首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
    • 综合排序
    • 最热优先
    • 最新优先
    时间不限
  • 来自专栏生物信息云

    染色质免疫沉淀(ChIP)实验(附视频)

    染色质免疫沉淀技术是目前唯一研究体内 DNA与蛋白质相互作用的方法。 实验前准备 在实验开始前,先准备好本次实验所需的各种试剂盒和相关常规试剂,如本次实验分装 Pierce Agarose ChIP Kit, 此试剂盒, 提供了简化的方法来实现交联反交联、 蛋白消化、 免疫沉淀和 这时可继续进行接下来的免疫沉淀反应实验,也可以将样品冻存于-80℃中备用。 染色质免疫沉淀反应将上一步骤得到的上清,约 50μl,转移 5μl 至另一新的离心管中作为 Input对照。 DoctorA,您在实验中,以及上个问题中提到的 Input 对照,它是怎么来的,重要性体现在哪里呢? 在进行免疫沉淀前,取一部分断裂后的染色质做 Input 对照。 若想得到一个好的实验结果, 抗体的选择需要注意什么呢? 染色质免疫沉淀所选择的目的蛋白的抗体是 ChIP 实验成功的关键。

    2.8K22发布于 2019-09-17
  • 来自专栏生命科学

    蛋白 AG 磁珠免疫沉淀(IP)实验 精选参考文献|MCE

    蛋白 A/G 磁珠为 IP、Co-IP 和 ChIP 实验提供了一种快速便捷的方法。 MCE 蛋白质 A/G 磁珠通常用于从血清、细胞培养上清或腹水中分离抗体,以及从细胞或组织提取物中免疫沉淀和共免疫沉淀抗原。Free Sample (200 μL)限时可申请试用。 功能实验表明,MAGE-C3通过激活上皮间质转化(EMT)促进肿瘤转移。MAGE-C3抑制抗肿瘤免疫并调节T细胞的细胞因子分泌,这意味着免疫抑制功能。 用来自小鼠肝全细胞裂解物的泛Kbhb或泛Kac抗体进行免疫沉淀。赖氨酸β-羟基丁酰化(Kbhb)是由生酮饮食(KD)诱导的翻译后修饰,KD是一种对多种人类疾病具有治疗作用的饮食。 用针对Myc-标签或Flag-标签的抗体免疫沉淀蛋白质提取物,然后用指定的抗体进行免疫印迹。

    37210编辑于 2025-09-10
  • 【免疫学实验】揭秘蛋白互作:免疫沉淀与免疫共沉淀

    一、 免疫沉淀(IP):精准捕获目标蛋白 免疫沉淀是利用抗体从复杂的混合物中分离特定蛋白质的技术。 1. 免疫沉淀与 SDS-PAGE 分析 免疫沉淀法用于从细胞裂解液中富集特定抗原。细胞可通过 ³⁵S-蛋氨酸代谢标记(标记所有新合成蛋白)或 表面碘化/生物素化(仅标记膜蛋白)进行示踪。 最后通过放射自显影(或显色)确定蛋白位置 三、 免疫共沉淀(Co-IP):验证蛋白互作 如果说免疫沉淀是“抓单个”,那么免疫共沉淀就是“抓团伙”。 实验逻辑: 捕获: 在含有潜在复合物的细胞提取物中,使用蛋白A的抗体进行免疫沉淀。 验证: 将沉淀下来的复合物进行电泳和免疫印迹(Western Blot),使用蛋白B的抗体进行检测。 总结 免疫沉淀技术不仅帮助我们纯化和鉴定蛋白质(分子量、等电点),更是通过免疫共沉淀技术,成为了揭示蛋白质之间物理相互作用的金标准实验方法。

    36810编辑于 2025-12-29
  • 来自专栏猫头虎博客专区

    LeetCode 6-10 题 详解 Java版 ( 万字 图文详解 LeetCode 算法题6-10 =====>>> <建议收藏>)

    今天我们一起学习了LeetCode 6-10 题的算法分析,感谢大家阅读,觉得不错记得收藏哦! 喜欢 请点个 + 关注

    25410编辑于 2024-04-07
  • 来自专栏python、mysql、go知识点积累

    07-02 django 6-10

    字段查询 all():返回模型类对应表格中的所有数据。 get():返回表格中满足条件的一条数据,如果查到多条数据,则抛异常:MultipleObjectsReturned, 查询不到数据,则抛异常:DoesNotExist。 filter():参数写查询条件,返回满足条件 QuerySet 集合数据。 条件格式: 模型类属性名__条件名=值 注意:此处是模型类属性名,不是表中的字段名 关于 filter 具体案例如下: 判等 exact。

