL-26。 STAT3是IL-10信号通路最主要的效应分子,其通过SH2结构域结合于磷酸化受体位点,继而被JAK磷酸化。 信号负向调控:IL-10信号通路受多层次负反馈机制精密控制。 四、IL-10信号通路与疾病关联自身免疫与炎症性疾病:IL-10信号功能缺陷是多种自身免疫病的重要发病机制

    15310编辑于 2026-02-24
  • 来自专栏生信菜鸟团

    肝移植IRI相关的细胞及分子机制(一)

    移植过程中参与缺血再灌注损伤的细胞和分子机制及其庞大,包括肝窦内皮细胞、肝细胞、Kupffer细胞、中性粒细胞和血小板,其参与复杂的分子通路网络,比如toll样受体的活化、调节microRNA的表达、ROS 因此,了解肝IRI的临床危险因素与调控其的细胞和分子机制的关系,对于肝移植术后更高水平的成功至关重要。这反过来也将有助于治疗的发现肝移植中的IRI -这一过程将改善终末期肝病患者的预后。 肝细胞损伤时,脂质过氧化、ROS和损伤相关分子模式(DAMPS)的释放增强了中性粒细胞和巨噬细胞的破坏活性。 在IRI被启动后,其他分子途径对其进行调节。自噬可以限制ROS的产生。 最后,粘附分子如ICAM‐1沿血管内皮细胞表达增加,以应对脑死亡,这导致免疫细胞浸润到组织中,并伴有末端器官损伤。 肝IRI的细胞机制 1.肝窦内皮细胞 肝窦内皮细胞(LSEC)排列于肝脏的血管内皮。 这导致产生免疫抑制细胞因子,如IL-10。 3.肝细胞 肝细胞在IRI中经历直接损伤。IRI时,肝细胞的呼吸链由于缺氧、营养底物传递受损和残余ATP消耗而中断。

    1.2K30发布于 2020-09-14
  • 来自专栏计算机工具

    深度学习10:Attention 机制

    Attention 的本质是什么 Attention(注意力)机制如果浅层的理解,跟他的名字非常匹配。他的核心逻辑就是「从关注全部到关注重点」。 Attention 机制很像人类看图片的逻辑,当我们看一张图片的时候,我们并没有看清图片的全部内容,而是将注意力集中在了图片的焦点上。 AI 领域的 Attention 机制 Attention 机制最早是在计算机视觉里应用的,随后在 NLP 领域也开始应用了 如果用图来表达 Attention 的位置大致是下面的样子: 这里先让大家对 Attention 有一个宏观的概念,下文会对 Attention 机制做更详细的讲解。 Attention机制每一步计算不依赖于上一步的计算结果,因此可以和CNN一样并行处理。

    1K10编辑于 2024-12-14
  • 来自专栏R基础

    分子对接—蛋白分子和小分子配体

    分子对接—蛋白分子和小分子配体记录下蛋白分子和小分子配体之间的分子对接,以HSP90AA1蛋白和川陈皮素为例1 蛋白结构下载Uniprot数据库中检索HSP90AA1蛋白(物种:人类)。 挑选最佳构象AF-P07900-F1(AlphaFold预测),下载其PDB格式文件;pubchem数据库中搜索川陈皮素(Nobiletin),获得其小分子结构的sdf格式文件。 pymol对 HSP90AA1蛋白结构进行删除水分子、删除无关配体或小分子等操作,重新输出文件为rep.pdbqt(一般下载的是AlphaFold预测的结构的话,不需要这个步骤,这里也做下);使用pymol Vina对上述文件进行分子对接。 spm_id_from=333.788.player.switch&vd_source=7e83cb2510516bdff59ccf808d022aa0&p=10可视化结果如下:cartoonsurface

    2.3K11编辑于 2024-11-30
  • 来自专栏生信菜鸟团

    综述 | 焦亡:分子机制及其在疾病中的作用

    这些分子可以作为与危险相关的分子模式(DAMPs),当被邻近细胞检测到时会引发炎症。 从机制上讲,焦亡是由gasdermin蛋白家族成员启动的,这些成员在十年前被鉴定为细胞死亡的孔形成执行者。 在此,我总结了在细胞水平上诱导焦亡的机制及其在疾病中的作用,特别关注最近对调节gasdermin激活和细胞死亡诱导的分子机制的见解。 GSDMD是一种53千道尔顿的细胞质蛋白,属于gasdermin蛋白家族,在人类中有6个成员(GSDMA、-B、-C、-D、-E和-F(也称为pejvakin, PJVK)),在小鼠中有10个成员(GSDMA1 Para_02 今天,气孔素自动抑制和孔形成机制分子水平上已经得到了很好的表征,并且已发表了由GSDMA3、GSDMD和GSDMB形成的孔的高分辨率冷冻电镜结构。 Perspectives Para_01 自从发现细胞焦亡以来,在理解诱导这种细胞死亡的分子机制及其在健康和疾病中的作用方面取得了显著进展。

