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染色质免疫沉淀(ChIP)实验(附视频)
染色质免疫沉淀技术是目前唯一研究体内 DNA与蛋白质相互作用的方法。 实验前准备 在实验开始前，先准备好本次实验所需的各种试剂盒和相关常规试剂，如本次实验分装 Pierce Agarose ChIP Kit， 此试剂盒， 提供了简化的方法来实现交联反交联、 蛋白消化、 免疫沉淀和 这时可继续进行接下来的免疫沉淀反应实验，也可以将样品冻存于-80℃中备用。 染色质免疫沉淀反应将上一步骤得到的上清，约 50μl，转移 5μl 至另一新的离心管中作为 Input对照。 DoctorA，您在实验中，以及上个问题中提到的 Input 对照，它是怎么来的，重要性体现在哪里呢？ 在进行免疫沉淀前，取一部分断裂后的染色质做 Input 对照。 若想得到一个好的实验结果， 抗体的选择需要注意什么呢？ 染色质免疫沉淀所选择的目的蛋白的抗体是 ChIP 实验成功的关键。
2.7K22发布于 2019-09-17 - 来自专栏生命科学
蛋白 AG 磁珠免疫沉淀（IP）实验 精选参考文献｜MCE
蛋白 A/G 磁珠为 IP、Co-IP 和 ChIP 实验提供了一种快速便捷的方法。 MCE 蛋白质 A/G 磁珠通常用于从血清、细胞培养上清或腹水中分离抗体，以及从细胞或组织提取物中免疫沉淀和共免疫沉淀抗原。Free Sample (200 μL）限时可申请试用。 功能实验表明，MAGE-C3通过激活上皮间质转化（EMT）促进肿瘤转移。MAGE-C3抑制抗肿瘤免疫并调节T细胞的细胞因子分泌，这意味着免疫抑制功能。 此外，携带MAGE-C3过表达肿瘤的小鼠表现出更差的存活率和更多的肺转移，其中CD 8+浸润的T细胞减少，程序性细胞死亡1（PD-1）+CD 8+浸润的T细胞增加。 4、生酮饮食通过赖氨酸β-羟丁酰化重塑癌症代谢Nat Metab. 2024 Aug;6(8):1505-1528.蛋白A/G磁珠（50 μL; 2 h）。
34110编辑于 2025-09-10 【免疫学实验】揭秘蛋白互作：免疫沉淀与免疫共沉淀
一、 免疫沉淀（IP）：精准捕获目标蛋白 免疫沉淀是利用抗体从复杂的混合物中分离特定蛋白质的技术。 1. 免疫沉淀与 SDS-PAGE 分析 免疫沉淀法用于从细胞裂解液中富集特定抗原。细胞可通过 ³⁵S-蛋氨酸代谢标记（标记所有新合成蛋白）或 表面碘化/生物素化（仅标记膜蛋白）进行示踪。 最后通过放射自显影（或显色）确定蛋白位置 三、 免疫共沉淀（Co-IP）：验证蛋白互作 如果说免疫沉淀是“抓单个”，那么免疫共沉淀就是“抓团伙”。 实验逻辑： 捕获： 在含有潜在复合物的细胞提取物中，使用蛋白A的抗体进行免疫沉淀。 验证： 将沉淀下来的复合物进行电泳和免疫印迹（Western Blot），使用蛋白B的抗体进行检测。 总结 免疫沉淀技术不仅帮助我们纯化和鉴定蛋白质（分子量、等电点），更是通过免疫共沉淀技术，成为了揭示蛋白质之间物理相互作用的金标准实验方法。
31010编辑于 2025-12-29- 来自专栏图形学与OpenGL
实验8 OpenGL交互
1．实验目的： 理解掌握一个OpenGL程序的常见交互方法。 2．实验内容： （1） 运行示范实验代码1，掌握程序鼠标交互方法，尝试为其添加键盘与菜单控制，实现同样功能； （2）运行示范实验代码2，掌握程序鼠标坐标获取与绘图方法，尝试为其添加绘制直线功能； （3） 3．实验原理： 要想在OpenGL中处理鼠标事件非常的方便，GLUT已经为我们的注册好了函数，只要我们提供一个方法。 实验作业： 试比较所给两个示范代码的窗口坐标系有何不同。
1.4K20发布于 2018-10-09 - 来自专栏张国平_玩转树莓派
树莓派基础实验8：振动开关实验
---- 二、组件 ★Raspberry Pi 3主板*1 ★树莓派电源*1 ★40P软排线*1 ★振动开关传感器模块*1 ★双色LED模块*1 ★面包板*1 ★跳线若干 三、实验原理 ? 振动传感器实验原理图 在震动开关模块中，导电的振动弹簧和触发销被精确地放置在开关体中，并且通过粘合剂结合到固化位置。 在此实验中，将双色LED模块连接到树莓派以指示更改。敲击或敲击振动传感器时，它将打开，双色led将闪烁绿色，再次敲击它将变为红色，每一次敲击后会在两种颜色之间切换。 四、实验步骤 第1步：连接电路，该实验与实验6（轻触开关按键实验）相同。这里激光模块的实物与模块原理图的端口名称不一致，我们按照实物的端口名称来连接。 振动开关实验电路图 ? 振动开关实验实物连接图 第2步：这次编程有两个函数要注意，是关于输入的高级应用。
2.3K20发布于 2020-09-27 - 来自专栏小樱的经验随笔
ucoreOS_lab8 实验报告