    96940发布于 2020-04-14
  • 来自专栏C语言例题100题

    C语言经典例题100(6-10

    思路: 使用循环嵌套来写这个代码,我们首先要让i=1的时候,做一遍1的乘法运算,也就是说我们的j<=i,所以我们第二个for循环就可以写成是让j也从1开始遍历,范围要小于等于i,以此递增。

    31110编辑于 2025-06-04
  • 来自专栏大数据成长之路

    Hadoop源代码分析【6-10

    小结 Hadoop源代码分析【6-10】主要为大家科普了RPC实现通信的流程,以及 DataNode在升级 / 回滚/ 提交时底层的变化。

    68620发布于 2021-01-27
  • 来自专栏全栈开发那些事

    6-10 二分查找 (20分)

    L是用户传入的一个线性表,其中ElementType元素可以通过>、==、<进行比较,并且题目保证传入的数据是递增有序的。函数BinarySearch要查找X在Data中的位置,即数组下标(注意:元素从下标1开始存储)。找到则返回下标,否则返回一个特殊的失败标记NotFound。

    30920编辑于 2023-02-27
  • 来自专栏Gorit 带你学全栈系列

    编程入门、进阶100例(6-10题)

    本期用先用java去实现代码,后面我会慢慢补全c语言和python的代码 题目索引 六、温度转换问题 6.1 问题描述 6.2 示例 6.3 代码实现 七、求阶乘之和 7.1 问题描述 7.2 示例 7.3 代码实现 八、打印水仙花数 8.1 打印100~1000之间的水仙花数 8.2 示例 8.3 代码实现 九、求100~200以内的素数 9.1 问题描述 9.2 示例 9.3 代码实现 十、实现冒泡排序 10.1 问题描述 10.2 示例 10.3 代码实现 六、温度转换问题 6.1 问题描述 输

    62910编辑于 2021-12-09
  • 来自专栏生命科学

    MCE | 磁珠 VS 琼脂糖珠

    琼脂糖珠长久以来,多孔的琼脂糖珠(也称琼脂糖树脂)作为免疫沉淀实验中的固相支持物常用的材料 但值得注意的是,在免疫沉淀实验中,抗体的量常常不足以满足琼脂糖珠的饱和荷载量,没有被抗体覆盖的琼脂糖珠的部分则可以自由地结合任何可粘附的物质,这种非特异性结合升高引起背景信号升高,这时,“高荷载量优势” 排除由于微珠本身材质引起的非特异性结合:将裂解样本与微珠单独混合孵育,随后去除微珠并收集上清液,再进行免疫沉淀实验。b. 琼脂糖珠:琼脂糖珠必须通过离心浓缩在管底部,并在每次孵育和洗涤除去上清液,通常需要肉眼识别管底部的琼脂糖珠,因此,每个免疫沉淀实验至少需要使用25-50 μL 的琼脂糖珠。 相反,磁珠免疫沉淀反应不需要离心,配合使用磁性分离架磁性分离,在 30 分钟内即可完成实验,因此可以在较短时间内轻松处理并获得较多样本的分析数据。

    59920编辑于 2023-03-15
  • 来自专栏生命科学

    免疫沉淀常见问题解答 | MedChemExpress

    其次根据实验目的,选择合适的表面活性基团以及由此衍生的偶联方式、蛋白结合量等。 注 1:Co-IP 实验时,常用 NP-40 等非离子型裂解液,以免破坏蛋白-蛋白相互作用。注 2:确保目的蛋白在抗原样品中有较高水平表达。 例如,同型对照抗体 (没有特异靶标的一抗,但在类别和亚型上,其跟实验应用中的靶标一抗一致) 等。 Output:在某些 Co-IP 实验中,实验人员会把 IP 后的上清分别进行诱饵蛋白 X 和靶蛋白 Y 的 WB 检测,该对照组称为 output 组。...... 好了,说了这么多,希望本篇对大家有所帮助,祝伙伴们拿到心仪的实验结果。

    71820编辑于 2023-02-03
  • 来自专栏机器学习/数据可视化

    MySQL50-4-第6-10

    MySQL50-4-第6-10题 本文中介绍的是第6-10题,涉及到的主要知识点: 模糊匹配和通配符使用 表的自连接 in/not in 连接查询的条件筛选 ?