    75300编辑于 2025-06-20
  • HD文章分享--肝细胞癌早期恶变的分子机制研究

    为识别癌前病变恶性转化的关键分子事件,研究者从19名乙肝病毒感染者处获取了19个无原位癌病变、癌变潜能未定的不典型增生结节(简称“癌未定DN”)及其配对非癌组织作为对照,与癌 prone DN(即与极早期肝细胞癌具演化关系的 CNA负荷显著增加:与配对DN相比,veHCC的CNA负荷(>1 Mb)显著更高,且89%的臂水平CNA(如Chr1q增益、Chr10q缺失)在veHCC中频率增加。 veHCC特有10个携带肝癌功能基因的CNA(如TSC1、RB1缺失和KRAS增益),其中部分CNA在晚期HCC中仍以相当频率存在。 免疫激活特征:与非炎症型相比,炎症型veHCC高表达趋化因子(如CXCL12、CCL2、CCL5)、HLA II类分子及免疫细胞标志物(CD3D、CD4、CD8A),且通过多重染色证实CD4+和CD8+ ,伴随PD1+CD8+ T细胞、FOXP3+CD4+ Treg细胞和PDL1+细胞浸润增加总结:本研究提出了早期肝癌发生的两种演化路径——一种以拷贝数变异积累为主导驱动恶性转化,另一种则依赖于免疫逃逸机制的建立

    9020编辑于 2026-03-31
  • 来自专栏Y大宽

    类鼻疽伯克霍尔德菌致病机制分子与细胞基础

    这种正反馈调节保证一旦该系统启动,靶基因表达快速增加[10]。 有荚膜的菌株和没有荚膜的变异株在吞噬细胞吞入率尚没有明显差异,其荚膜的抗吞噬作用主要表现在抗溶菌酶体功能上,这一现象是类鼻疽潜伏期可长达数10年之久的原因之一。 虽然人和动物的补体能够在菌体表面形成膜攻击复合物,并且完成外膜打孔,但整体而言该菌有着很强的抗补体杀灭机制。近期的研究表明,Ⅱ型O抗原是抗补体杀灭作用的分子基础。 类鼻疽与特异性人白细胞抗原(HLA)二类分子存在关联。HLA二类分子DRBI1602与急性败血型类鼻疽呈正相关,而DQA1*03与其呈负相关。 基因组信息和芯片分子技术工具的采用,该病原菌的分子和细胞致病机制的探索也初见成效。然而从Whitemore发现鼻疽伯克霍尔德菌至今,其感染发病的每一个过程仍有许多问题尚未探明。

    1.7K40发布于 2019-06-11
  • 来自专栏FreeBuf

    如何绕过Windows 10的CFG机制

    2016年6月,Theori曾发表了一篇关于MS16-063中修补了的IE漏洞分析,文中发布的exploit则仅是针对Windows7上的IE 11版本,此外由于Windows 10采用了CFG机制所以无法对 Windows 10机器进行利用。 了解CFG 控制流保护(Control Flow Guard,CFG)是微软在Windows 8.1 update 3和Windows 10下实现的一个保护机制,用以保护在汇编层下的直接调用。 Theori在其博文中讲到由于CFG机制,无法成功在Windows 7上成功利用,接下来就让我们来细究一二,然后尝试绕过它。 说了这么多,微软做了两个事情来解决这个问题,首先在Windows 10即将到来的版本中,将引进RFG机制(Return Flow Guard),防止通过损坏堆栈以获取执行控制的方式。

    2.1K60发布于 2018-02-09
  • 来自专栏生命科学

    MCE | 小分子降解剂——分子

    分子抑制剂是靶向治疗的主要类型之一,但也有它的局限性,如无法完全阻断蛋白功能,会引起的脱靶效应和副作用等。然而近年来,小分子降解剂颠覆了先前认为 “不可治疗” 靶点的观点。 什么是分子胶? 小分子降解剂通过介导泛素化连接酶与靶蛋白的识别,对靶蛋白进行降解。 理论来说,PROTAC 分子既可以作为 PROTAC 降解剂来结合和降解靶蛋白,也可以充当 “分子胶” 降解新底物。 因此,在 PROTAC 降解剂的设计中需要考虑这两种机制。 特异性降解 “核蛋白” 的分子胶 接着,我们来讲讲另外一种新型“分子胶”。

