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免疫浸润结合5+分新思路！
作者运用高通量T细胞受体(TCR)β测序技术与免疫组化的方法 ，对比了接受CRT（化疗）前后直肠癌患者TCR库复杂性与密度的变化，发现TCR多样性指数和CD8+ TIL密度分别与CRT的良好预后有关。 T细胞介导的适应性免疫反应在肿瘤进展中起着重要作用，较高密度的CD8+ 肿瘤浸润淋巴细胞(TILs) 已被报道与直肠癌患者较好的预后有关。 这些发现暗示了免疫学过程与TILhi / DIhi肿瘤的CRT敏感性相关。 ? 5、CRT前后TCR库的变化 最近研究表明，将肿瘤细胞暴露于辐射中会引起新抗原的产生和对肿瘤细胞免疫过程的激活。 而且，在CRT中，多样性指数的增加或减少都不显著影响患者预后生存(图5b) 。 )；同时，Morisita-Horn指数较高的患者表现出较短的RFS，这可能表明CRT期间TCR库的改变程度是一个重要的预测预后的因素（图5d）。
90420发布于 2020-12-08 - 来自专栏医学数据库百科
两篇5+免疫浸润+少量实验文献介绍
写在前面 关于利用RNA-seq的数据进行免疫浸润的评价，我们在TIMER数据库介绍的时候提到过。基本上就是提供RNA-seq的数据。然后使用制定的算法来就可以获得每个样本免疫细胞的得分了。 ? 基于多数据集的免疫浸润评估 随着这类免疫浸润相关文章发表的越来越多，我们在分析的时候，使用单一的TCGA数据库已经很难说发表了。这个时候其实就需要增加数据集了增加自己结果的准确性。 ? ? 的这个文章就是基于多个网络数据集来进行免疫浸润的分析。在利用公共数据库得到候选的免疫细胞之后，通过自己医院的数据来进行进一步的验证。进一步来确定免疫细胞是否有差异。 免疫相关特征模型的评估 ?的文章在分析的入手点就是来评价数据的免疫浸润情况。?这个文章则是显出基因入手。 ? 所以如果想做免疫方面的文章的，可以参考这样来做的。
75940发布于 2020-09-30 - 来自专栏百味科研芝士
甲基化结合免疫浸润如何打造5分+SCI
NEFM表达水平与巨噬细胞和中性粒细胞浸润水平正相关（图5a和5c）。 NEFM表达水平与CD8+ T细胞，CD4+ T细胞浸润水平正相关，而TISIDB数据库中与活化CD8+ T细胞，活化CD4+ T细胞浸润水平负相关（图5a和5c）。 TIMER基因模块中，NEFM表达水平与CD8+ T细胞，巨噬细胞，中性粒细胞和树突状细胞浸润水平正相关，而与B细胞浸润水平和肿瘤纯度负相关（图5b和5d）。 图5 NEFM表达水平/DNA甲基化与免疫浸润的相关性 7. 表4 NEFM表达水平/NEFM DNA甲基化与免疫调节因子的相关性 此外，NEFM表达水平与MHC相关分子B2M和HLA-DPB1相关性较差（表5）。 ?