lab8 会依赖 lab1~lab7 ，我们需要把做的 lab1~lab7 的代码填到 lab8 中缺失的位置上面。 根据实验指导书，我们可以了解到，ucore 的文件系统架构主要由四部分组成： 通用文件系统访问接口层：该层提供了一个从用户空间到文件系统的标准访问接口。 请在实验报告中给出设计实现”UNIX的PIPE机制“的概要设方案，鼓励给出详细设计方案。 如果在sh用户界面上可以执行”ls”,”hello”等其他放置在sfs文件系统中的其他执行程序，则可以认为本实验基本成功。 [chS]" >cscope.files $(V)cscope -bq $(V)ctags -L cscope.files 或者将 lab8 中的 Makefile，复制到 lab8_result 中（
1.1K50发布于 2019-08-05 - 来自专栏图形学与OpenGL
实验8 OpenGL太阳系动画
1．实验目的： 熟悉颜色缓存、深度缓存、模板缓存、累计缓存的内容，掌握缓存清除的方法； 建立太阳、地球、月亮的运动模型； 利用双缓存技术，用动画方式显示模型，加深读者对几何变换、投影变换以及观察变换的理解 2．实验内容： 模拟简单的太阳系，如图A.8所示。太阳在中心，地球每365天绕太阳转一周，月球每年绕地球转12周。另外，地球每天24个小时绕它自己的轴旋转。 ? 图A.8 太阳系动画 3．实验原理： (1)主要用三维平移变换、旋转变换实现太阳、地球、月亮的相对运动。 本节实验绘制了一个简单的太阳系。 4．实验代码： #include <gl/glut.h> float fEarth = 2.0f; //地球绕太阳的旋转角度 float fMoon = 24.0f; //月球绕地球的旋转角度 void (1)让实验6的茶壶旋转； (2)让实验7的机器人手臂不停旋转划圈。
2.6K11发布于 2020-10-27 - 来自专栏生命科学
MCE | 磁珠 VS 琼脂糖珠
琼脂糖珠长久以来，多孔的琼脂糖珠(也称琼脂糖树脂)作为免疫沉淀实验中的固相支持物常用的材料 但值得注意的是，在免疫沉淀实验中，抗体的量常常不足以满足琼脂糖珠的饱和荷载量，没有被抗体覆盖的琼脂糖珠的部分则可以自由地结合任何可粘附的物质，这种非特异性结合升高引起背景信号升高，这时，“高荷载量优势” 排除由于微珠本身材质引起的非特异性结合：将裂解样本与微珠单独混合孵育，随后去除微珠并收集上清液，再进行免疫沉淀实验。b. 琼脂糖珠：琼脂糖珠必须通过离心浓缩在管底部，并在每次孵育和洗涤除去上清液，通常需要肉眼识别管底部的琼脂糖珠，因此，每个免疫沉淀实验至少需要使用25-50 μL 的琼脂糖珠。 相反，磁珠免疫沉淀反应不需要离心，配合使用磁性分离架磁性分离，在 30 分钟内即可完成实验，因此可以在较短时间内轻松处理并获得较多样本的分析数据。
55820编辑于 2023-03-15 - 来自专栏生命科学
免疫沉淀常见问题解答 | MedChemExpress
其次根据实验目的，选择合适的表面活性基团以及由此衍生的偶联方式、蛋白结合量等。 注 1：Co-IP 实验时，常用 NP-40 等非离子型裂解液，以免破坏蛋白-蛋白相互作用。注 2：确保目的蛋白在抗原样品中有较高水平表达。 例如，同型对照抗体 (没有特异靶标的一抗，但在类别和亚型上，其跟实验应用中的靶标一抗一致) 等。 Output：在某些 Co-IP 实验中，实验人员会把 IP 后的上清分别进行诱饵蛋白 X 和靶蛋白 Y 的 WB 检测，该对照组称为 output 组。...... 好了，说了这么多，希望本篇对大家有所帮助，祝伙伴们拿到心仪的实验结果。
68320编辑于 2023-02-03 - 来自专栏院长运维开发
K8s中污点实验--NoExecute
10d 10.244.2.137 k8s-node3 <none> <none> frontend-n8tb4 1/1 <none> <none> pod-deployment-58b58949b9-2s8b8 1/1 Running 1 5d19h 10.244.2.138 1/1 Running 0 5d15h 10.244.2.144 k8s-node3 <none> <none> 设置k8s-node2 pv]# kubectl taint nodes k8s-node2 check=yuanzhang:NoExecute node/k8s-node2 tainted 再次查看Pod的信息，可以Deployment <none> <none> pod-deployment-58b58949b9-2s8b8 1/1 Running 1 5d20h 10.244.2.138
1.3K10发布于 2020-12-17 - 来自专栏惊羽-布壳儿
云实验室(8) - pve磁盘文件
分配机制 在安装的时候如果不手动指定分区大小,pve会自动进行分区 在pve节点上执行查看磁盘总体情况 lsblk image-3a8b4eaf54534b2c8818b2f04e98fea5.png
2.7K20编辑于 2022-06-15 【辰辉创聚生物】重组蛋白表达与纯化|蛋白表达不同标签的优势及用途