    26510发布于 2021-03-01
  • 来自专栏Corley的开发笔记

    C语言经典习题100例(二)6-10

    给大家推荐一门大数据Spark入门课程https://www.bilibili.com/video/BV1oi4y147iD/,希望大家喜欢。

    49720发布于 2020-07-23
  • 来自专栏生命科学

    MCE丨重组蛋白常见的融合标签

    相关产品Tag Peptides标签多肽,可用于标签蛋白的竞争性洗脱,可作为相关检测的阳性对照Anti-HA Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 HA 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。 Anti-c-Myc Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 c-Myc 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。 Anti-Flag Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 Flag 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。 Anti-GST Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 GST 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验

    53210编辑于 2023-03-22
  • 链霉亲和素-生物素系统在免疫沉淀中的应用 - MedChemExpress

    因此 SABS 广泛应用于免疫沉淀 (IP)、蛋白纯化以及成像实验的信号放大,如免疫荧光 (IF)、酶联免疫吸附实验 (ELISA)、原位杂交等实验。 MCE链霉亲和素磁珠在涉及多种应用的 64 篇文献中被引用 (累计影响因子 360+),如免疫沉淀 (IP)、染色质免疫共沉淀 (CHIP)、RNA pull down、蛋白纯化等。 为了验证这一假设,作者使用三种生物素标记的 CnHsf3-线粒体靶向寡核苷酸进行 CHIP 实验。 ▐ 案例 3:RNA 免疫沉淀 (RIP)作者假设 YTHDC1 参与 HaCaT 细胞中 SQSTM1 表达的调节。 RNA 免疫沉淀(RIP)-qPCR 实验表明,YTHDC1 蛋白可以与 SQSTM1 mRNA 相互作用。

    1.9K00编辑于 2024-01-18
  • 来自专栏生信菜鸟团

    Cell:对亚细胞蛋白质组进行全局表征,发现许多蛋白质是通过其空间分布的变化而非丰度变化来调节的

    所有免疫沉淀和N/O/C分离均使用每个重复107个细胞进行了三次实验。 Para_02 定量分析揭示了每种细胞器免疫沉淀的丰富的蛋白质富集谱(图1F–1L;图S1D;STAR方法)。 线粒体外膜蛋白TOMM20的天然免疫沉淀显示982种蛋白质的富集(富集≥2倍,p值≤0.01,在三次实验中;图1F和1G),其中线粒体蛋白质的富集最大(图1H)。 我们的数据集总共包括8,192个独特的表达基因("猎物",在至少一次免疫沉淀的所有重复实验中被检测到;STAR方法)和8,538个总蛋白质,包括相同基因产物的异构体。 可以在天然免疫沉淀下游进行PTM富集,以提供更多见解。 最后,我们的质谱实验是在大量细胞群体中进行的,无法解析单细胞水平上的蛋白质定位变化。 所有实验均在二级生物安全实验室中进行。

    77010编辑于 2025-02-27
  • 来自专栏数据科学(冷冻工厂)

    HiChIP 数据分析: 分析简介

    摘要 HiChIP 是一种基于原位 Hi-C 的新型方法,用于分析染色质相互作用,它在流程中加入了一个免疫沉淀 (ChIP) 步骤,以研究由特定蛋白质驱动的染色质结构。 在本文中,我们描述了一种计算流程,用于分析在人类胚胎干细胞中,在热休克处理前后,通过 Rad21(黏连蛋白复合体的一部分)免疫沉淀获得的 HiChIP 数据。 它属于 3C 技术 的一种,并复现了经典的原位 Hi-C 流程,只是在 DNA 消化和连接之后额外增加了一个染色质免疫沉淀 (ChIP) 步骤,从而仅分离并测序与特定蛋白质交联的片段。 尽管具备方法学优势,免疫沉淀步骤的加入会导致测序读取在分布上不均匀,并偏向特定限制性片段,这一点必须在识别局部富集的相互作用(loops)时予以特别考虑。 来自公共 HiChIP 数据集(包含不同实验条件)的原始测序数据,首先使用 HiC-Pro进行处理,该流程对读段对进行比对和过滤。

    47910编辑于 2025-09-17
  • 来自专栏生信技能树

    m6A-Seq数据质量评估:trumpet包

    文献摘要 RNA甲基化免疫沉淀测序(MeRIP-seq或m6A-seq)已被广泛用于分析RNA N6-腺苷甲基化在转录组中的分布。 除此之外,还可以用于其他RNA免疫沉淀测序技术数据评估如m1A-seq, CeU-Seq, Ψ-seq等。 低reads count或比对到特定基因组区域的reads比例差异过大可能与低数据质量有关,这是由于多样本混库测序不平衡、DNA污染或实验过程中的其他偏差造成的。 PCR artifacts 可能进一步加剧了m6 A-seq实验reads覆盖的异质性。 ? 3.reads分布可视化 RNA m6A一般分布在起始密码子和终止密码子附近。 4.使用ESES评估免疫沉淀反应效率 m6A-Seq数据的一个主要评价指标就是免疫沉淀反应效率,只要体现在免疫沉淀信号的富集程度。