95030发布于 2021-07-12 白细胞介素-5（IL-5）的分子特性与免疫调节功能
IL-5通过特异性调控嗜酸性粒细胞的生成、活化与趋化，参与机体抗寄生虫免疫及过敏反应过程，并在黏膜免疫中通过调节B细胞功能促进IgA合成，构成免疫稳态维持的重要调节节点。 基于对IL-5分子机制的深入理解，针对人IL-5的检测需求催生了相应免疫分析工具的开发，其中人IL-5试剂盒（HICA）即为核心应用之一。 三、IL-5的免疫生物学功能（一）嗜酸性粒细胞谱系的定向调控IL-5是嗜酸性粒细胞分化、扩增与功能激活最为特异性的细胞因子，其作用机制涵盖以下层面：1.促进骨髓定向分化：IL-5可驱动骨髓造血干细胞向嗜酸性粒细胞谱系分化 ⁺）B细胞类别转换，并促进其进一步分化为分泌IgA的浆细胞；2.协同调节效应：IL-5可与IL-4、IL-6等细胞因子协同作用，增强B细胞免疫球蛋白合成，尤其是IgA型抗体的产生效率，从而维系黏膜局部免疫屏障功能 在黏膜免疫研究领域，人IL-5试剂盒（HICA）已被广泛应用于各类实验模型中IL-5表达水平的精确定量分析。
9110编辑于 2026-02-24【免疫学实验】放射免疫法、酶联免疫吸附法和竞争抑制分析
放射免疫法（RIA）和酶联免疫吸附法（ELISA）是利用抗体和抗原直接结合的检测方法，两者原理相同，但其检测的方式不同。 放射免疫分析常用于测量血液和组织液中的激素水平，而酶联免疫吸附法常用于病毒诊断，如检测人类免疫缺陷病毒（HIV）引发的艾滋病。 这类检测的另外一种方法是以标记的抗免疫球蛋白抗体作为RIA 或ELISA 的二抗，将未标记的抗体与未标记的抗原涂层板结合，因为每个未标记的抗体上能够结合两个分子以上标记的抗免疫球蛋白抗体，所以使用这种二抗放大了信号 图1 酶联免疫吸附法（ELISA）的原理：为了检测抗原A，纯化的抗原A特异性抗体与酶发生化学反应。将待测样品涂布于塑料孔表面，非特异性结合；塑料上残留的黏性位点被添加的无关蛋白（未显示）封闭。 在此基本方法基础上的改进版可检测未知样本中的抗体或抗 捕获酶联免疫吸附法（capture ELISA）或夹心酶联免疫吸附法（sandwich ELISA）是ELISA 的一种改良方法，常被用于检测细胞因子等分泌性产物
24210编辑于 2025-12-29【免疫学笔记】免疫原、抗原与佐剂：免疫应答的基础
️ 免疫应答与抗原 免疫应答：免疫系统可对病原体抗原或简单非活性抗原产生应答，表现为释放细胞因子、特异性抗体（体液免疫）及诱导效应T细胞（细胞免疫）。 免疫原（Immunogen）：指能刺激机体免疫细胞活化、增殖、分化并产生免疫效应物质（抗体或致敏淋巴细胞）的物质。 关系：所有免疫原都是抗原，但并非所有抗原（如半抗原）都是免疫原。 免疫接种与抗原递呈 免疫接种：有目的地诱导免疫应答称为免疫接种，抗原的注入途径、剂量和形式会影响免疫应答的类型和强度。 口服/鼻内：可引起肠道局部抗体应答，但同时可能诱导系统性免疫耐受，防止食物过敏。 佐剂的作用机制 佐剂（Adjuvant）：是一种非特异性免疫增强剂，能增强抗原的免疫原性或改变免疫应答类型。 免疫应答的监测与抗血清 在免疫诱导过程中，通过检测个体的免疫产物（如血清中的抗体、细胞因子，或脾脏、外周血中的T细胞）来跟踪免疫应答。血清是血液凝固后的液体部分，经特定抗原免疫后的血清称为抗血清。
41410编辑于 2025-12-21- 来自专栏人工智能与演化计算成长与进阶
不完全免疫算法简介IMADE--AIS学习笔记5
多目标优化 An immune MOP algorithm with DE inspired recombination “参考文献 An immune multi-objective optimization algorithm with differentialevolution inspired recombination, Applied Soft Computing 29 (2015) 395–410 摘要 According to the regularity of continuous mu
50140发布于 2020-08-14 - 来自专栏全栈程序员必看
shift键粘滞了怎么办_5shift后门清免疫