本文将系统总结我们在不同的重组蛋白表达系统中积累的经验与实践，提供一些实用的标签搭配建议，为您的实验设计提供有价值的参考。 Flag标签FLAG标签是一个小型的八肽序列（DYKDDDDK），常用于免疫沉淀和Western Blot等检测方法。它与抗FLAG抗体具有高特异性，广泛用于蛋白检测和分析。 Strep-tag II标签Strep-tag II 是一个由8个氨基酸组成的小型标签，能够与链霉亲和素（Streptavidin）或其衍生物StrepTactin特异性结合，广泛应用于蛋白纯化、免疫沉淀和蛋白 Strep-tag II标签小巧且具有高特异性，能够与链霉亲和素高效结合，适用于蛋白纯化和免疫沉淀。它对蛋白结构影响较小，去标签过程简便。 选择合适的蛋白标签需要根据实验需求来决定。以下是常见标签的特点，帮你一眼看清：His-tag：小巧、便宜，适合常规使用。GST-tag：提高蛋白溶解性，适用于Pull-down实验。
48700编辑于 2025-08-13- 来自专栏院长运维开发
K8s中容忍搭配污点实验
设置各Node节点的污点 [root@k8s-master ~]#kubectl taint nodes k8s-node1 check1=yuanzhang1:NoExecute node/k8s-node1 tainted [root@k8s-master ~]#kubectl taint nodes k8s-node2 check2=yuanzhang2:NoExecute node/k8s-node2 tainted [root@k8s-master ~]#kubectl taint nodes k8s-node3 check3=yuanzhang3:NoExecute node/k8s-node3 value effect: "NoExecute" #污点的effect tolerationSeconds: 3600 #驱逐时继续保留运行的时间 创建Pod资源 [root@k8s-master apply -f taint-tolerate-pod.yaml pod/taint-tolerate-pod created 查看Pod信息，发现已经在运行了，说明已经容忍这个污点的节点 [root@k8s-master
69310发布于 2020-12-17 - 来自专栏生命科学
MCE丨重组蛋白常见的融合标签
相关产品Tag Peptides标签多肽，可用于标签蛋白的竞争性洗脱，可作为相关检测的阳性对照Anti-HA Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 HA 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。 Anti-c-Myc Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 c-Myc 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。 Anti-Flag Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 Flag 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。 Anti-GST Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 GST 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。
50510编辑于 2023-03-22 链霉亲和素-生物素系统在免疫沉淀中的应用 - MedChemExpress
因此 SABS 广泛应用于免疫沉淀 (IP)、蛋白纯化以及成像实验的信号放大，如免疫荧光 (IF)、酶联免疫吸附实验 (ELISA)、原位杂交等实验。 MCE链霉亲和素磁珠在涉及多种应用的 64 篇文献中被引用 (累计影响因子 360+)，如免疫沉淀 (IP)、染色质免疫共沉淀 (CHIP)、RNA pull down、蛋白纯化等。 为了验证这一假设，作者使用三种生物素标记的 CnHsf3-线粒体靶向寡核苷酸进行 CHIP 实验。 ▐ 案例 3：RNA 免疫沉淀 (RIP)作者假设 YTHDC1 参与 HaCaT 细胞中 SQSTM1 表达的调节。 RNA 免疫沉淀(RIP)-qPCR 实验表明，YTHDC1 蛋白可以与 SQSTM1 mRNA 相互作用。
1.9K00编辑于 2024-01-18- 来自专栏惊羽-布壳儿
云实验室(4) - rancher&k8s
安装k8s 4.1 管理集群 image-1cff316ca6a546c59f0b315911127fdb.png 4.2 自定义 image-fe4a32a73663417ea5ec65b43edaefd1 .png 4.3 配置 image-d6661fb63ef34f62a3b844e28c1a32d2.png 4.4 k8s搭建 4.4.1 主节点 (勾选 etcd , contolPlane, 873ca2fa0f634857b3fcb5048566a476.png 4.4.1 worker节点 (勾选 worker) 注意,要等master 为active之后再执行 image-277a32cfbe6948ac8a8a7025e03f6e9d.png
