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  • 来自专栏Deep learning进阶路

    8-3 图的遍历

    8-3 图的遍历 和树的遍历类似,图的遍历也是从某个顶点出发,沿着某条搜索路径对图中所有顶点各做一次访问。 若给定的是连通图,则从图中任一顶点出发顺着边可以访问到该图中所有的顶点。

    54710发布于 2019-07-02
  • 来自专栏mysql

    hhdb数据库介绍(8-3)

    1.在192.168.190.186的服务器上执行ssh-keygen,连续按3次回车,完成生成公钥和私钥,其中id_rsa为私钥,id_rsa_pub为公钥,到/root/.ssh目录下可看到刚刚命令生成的私钥和公钥文件。

    31510编辑于 2025-03-10
  • 来自专栏信数据得永生

    django 1.8 官方文档翻译: 8-3 点击劫持保护

    点击劫持中间件和装饰器提供了简捷易用的,对点击劫持的保护。这种攻击在恶意站点诱导用户点击另一个站点的被覆盖元素时出现,另一个站点已经加载到了隐藏的frame或iframe中。

    68020编辑于 2022-11-27
  • 来自专栏AI机器学习与深度学习算法

    机器学习入门 8-3 过拟合与欠拟合

    本系列是《玩转机器学习教程》一个整理的视频笔记。通过之前的小节了解了多项式回归的基本思路,有了多项式就可以很轻松的对非线性数据进行拟合,进而求解非线性回归的问题,但是如果不合理的使用多项式,会引发机器学习领域非常重要的问题过拟合以及欠拟合。

    1.3K60发布于 2019-12-25
  • 免疫学实验】放射免疫法、酶联免疫吸附法和竞争抑制分析

    放射免疫法(RIA)和酶联免疫吸附法(ELISA)是利用抗体和抗原直接结合的检测方法,两者原理相同,但其检测的方式不同。 放射免疫分析常用于测量血液和组织液中的激素水平,而酶联免疫吸附法常用于病毒诊断,如检测人类免疫缺陷病毒(HIV)引发的艾滋病。 这类检测的另外一种方法是以标记的抗免疫球蛋白抗体作为RIA 或ELISA 的二抗,将未标记的抗体与未标记的抗原涂层板结合,因为每个未标记的抗体上能够结合两个分子以上标记的抗免疫球蛋白抗体,所以使用这种二抗放大了信号 图1 酶联免疫吸附法(ELISA)的原理:为了检测抗原A,纯化的抗原A特异性抗体与酶发生化学反应。将待测样品涂布于塑料孔表面,非特异性结合;塑料上残留的黏性位点被添加的无关蛋白(未显示)封闭。 在此基本方法基础上的改进版可检测未知样本中的抗体或抗 捕获酶联免疫吸附法(capture ELISA)或夹心酶联免疫吸附法(sandwich ELISA)是ELISA 的一种改良方法,常被用于检测细胞因子等分泌性产物

    24210编辑于 2025-12-29
  • 免疫学笔记】免疫原、抗原与佐剂:免疫应答的基础

    免疫应答与抗原 免疫应答:免疫系统可对病原体抗原或简单非活性抗原产生应答,表现为释放细胞因子、特异性抗体(体液免疫)及诱导效应T细胞(细胞免疫)。 免疫原(Immunogen):指能刺激机体免疫细胞活化、增殖、分化并产生免疫效应物质(抗体或致敏淋巴细胞)的物质。 关系:所有免疫原都是抗原,但并非所有抗原(如半抗原)都是免疫原。 免疫接种与抗原递呈 免疫接种:有目的地诱导免疫应答称为免疫接种,抗原的注入途径、剂量和形式会影响免疫应答的类型和强度。 口服/鼻内:可引起肠道局部抗体应答,但同时可能诱导系统性免疫耐受,防止食物过敏。 佐剂的作用机制 佐剂(Adjuvant):是一种非特异性免疫增强剂,能增强抗原的免疫原性或改变免疫应答类型。 免疫应答的监测与抗血清 在免疫诱导过程中,通过检测个体的免疫产物(如血清中的抗体、细胞因子,或脾脏、外周血中的T细胞)来跟踪免疫应答。血清是血液凝固后的液体部分,经特定抗原免疫后的血清称为抗血清。