简介 沾滞键的目的是为了帮助那些按键有困难的人设计的，在Windows系统下连续按5次shift键后，系统就会执行system32下的sethc.exe，也就是启用了沾滞键。 :\Windows\System32目录下存在sethc.exe文件，正常情况下会执行sethc.exe文件，但是当我们将cmd.exe文件把sethc.exe文件通过更改名称给覆盖掉，当我们连续按下5次
1.9K20编辑于 2022-09-30 肿瘤免疫逃逸
尽管机体的固有免疫和适应性免疫具有识别和清除肿瘤细胞的免疫监视机制,但仍难以阻止肿瘤的发生和发展。 早期研究表明:致瘤病毒诱发的肿瘤免疫原性最强，化学致癌物诱导的肿瘤免疫原性次之,自发性肿瘤的免疫原性最弱。 由于肿瘤细胞之间也存在免疫原性的差异，免疫原性较强的肿瘤细胞可以诱导有效的抗肿瘤免疫应答而易被清除，但是，免疫原性相对较弱的肿瘤细胞则能逃脱免疫系统的监视而选择性地增殖。 这就是许多有免疫功能的宿主不能有效清除体内有免疫原性的肿瘤的主要原因。研究发现将B7基因转入弱或无免疫原性的肿瘤细胞中是不能激发免疫反应的,这说明肿瘤免疫原性是共刺激分子发挥作用的前提。 3.趋化因子 趋化因子及其受体家族在肿瘤免疫中的作用主要有以下几点:①募集免疫细胞进入肿瘤组织调控机体免疫功能，如C2、 CCL5能募集髓系细胞,CXCL9、CXCL10能够趋化T细胞,CCL19、CCL20
53910编辑于 2024-02-28- 来自专栏百味科研芝士
令人眼前一亮的5分+免疫浸润新套路！
作者通过对宫颈鳞状细胞癌患者的肿瘤相关白细胞进行研究，发现了其与免疫微环境，免疫治疗以及预后等方面的联系，并将研究拓展到泛癌层面，为癌症分型以及靶向治疗提供了新的思路。 图2a.LS评分与免疫及损伤修复相关过程的联系 ? 进行生存分析后作者发现，高LS组的病人预后显著差于低LS组（图5a）。此外，高LS组肿瘤相对于低LS组的MDSC signature评分显著更高（图5b）。 图5a.泛癌队列中高低LS组与预后；图5b.泛癌队列中高低LS组与MDSC signature；图5c.泛癌队列中高低LS组与免疫相关过程 对泛癌队列的生存分析提示在肾上腺皮质癌，膀胱尿路上皮癌，头颈鳞状细胞癌 为了验证这种差异，作者又从TCGA数据库中获取了更多CESC患者的相关资料，并使用LS评分代替白细胞计数，观测到了高低LS组的基因表达、免疫微环境、免疫及损伤修复相关通路、细胞因子、免疫治疗疗效、预后等方面都存在差异
2K40发布于 2020-11-04 【免疫学实验】揭秘蛋白互作：免疫沉淀与免疫共沉淀
今天，我们就来聊聊两种核心的“打捞”技术：免疫沉淀（Immunoprecipitation, IP）和免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation, Co-IP）。 一、 免疫沉淀（IP）：精准捕获目标蛋白 免疫沉淀是利用抗体从复杂的混合物中分离特定蛋白质的技术。 1. 免疫沉淀与 SDS-PAGE 分析 免疫沉淀法用于从细胞裂解液中富集特定抗原。细胞可通过 ³⁵S-蛋氨酸代谢标记（标记所有新合成蛋白）或 表面碘化/生物素化（仅标记膜蛋白）进行示踪。 最后通过放射自显影（或显色）确定蛋白位置 三、 免疫共沉淀（Co-IP）：验证蛋白互作 如果说免疫沉淀是“抓单个”，那么免疫共沉淀就是“抓团伙”。 总结 免疫沉淀技术不仅帮助我们纯化和鉴定蛋白质（分子量、等电点），更是通过免疫共沉淀技术，成为了揭示蛋白质之间物理相互作用的金标准实验方法。
32810编辑于 2025-12-29- 来自专栏用户7627119的专栏
免疫组库
免疫组库（immune repertoire, IR）：是指某个体在特定时间点其循环系统中所有功能多样性B淋巴细胞和T淋巴细胞的总和。 免疫组库分析：通过分析决定B细胞受体（BCR）或T细胞受体（TCR）多样性的互补决定区（CDR区），全面评估免疫系统的多样性，深入挖掘免疫组库与疾病的关系。 ? 应用领域：免疫组库中每一种免疫蛋白彼此间结构差异很小，但亚型种类繁多，正是这种多样性对健康的维护起着至关重要的作用；免疫蛋白的亚型越多，越能有效抵抗病原体。 正因为如此，免疫组库在肿瘤研究、移植和免疫重建、自身免疫性疾病、感染性疾病、抗体开发、用药及疫苗评估等多个方面均有重要的应用价值。 单细胞测序揭示新型模式 ? 抗体在免疫应答反应中发挥着至关重要的作用，抗体的多样性是抗体能够抵御各种各样入侵病原体的关键所在。