45520编辑于 2022-06-15 - 来自专栏惊羽-布壳儿
云实验室(5) - kubesphere&k8s
上一篇记录了部署rancher和初体验,本篇记录kubesphere的搭建. 1.2 环境准备 1.2.1 实验虚拟机 centos7.9 (基于proxmox-debian金属机) name: node1 虚拟机虚拟网卡桥接宿主机物理网卡,访问公网. 1.2.3 初始化 脚本/命令 与rancher前期准备相同,见 : https://www.buukle.top/archives/si-you-yun-4-rancherk8s 1.2.5 检查resolv.conf文件,清除其中当前网络不能识别的记录 vim /etc/resolv.conf 示例 : image-1315df15c742457aaa4b6ad5c91be9c8. 效果 image-5854d9754d5e4706bd30151f94d1d176.png image-d4234632eb77480d970ab3c8b6d9d7ac.png
1K10编辑于 2022-06-15 - 来自专栏生信菜鸟团
Cell：对亚细胞蛋白质组进行全局表征，发现许多蛋白质是通过其空间分布的变化而非丰度变化来调节的
所有免疫沉淀和N/O/C分离均使用每个重复107个细胞进行了三次实验。 Para_02 定量分析揭示了每种细胞器免疫沉淀的丰富的蛋白质富集谱（图1F–1L；图S1D；STAR方法）。 我们的数据集总共包括8,192个独特的表达基因（"猎物"，在至少一次免疫沉淀的所有重复实验中被检测到；STAR方法）和8,538个总蛋白质，包括相同基因产物的异构体。 我们的数据集确定了8,538种蛋白质，它们通过其在各个单一天然细胞器免疫沉淀和自旋级分中的富集来定义。◉ （B）文献整理的标记蛋白每种隔室富集特征之间的成对皮尔逊相关性（表S2）。 实验开始时以0.25的MOI感染细胞。通过使用单克隆抗OC43抗体541-8F（确切表位未知）的免疫荧光流式细胞术检测感染细胞。◉ （B）包含在OC43感染实验中的细胞器IP标记物组。 Sample grouping Para_01 对于当前的研究，所有三重重复的IP-MS样本是在17个独立的实验批次中产生的，每个批次平均包含8个三重复样本（或24个单独的IP）。
68210编辑于 2025-02-27 - 来自专栏生信技能树
m6A-Seq数据质量评估：trumpet包
除此之外，还可以用于其他RNA免疫沉淀测序技术数据评估如m1A-seq, CeU-Seq, Ψ-seq等。 低reads count或比对到特定基因组区域的reads比例差异过大可能与低数据质量有关，这是由于多样本混库测序不平衡、DNA污染或实验过程中的其他偏差造成的。 PCR artifacts 可能进一步加剧了m6 A-seq实验reads覆盖的异质性。 ? 3.reads分布可视化 RNA m6A一般分布在起始密码子和终止密码子附近。 4.使用ESES评估免疫沉淀反应效率 m6A-Seq数据的一个主要评价指标就是免疫沉淀反应效率，只要体现在免疫沉淀信号的富集程度。 .bam", package="Trumpet") ip_bam <- c(f1,f2,f3,f4) input_bam <- c(f5,f6,f7) contrast_ip_bam <- c(f8)
1.8K20发布于 2021-02-03 - 来自专栏生物信息云
NCB | CRAD控制的细胞骨架失调通过β-catenin引发粘液性结直肠癌
---- 1.CRAD inactivation in CRC ---- 生信+实验确定CRAD在癌症中的表达，生信分析CRAD在癌症中的突变。 ---- 2. 来自细胞裂解物的共免疫沉淀（Co-IP）和纯化蛋白质的下拉测定验证了CRAD和CP之间的内源性和直接相互作用（图2b）。因此，作者假设CRAD通过抑制CP来增强F-actin聚合（图2c）。 共免疫沉淀试验表明，过表达CRAD减少了CP和肌动蛋白之间的相互作用（图2d，e）。 by CRAD KO 7.Intestinal adenoma development due to CRAD knockout 8.Accelerated intestinal tumorigenesis by CRAD KO 9.Mucinous intestinal tumorigenesis by CRAD KO ---- 后面的实验都是动物水平上的验证，做的工作比较多。
64810编辑于 2022-12-16
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