    41410编辑于 2025-12-21
  • 肿瘤免疫逃逸

    尽管机体的固有免疫和适应性免疫具有识别和清除肿瘤细胞的免疫监视机制,但仍难以阻止肿瘤的发生和发展。 “清除”阶段代表的是传统的肿瘤免疫监视,是指免疫系统通过多种途径识别并杀死肿瘤细胞的过程;“相持”阶段是发生在免疫系统对肿瘤细胞不完全清除后的一段潜伏期:“逃逸”阶段是指新的肿瘤细胞经免疫压力选择后能够脱离免疫系统的限制并泛滥性生长的阶段 早期研究表明:致瘤病毒诱发的肿瘤免疫原性最强,化学致癌物诱导的肿瘤免疫原性次之,自发性肿瘤的免疫原性最弱。 由于肿瘤细胞之间也存在免疫原性的差异,免疫原性较强的肿瘤细胞可以诱导有效的抗肿瘤免疫应答而易被清除,但是,免疫原性相对较弱的肿瘤细胞则能逃脱免疫系统的监视而选择性地增殖。 这就是许多有免疫功能的宿主不能有效清除体内有免疫原性的肿瘤的主要原因。研究发现将B7基因转入弱或无免疫原性的肿瘤细胞中是不能激发免疫反应的,这说明肿瘤免疫原性是共刺激分子发挥作用的前提。

    54010编辑于 2024-02-28
  • 免疫学实验】揭秘蛋白互作:免疫沉淀与免疫共沉淀

    今天,我们就来聊聊两种核心的“打捞”技术:免疫沉淀(Immunoprecipitation, IP)和免疫共沉淀(Co-Immunoprecipitation, Co-IP)。 一、 免疫沉淀(IP):精准捕获目标蛋白 免疫沉淀是利用抗体从复杂的混合物中分离特定蛋白质的技术。 1. 免疫沉淀与 SDS-PAGE 分析 免疫沉淀法用于从细胞裂解液中富集特定抗原。细胞可通过 ³⁵S-蛋氨酸代谢标记(标记所有新合成蛋白)或 表面碘化/生物素化(仅标记膜蛋白)进行示踪。 最后通过放射自显影(或显色)确定蛋白位置 三、 免疫共沉淀(Co-IP):验证蛋白互作 如果说免疫沉淀是“抓单个”,那么免疫共沉淀就是“抓团伙”。 总结 免疫沉淀技术不仅帮助我们纯化和鉴定蛋白质(分子量、等电点),更是通过免疫共沉淀技术,成为了揭示蛋白质之间物理相互作用的金标准实验方法。

    32810编辑于 2025-12-29
  • 来自专栏用户7627119的专栏

    免疫组库

    免疫组库(immune repertoire, IR):是指某个体在特定时间点其循环系统中所有功能多样性B淋巴细胞和T淋巴细胞的总和。 免疫组库分析:通过分析决定B细胞受体(BCR)或T细胞受体(TCR)多样性的互补决定区(CDR区),全面评估免疫系统的多样性,深入挖掘免疫组库与疾病的关系。 ? 应用领域:免疫组库中每一种免疫蛋白彼此间结构差异很小,但亚型种类繁多,正是这种多样性对健康的维护起着至关重要的作用;免疫蛋白的亚型越多,越能有效抵抗病原体。 正因为如此,免疫组库在肿瘤研究、移植和免疫重建、自身免疫性疾病、感染性疾病、抗体开发、用药及疫苗评估等多个方面均有重要的应用价值。 单细胞测序揭示新型模式 ? 抗体在免疫应答反应中发挥着至关重要的作用,抗体的多样性是抗体能够抵御各种各样入侵病原体的关键所在。

    1.6K30发布于 2020-08-06
  • 肿瘤免疫与单细胞、空间、外显子和免疫疗法

    这一篇我们继续学习基础知识其实提到的组学里面,最主要的就是肿瘤免疫(tumor immunology)。机体抗肿瘤免疫应答的机制包括固有免疫和适应性免疫两个方面。 、肿瘤免疫和自身免疫,并与过敏现象有关。 二、适应性免疫应答(一)适应性免疫的概念和特点适应性免疫(adaptive immunity)是机体特异性识别和选择性清除外来病原物的免疫反应,是抗肿瘤免疫应答的重要环节。 一方面,固有免疫通过MHC分子将外来抗原呈递给适应性免疫细胞,从而启动了适应性免疫应答,并影响了其强度与持续时间;另一方面,适应性免疫释放的多种因子也反过来募集了更多的免疫细胞,并影响固有免疫细胞的活化程度 这两种免疫系统的共同作用实现了机体抵御外来病原物的自我保护目的。(二)适应性免疫细胞对肿瘤的识别与免疫效应1.特异性抗肿瘤细胞免疫 在抗肿瘤细胞免疫中,T细胞介导的特异性免疫应答反应起着重要作用。

    53510编辑于 2024-02-27
  • 来自专栏mwangblog

    免疫算法简单介绍

    免疫算法的基本步骤: 抗原识别。输入目标函数和各种约束作为免疫算法的抗原。 初始抗体生成。随机生成初始抗体种群。 亲和力计算。计算抗体的适应值。 免疫处理。 免疫处理包括免疫选择、克隆、变异和抑制。 免疫选择:根据抗体的亲和力选出亲和度较高的抗体。 克隆:对选出的亲和力较高的抗体进行复制。 变异:对克隆得到的个体进行交叉、变异操作,使其亲和力发生改变。 将免疫选择的抗体和免疫抑制后的抗体组成一个集合,保留其中亲和度较高的抗体,使这些抗体进入新的种群。新的种群中不足的部分随机生成,以增加多样性。 免疫算法流程图: ?