1.6K30发布于 2020-08-06 肿瘤免疫与单细胞、空间、外显子和免疫疗法
5.yδT细胞尽管yδT细胞表面表达与aβ T细胞膜相类似的yδTCR,但其多样性却十分有限，并且其抗原识别无需MHC分子的辅佐,采取 B细胞受体样的直接识别方式识别其配体或抗原。 一方面，固有免疫通过MHC分子将外来抗原呈递给适应性免疫细胞，从而启动了适应性免疫应答，并影响了其强度与持续时间;另一方面，适应性免疫释放的多种因子也反过来募集了更多的免疫细胞，并影响固有免疫细胞的活化程度 这两种免疫系统的共同作用实现了机体抵御外来病原物的自我保护目的。(二)适应性免疫细胞对肿瘤的识别与免疫效应1.特异性抗肿瘤细胞免疫 在抗肿瘤细胞免疫中，T细胞介导的特异性免疫应答反应起着重要作用。 常见的区分B淋巴细胞与T淋巴细胞的CD分子标记CD标记功能B细胞TH细胞TC细胞CD2黏附分子，信号转导-++CD3TCR 的信号转导组分-++CD4结合 MHCI类分子，信号转导-+CD5ND（not ;②主要组织相容性抗原 MHCII,使B细胞能够发挥抗原提呈细胞的作用;③CR1(CD31)和CR2(CD21),补体受体:④Fcγ5RⅡ(CD32)，识别IgG;⑤B7-1(CD80)和 B7-
53510编辑于 2024-02-27- 来自专栏百味科研芝士
深度分析：生信+免疫+COX模型，突破5分不在话下
文章主题仍是生信分析结合免疫，但内容是以生信分析做基础，挑选出枢纽基因后结合临床病理特征进行多因素COX回归分析，构建了回归模型，最后进行枢纽基因免疫浸润的分析。 ? 一 免疫相关评分与临床病理特征、预后间的关系 免疫相关评分主要包括三个方面，即immune score 免疫细胞打分, stromal score 基质细胞打分, estimate score 综合打分 经过单因素和多因素COX分析，最终肿瘤有远处转移（pM stage）、较高的分级（ISUP grade）、MLXIPL高表达是预后的危险因素，PPARGC1A高表达为保护因素（图 5）。 ? 图 5 五 RT-qPCR验证MLXIPL和PPARGC1A的表达量和预后情况 随后，作者在自己的380对配对样本验证了MLXIPL和PPARGC1A的表达量和预后情况，结果显示MLXIPL在肿瘤中高表达且其高表达在无进展生存期和总生存期中均预示着不良预后 至此这篇文章的分析就结束了，分析的前三步就是常规的生信加免疫套路，先分析免疫相关评分与临床病理特征间的联系，随后筛选差异表达基因，进行功能富集并构建PPI网络。
3.6K10发布于 2019-12-17 - 来自专栏科研菌
学学这篇免疫浸润文章和作者一样发5+分
作者目的是构建一种新的免疫相关基因生物标记物，用于免疫疗法和黑色素瘤的预后。 二.分析流程 ? 图5A：分类器在GSE数据集中具有很强的预测能力，1年AUC为0.679，3年为0.743，5年为0.740（图5A）。 图5C：时间依赖ROC曲线显示，分类器具有良好的准确性，其中1年为0.642，3年为0.636，5年为0.645。 图5D：K-M分析，同样是高RS组的OS较差，P <0.0001。 此外，与其他临床特征相比，该分类器具有更好的预测能力和准确性（图5E，5F）。 ? 图6.基于KM分析，研究免疫评分对黑色素瘤OS的影响 5.高和低RS组之间的免疫细胞亚型 图7A-B：展示了黑色素瘤的22种免疫细胞比例（图7A：GSE；图7B：TCGA）。
1.1K21发布于 2020-06-28 - 来自专栏mwangblog
免疫算法简单介绍
免疫算法的基本步骤： 抗原识别。输入目标函数和各种约束作为免疫算法的抗原。 初始抗体生成。随机生成初始抗体种群。 亲和力计算。计算抗体的适应值。 免疫处理。 免疫处理包括免疫选择、克隆、变异和抑制。 免疫选择：根据抗体的亲和力选出亲和度较高的抗体。 克隆：对选出的亲和力较高的抗体进行复制。 变异：对克隆得到的个体进行交叉、变异操作，使其亲和力发生改变。 将免疫选择的抗体和免疫抑制后的抗体组成一个集合，保留其中亲和度较高的抗体，使这些抗体进入新的种群。新的种群中不足的部分随机生成，以增加多样性。 免疫算法流程图： ?