    86030编辑于 2023-03-10
  • TNF-α介导的炎症响应转录记忆现象及其分子机制研究

    一、研究背景与科学问题转录记忆是指部分基因在接受信号分子的初次刺激后,对二次刺激产生更快、更强响应的现象。这一机制在生物体适应环境变化、调控基因表达中具有重要意义。 然而,TNF-α是否能够介导转录记忆、其形成机制以及决定哪些基因具有记忆潜能的分子基础,此前尚未阐明。 三、转录记忆形成的分子机制(一)NF-κB结合区域的DNA去甲基化机制研究发现,在转录记忆建立过程中,NF-κB结合位点附近发生显著的DNA去甲基化改变。 这一特征决定了这些调控元件具备"可记忆"的分子基础。四、转录记忆的功能意义(一)响应灵敏度的显著提升研究观察到,具有转录记忆效应的基因(如CALCB)在接受二次刺激时,其响应灵敏度大幅提升。 这一发现将炎症信号调控从即时响应拓展至长期记忆层面,深化了对炎症反应动态调控机制的理解。(二)为慢性炎症治疗提供新视角转录记忆导致的信号响应灵敏度提升,可能成为慢性炎症维持的重要机制之一。

    5600编辑于 2026-02-25
  • 来自专栏百味科研芝士

    如何深入挖掘单基因分子机制发4分+纯生信文章?

    文章重点研究ESR1基因在ERα阳性乳腺癌中的分子机制,着重使用了网络分析来构建分子调控机制! 01 研究流程图 ? 02 结果 1.筛选Luminal a型乳腺癌 and Luminal B型乳腺癌的DE-miRNAs和DE-mRNAs 为了研究ERα阳性乳腺癌中ESR1介导的miRNA分子调控机制,本文选取了GSE38280 此外,在乳腺癌分子亚型分类中另外三个关键分子(PGR、ERBB2和MKI67)的表达值分别如图1D-F所示。 如表2所示,筛选出节点度≥10的前51个hub基因。为了更好的可视化,作者重新构建了前51个hub基因的亚PPI网络(图2E)。选择这些hub基因进行后续分析。 ? 图2 ? 3. 因此,本文重点研究了ESR1基因在ERα阳性乳腺癌中的分子调节机制,所用到的方法主要是网络分析(STRING+Cytoscape)。想研究单基因在某种癌症中作用机制的朋友可以借鉴一下这篇文章!

    1.5K20发布于 2020-07-20
  • 来自专栏单细胞天地

    小鼠毛发生长和休止期时皮肤中的分子机制

    测序分析 方法 使用的是Chromium Single Cell 3’kit (version1; 10X Genomics);Illumina HiSeq2500.生长期小鼠,p5w ,测3149 个细胞, 休止期, p9w 测得2618个细胞 数据 CellRanger package (v1.1.0; 10X Genomics)处理数据,数据存储在GSE129218,2020年4月1号公布, velocity图: normalization by total expression was performed after selecting genes (min_expr_counts = 10

    2.7K30发布于 2020-03-27
  • IL-6信号通路:分子机制、生物学功能与疾病关联

    3.下游信号分子:主要包括Janus激酶家族(JAKs)和信号转导与转录激活因子家族(尤其是STAT3),同时也能旁路激活Ras-MAPK、PI3K-Akt等通路。 二、IL-6信号转导的两种主要模式IL-6的信号传递主要通过两种机制,扩大了其作用的细胞范围与功能复杂性。 这一机制使得IL-6能作用于更多原本不表达IL-6R的细胞类型,在炎症放大和组织损伤中尤为关键。无论何种模式,最终均导致JAK激酶的激活,进而磷酸化并激活STAT3。 五、IL-6蛋白作为研究与干预靶点的价值鉴于IL-6通路在生理和病理中的核心地位,IL-6蛋白本身不仅是关键的效应分子,也成为重要的研究工具和药物开发靶点。 2.药物作用机制研究与筛选:作为标准配体,用于评估和筛选靶向IL-6、IL-6R或下游信号分子(如JAK激酶抑制剂)的治疗性抗体的中和活性或小分子抑制剂的阻断效力。

    29610编辑于 2026-02-06
  • 分子动力学--不同拮抗剂与5-HT1AR结合机制的研究:一项分子对接与分子动力学模拟分析

    今天继续分子动力学知识积累明确配体与靶蛋白的精确结合机制,是基于结构的药物设计实现先导化合物理性优化及新药发现的核心环节。 分子对接与分子动力学模拟可在原子层面预测结合亲和力,解析配体-蛋白相互作用模式。 研究采用常规分子对接与分子动力学模拟方法,系统解析上述六种代表性拮抗剂与5-HT₁AR的结合机制:首先通过分子对接探索六种拮抗剂的潜在结合构象,并对其药效团进行精细解析;继而开展多轮分子动力学模拟,监测不同拮抗剂结合状态下 5-HT₁AR的构象动力学变化,揭示六种拮抗剂的差异化结合机制。 结果4、六种拮抗剂通过多重结合模式与5-HT₁AR结合研究通过深入分析氢键、阳离子-π/阴离子-π及π-π堆叠相互作用,揭示了六种拮抗剂与5-HT₁AR结合的差异化分子机制。1.