    1.6K10发布于 2018-12-21
  • 来自专栏单细胞天地

    头颈癌免疫状况研究

    Abstract 本文研究了HPV+/HPV- (Human Papillomavirus) 的Head and Neck Squamas Cancer (HNSCC) 患者的肿瘤免疫微环境,发现这两类患者中 免疫疗法为HNSCC的一个新疗法,但只有20-30%患者在PD-1/PD-L1的临床试验中获益,且原因不明。因此,有必要研究HNSCC的免疫微环境,从而为免疫治疗提供可能靶点。 ?

    82520发布于 2020-03-27
  • 新突破 | 治愈自身免疫性疾病?序贯免疫疗法:免疫系统也能 开机重启! | MedChemExpress (MCE)

    前段时间有个关于自身免疫性疾病的小新闻......But!咱们今天不聊这个。咱们聊聊自身免疫性疾病是否可治愈? 哎嘿~有一新突破:序贯免疫疗法,让你的免疫系统 "开机重启"! 01了解自身免疫自身免疫是指生物体对自身健康细胞、组织或成分的免疫反应,可能导致重要器官不可逆转的损害。 然而,免疫系统可能以两种主要方式发生故障:(一) 通过免疫缺陷病,即免疫系统的一个或多个组成部分无法保护身体免受病原体的侵害;(二) 通过自身免疫性疾病[1]。 当中枢和外周耐受机制无法阻止对自身抗原或无害抗原的免疫反应时,免疫系统的免疫记忆作用会引发持续炎症,为过敏和自身免疫的长期缓解和治疗提供了障碍。 所以序贯免疫疗法的第二步是重置免疫系统,其主要目标是通过消除病理性免疫记忆细胞来减少免疫系统的异常反应,从而恢复免疫系统的正常功能[3]。

    39500编辑于 2024-11-04
  • 免疫笔记】胸腺的“衰老剧本”—从发育到免疫老化的秘密

    胸腺——这个曾经被学界“轻视”的器官,如今成了免疫老化研究的“C位”。 现在看这话简直是“大型真香现场”——胸腺根本不是“意外”,而是T细胞发育的“命运之地”:它负责筛选能识别外来抗原、同时不攻击自身的T细胞,是免疫耐受和免疫功能的“起跑线”。 六、 naive T细胞:免疫老化的“预测指标” 通过分析外周血里的初始T细胞(naive T细胞),可以预测“免疫年龄”。 比如: •健康人群的实际年龄和免疫年龄基本匹配; •百岁老人的免疫年龄比实际年龄“年轻”(这可能是他们长寿的原因之一); •乙肝、HIV患者,以及红斑狼疮、重症肌无力患者的免疫年龄,比实际年龄“老很多” 相当于给免疫系统装了个“体检仪”,能提前预警免疫老化相关的疾病。

    28210编辑于 2025-12-24
  • 来自专栏医学和生信笔记

    免疫浸润结果可视化

    免疫浸润结果可视化 在之前的推文中我们介绍了2行代码实现9种免疫浸润方法,今天给大家介绍下常见的免疫浸润结果的可视化。 就以大家最常见的cibersort为例进行介绍。 首先大家要对每种免疫浸润方法的结果有一个大体的认知,比如cibersort的结果是各种免疫细胞在样本中的比例,所以一个样本中所有的免疫细胞比例加起来总和是1! 但是ssGSEA就不是这样了。 scale_color_manual(values = palette4,name=NULL) plot of chunk unnamed-chunk-24 除此之外也是可以添加分组,画热图等,其他的免疫浸润结果也是同样的可视化思路

    1.9K30编辑于 2023-08-30
  • 来自专栏医学和生信笔记

    WGCNA实战:识别免疫相关lncRNA

    前面的推文给大家介绍了3种识别免疫相关lncRNA的方法:免疫相关lncRNA的识别 今天再给大家介绍下如何使用WGCNA识别免疫相关lncRNA,也算是WGCNA的实战教程。 基因和性状的相关性:gene significance GS 基因和模块的相关性:module membership MM 选择我们感兴趣的性状(临床信息),这里是cluster,也就是根据ssGSEA免疫浸润的结果而得到的分子亚型 ,所以只要提取和这个性状信息相关的基因,就得到了免疫相关lncRNA! 那加上今天介绍的识别免疫相关lncRNA的方法,就一共有4种方法了! 这么多方法又有选择困难症了?天真,小孩子才做选择,大人都是全都要!