1.6K10发布于 2018-12-21 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序揭示 MDA5+ 皮肌炎的特有适应性免疫特征
作者使用单细胞RNA测序、流式细胞术和多重免疫组织化学，揭示了患者外周血B细胞和T细胞以及受影响肺组织样本中MDA5+ DM的免疫特征，发现在MDA5+ DM中，存在大量的外周抗体分泌细胞和CD8+ T 细胞反应，可以作为细胞免疫标志。 在受影响的肺部，发现大量免疫细胞浸润，这可能通过 I 型干扰素的产生促进促纤维化反应。该研究揭示了 MDA5+ DM 的关键免疫致病特征，并为未来的针对性疗法提供了潜在的基础。 发现非免疫细胞中肺泡 II 型细胞、成纤维细胞和内皮细胞的比例明显升高。免疫细胞中，ISG+CD4+ T细胞以及ISG+CD8+ T和CD8增殖T细胞的比例增加。 表明MDA5+DM患者的肺部产生了强大的适应性免疫反应。 为了进一步探索肺部的潜在致病机制，使用ssGSVA来分析MDA5+DM患者中富集的特定途径，其中得到：I型IFN信号途径和纤维化。
90421编辑于 2023-02-16 - 来自专栏单细胞天地
头颈癌免疫状况研究
Abstract 本文研究了HPV+/HPV- (Human Papillomavirus) 的Head and Neck Squamas Cancer (HNSCC) 患者的肿瘤免疫微环境，发现这两类患者中 免疫疗法为HNSCC的一个新疗法，但只有20-30%患者在PD-1/PD-L1的临床试验中获益，且原因不明。因此，有必要研究HNSCC的免疫微环境，从而为免疫治疗提供可能靶点。 ? primary tumor: 18 HPV+, 8 HPV-; 对照: 5 tonsil tissue; 6 PBMC (healthy people) => CD45+ sorting，共131224 分亚群，组织分布（AB)；亚群DEG => pathway enrichment (C) cluster 1-4: germinal center B, 5: plasma cells HPV+比HPV 又可名为，计算机视觉在病理切片的应用（的大作业） IF按细胞类型频率分为5类 每一类中：示例图片（left），不同cell types间proximal的odds ratio（right）(BCDEF
82520发布于 2020-03-27 新突破 | 治愈自身免疫性疾病？序贯免疫疗法：免疫系统也能 开机重启！ | MedChemExpress (MCE)
前段时间有个关于自身免疫性疾病的小新闻......But！咱们今天不聊这个。咱们聊聊自身免疫性疾病是否可治愈？ 哎嘿~有一新突破：序贯免疫疗法，让你的免疫系统 "开机重启"！ 01了解自身免疫自身免疫是指生物体对自身健康细胞、组织或成分的免疫反应，可能导致重要器官不可逆转的损害。 所以序贯免疫疗法的第二步是重置免疫系统，其主要目标是通过消除病理性免疫记忆细胞来减少免疫系统的异常反应，从而恢复免疫系统的正常功能[3]。 同样地，Wenli Zhang 等人采用基于 CAR 的方法来“重置”产生抗体的谱系，通过双重靶向 B 细胞和长寿浆细胞 (Long-lived plasma cells) 来治疗自身免疫[5]。 N Engl J Med. 2024 Feb 22;390(8):687-700.[5] Zhang W, et al.
39500编辑于 2024-11-04【免疫笔记】胸腺的“衰老剧本”—从发育到免疫老化的秘密
现在看这话简直是“大型真香现场”——胸腺根本不是“意外”，而是T细胞发育的“命运之地”：它负责筛选能识别外来抗原、同时不攻击自身的T细胞，是免疫耐受和免疫功能的“起跑线”。 六、 naive T细胞：免疫老化的“预测指标” 通过分析外周血里的初始T细胞（naive T细胞），可以预测“免疫年龄”。 比如： •健康人群的实际年龄和免疫年龄基本匹配； •百岁老人的免疫年龄比实际年龄“年轻”（这可能是他们长寿的原因之一）； •乙肝、HIV患者，以及红斑狼疮、重症肌无力患者的免疫年龄，比实际年龄“老很多” 相当于给免疫系统装了个“体检仪”，能提前预警免疫老化相关的疾病。 TCR库的多样性也跟着“崩盘”：从5岁到104岁，T细胞克隆型的丰富度越来越低，相当于免疫系统的“武器库”越老越单调，遇到新敌人就容易“没招”。
28210编辑于 2025-12-24
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