    45820编辑于 2025-10-08
  • 来自专栏分子生物和分子模拟计算

    分子对接

    细胞色素P450(Cytochrome,CYP450)是一类以还原态与CO结合后在450nm处具有最高吸收峰的含血红素的单链蛋白质。 有业务需求的,请联系微信号wbf3ng或者发邮件到wbf3ng@g

    1.3K20发布于 2018-07-03
  • 来自专栏Linux驱动

    10.按键之互斥、阻塞机制(详解)

    本节目标: 学习原子操作和互斥信号量,实现互斥机制,同一时刻只能一个应用程序使用驱动程序 学习阻塞和非阻塞操作 当设备被一个程序打开时,存在被另一个程序打开的可能,如果两个或多个程序同时对设备文件进行写操作

    1.2K60发布于 2018-01-03
  • 来自专栏程序员IT圈

    10 分钟理解 JS 引擎的执行机制

    作者: ziwei3749 原文:https://segmentfault.com/a/1190000012806637 首先,请牢记2点: JS是单线程语言 JS的Event Loop是JS的执行机制 是通过的事件循环(event loop),理解了event loop机制,就理解了JS的执行机制。 3.JS中的event loop(2) 所以,上面关于event loop就是我对JS执行机制的理解,直到我遇到了下面这段代码。 步骤,结合event loop(1) event loop(2),就是更为准确的JS执行机制了 尝试按照刚学的执行机制,去分析例2: 首先执行script下的宏任务,遇到setTimeout,将其放到宏任务的 所以只有满足 (1)3秒后 (2)主线程空闲,同时满足时,才会3秒后执行该函数 如果主线程执行内容很多,执行时间超过3秒,比如执行了10秒,那么这个函数只能10秒后执行了。 觉得本文对你有帮助?

    1.9K91发布于 2018-03-05
  • 来自专栏Android 研究

    Android Handler机制10之Native的实现

    一、简述 前面的文章讲解了Java层的消息处理机制,其中MessageQueue类里面涉及到的多个Native方法,除了MessageQueue的native方法,native本身也有一套完整的消息机制 在整个消息机制中,MessageQueue是连接Java层和Native层的纽带,换而言之,Java层可以向MessageQueue消息队列中添加消息,Native层也可以向MessageQueue消息队列中添加消息 3、Native层的Looper创建和Java层的也完全不一样,它利用了Linux的epoll机制检测了Input的fd和唤醒fd。 Looper.h/Looper.cpp文件中定义了Message结构体,消息处理类,回调类,Looper类 (一)、Message结构体 代码在(http://androidxref.com/6.0.1_r10 类图.png 6 Native Looper的监听文件描述符 Native Looper除了提供message机制外,还提供监听文件描述符的方式。

    2.4K30发布于 2018-08-30
  • 来自专栏DrugAI

    . | GraphVelo:精准揭示单细胞多模态动态与分子机制

    细胞必须持续感知并适应内外环境的变化,而转录调控是其中关键机制。单细胞测序揭示了细胞状态的基因型景观,但缺乏时间动态信息。 其优势体现在: 在模拟与真实数据中均显著提高速度推断的准确性; 能够外推至全基因组,揭示关键调控因子的因果关系; 在病毒感染、多组学和空间数据中展现广泛适用性; 支持定量的调控机制解析和虚拟扰动预测。 未来的改进可进一步提升对复杂染色体事件及更高维模态数据的解析能力,从而推动对细胞状态转变机制的系统理解。

    14720编辑于 2026-01-06
  • 来自专栏全栈程序员必看

    autodock分子对接结果分析_分子对接公司

    AutoDock分子对接 一、预处理:准备受体分子 首先,用Select->Select From String工具,选择所有的水分子,再用Edit->Delete Selected Atoms去除所有的水分子 二、预处理:准备配体分子 使用Ligand下拉菜单中的Torsion Tree一系列工具,设置配体分子的可扭转键,保存配体分子。 结合能大小比较:原配的小分子<相似体系的小分子<无关的小分子 接下来,对上述配体结合能进行聚类,依旧可以明显发现上述的结果。 图一是原配的小分子,图二是相似体系的配体小分子,图三图四是完全无关的小分子。原配的小分子结合能是最小的,然后是相似体系的小分子结合能,结合能最大的是无关的小分子体系。 而且可以看出来图三和图四比起真正的结合位点图一要偏移了很多,其可以改进的地方有两点: GA遗传算法计算次数较少,一共只采样10次,可以在参数设置的时候选择更大GA Runs和Population Size

    3.8K22编辑于 2022-10-01
领券