    1.2K30编辑于 2023-08-30
  • 来自专栏医学数据库百科

    ImmuCellAI | 免疫浸润计算工具

    在利用 RNA-seq 数据来进行免疫浸润计算方面,已经有很多的算法可以进行分析,我们在 [[免疫算法原理]] 当中也进行了总结。 另外如果是想要分析 TCGA 的免疫浸润情况的话,也可以使用 [[TIMER2 TCGA-免疫浸润评估数据库]] 以及 [[GEPIA2021-TCGA免疫细胞分析数据库]]。 的算法来进行免疫细胞计算的。 这类的算法主要是通过每一个免疫细胞特征基因的表达来进行免疫浸润评分的。默认的 ImmuCellAI 是以这些基因作为每个免疫细胞的 marker 基因的。 除了要计算免疫细胞评分,如果还想观察免疫细胞在不同分组的区别以及和免疫检查点封锁(Immune checkpoint blockade, ICB)的关系。可以进行额外的勾选。

    9.2K50编辑于 2021-12-04
  • 来自专栏作图丫

    免疫相关数据资源:ImmPort

    导语 GUIDE ╲ ImmPort项目是收集、整理、共享免疫学相关研究的资源,由为不同的生命科学研究者社区提供科学数据的归档和交换方面的先进信息技术支持,并作为研究和临床数据的长期、可持续的归档。 Institutes of Health,NIH)、美国过敏症和传染病研究所(National Institute of Allergy and Infectious Diseases,NIAID)和过敏、免疫和移植部 ③加速科学发现,同时扩大免疫学研究所有领域的科学数据的价值。④促进重要发现的快速可用性,使新的发现可供研究界进一步分析和解释。 ⑤提供分析工具,以推进基础和临床免疫学的研究 在NIAID/DAIT的支持下,ImmPort项目为不同的生命科学研究者社区提供科学数据的归档和交换方面的先进信息技术支持,并作为研究和临床数据的长期、可持续的归档 如①Gene Lists提供了免疫基因列表 ②ImmuneRegulation 识别感兴趣的免疫系统基因的调节因子 ③Immcantation framework 为高通量B细胞和T细胞受体序列测序

    3.9K31编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏生物信息云

    Cell | SnapShot | 癌症免疫编辑

    在此过程中,肿瘤细胞在三个不同阶段与人体免疫系统相互作用,称为消除,平衡和逃逸(Dunn等,2004)。免疫编辑的早期研究集中于预先存在的对肿瘤的天然免疫应答如何主动塑造肿瘤细胞库。 随着试图“诱导”抗肿瘤免疫应答的免疫疗法的出现,在这些治疗的肿瘤中可以发生另一轮免疫编辑(Schreiber等,2011)。 在这个SnapShot中,我们回顾了内源性免疫编辑(EI)和免疫治疗诱导的免疫编辑(III)的这两个阶段。出于此SnapShot的目的,由于检查点抑制,我们将主要关注免疫治疗。 我们还将描述免疫编辑过程的肿瘤细胞内在和肿瘤细胞外在(例如,肿瘤微环境)特征。 内源性免疫编辑 EI作用于一个新形成的肿瘤细胞亚群,其可能表现出广泛的免疫原性。 由于肿瘤细胞表达新抗原、自然杀伤(NK)细胞和NK-T细胞的配体,或分泌趋化因子以招募适应性免疫细胞进行破坏,具有高水平免疫原性的肿瘤细胞会被天然免疫系统消除。

    1.1K10编辑于 2022-12-16
  • 来自专栏生信技能树

    任何细胞都有免疫特征

    关键是看如何定义免疫特征,比如kegg数据库里面的就有很多免疫特征相关的功能基因列表,首先它区分成为了如下所示的7个大类: 1. Metabolism 2. Drug Development 然后细分的时候就可以看到两个免疫相关的亚类: 5.1 Immune system 6.6 Immune disease 如下所示: 两个免疫相关的亚类 详见kegg 如果你感兴趣这些基因集,可以自己去阅读文献拿到Supplementary Table S4,然后针对这些通路去任意单细胞转录组数据集里面打分,肯定不会是这些免疫基因集仅仅是在免疫相关细胞亚群有活性。 重点是第二层次降维聚类分群里面的 decidual stromal cell和免疫细胞的亚群,如下所示: 其中可以看到,免疫细胞亚群细分的时候有一个iDSC, immune-featured decidual 但是呢,如果把这一群细胞(iDSC)放在所有的DSC里面它又是无法融入进去,而且它的免疫打分又过高。所以作者做了个层次聚类,蛮直观的展示了这个iDSC其实是与DSC更加接近,如果是跟免疫细胞相比。

    45910编辑于 2024-01-04
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