    1.8K20发布于 2021-02-03
  • 来自专栏【趣学C语言和数据结构100例】

    【趣学C语言和数据结构100例】6-10

    【趣学C语言和数据结构100例】 问题描述 6.一个球从 100m 高度自由落下,每次落地后反弹回原高度的一半,再落下,求它在第 10 次时共经过多少米,第 10 次反弹多高。 7.猴子吃桃问题。猴子第 1 天摘下若干个桃子,当即吃了一半,还不过瘾,又多吃了一个。第 2 天早上又将剩下的桃子吃掉一半,又多吃了一个。以后每天早上都吃了前一天剩下的一半零一个。到第 10 天早上想再吃时,就只剩一个桃子了。求第 1 天共摘多少个桃子。 8.迭代法求 x = 根号 a。求平方根的迭代公式为 x(n+1) = 1/2 * (xn + a/xn) 9.用牛顿迭代法求下面方程在 1.5 附近的根: 2x³ - 4x² + 3x - 6 = 0 70.用筛选法求 100 之内的素数。 代码分析 6. 物理公式的规律应用 每次落地后反弹回原高度的一半,初始total_m,第一次为total_m *= 0.5,for循环计算n次的,共经过,使用sum来计数。 7. 数学公式的规律应用 已知结果,找倒推规律,求初始。由后一天 = ( 前一天 / 2 ) -1 可知,前一天 = ( 后一天 + 1 ) *2,定义天数day,使用while(day–),求第一天。 8. 巴比伦法 迭代公式为 x(n+1) = 1/2 (xn + a/xn) 初次猜测,x0=a/2,那么,代入公式得到x1 使用while开始代法,令x0=x1,代入公式得到x1 当 ∣xn+1−xn∣∣xn+1−xn∣ 小于某个设定的精度(例如 1e−51e−5)时停止迭代。 9. 牛顿迭代法的求解 牛顿迭代法 :x(n+1) = x(n) - f(x(n)) / f’(x(n)) 对于本题,方程在 1.5 附近的根: 2x³ - 4x² + 3x - 6 = 0 x0,x1=1.5,f,f1 f(x(n))=2x³ - 4x² + 3x - 6 f’(x(n)) =6x² -8x +3 每次令 x0 = x1; f = ( ( 2 * x0 - 4 ) * x0 + 3 ) * x0 -6; f1 = ( 6 * x0 - 8 ) * x0 + 3; x1 = x0 - f / f1; 当 ∣xn+1−xn∣∣xn+1−xn∣ 小于某个设定的精度(例如 1e−51e−5)时停止迭代。 10. 筛选法 筛选法:又称为筛法。先把以个自然数按次序排列起来。1不是质数,也不是合数,要划去第二个数2是质数留不来,而把2后面所有能被2整除的数都划去。2后面第一个没划去的数是3,把3留下,再把3后面所有能被3整除的数都划去。3后面第一个没划去的数是5,再把与后面所有能被5整除的数都划去。这样一直做下去,就会把不超过N的把5留下,全部合数都筛掉,留下的就是不超过N的全部质数。 具体思路:先初始化数组,初始化为数字本身,如果访问过,则赋值为0。定义两个for循环,第一个访问到100,然后判断为0,则跳过。否则进行,从该数开始,到100,找到该数的倍数,并赋值为0。 代码实现 #include<stdio.h> #include<math.h> int main(){ // 6.一个球从100m高度自由落下,每次落地后反弹回原高度的一半,再落下,再反弹求它在第10次时共经过多少米,第10次反弹多高。 double total_m = 100.0,sum = 0.0; for(int i = 0; i < 10; i++) { sum += total_m; total_m /= 2; sum += total_m; } printf("第10次时共经过%f米,第10次反弹%f米",sum,total_m); // 7.猴子吃桃问题。猴子第1天摘下若干个桃子,当即吃了一半,还不过瘾,又多吃了一个。第2天早上又将剩下的桃子吃掉一半,又多吃了一个。以后每天早上都吃了前一天剩下的一半零一个。到第 10天早上想再吃时,就只剩一个桃子了。求第1天共摘多少个桃子。) 分析:后一天 = ( 前一天 / 2 ) -1 --> 前一天 = ( 后一天 + 1 ) * 2 int day = 9; int prev , cur = 1; while( day > 0) { prev = ( cur + 1 ) * 2; cur = prev; day--; } printf("第1天共摘%d个桃子",cur); // 8.迭代法求x=根号a。求平方根的迭代公式为x(n+1)=1/2 * (xn+a/xn) // 分析:牛顿迭代法 :x(n+1) = x(n) - f(x(n)) / f'(x(n)) https://blog.csdn.net/SanyHo/article/details/106365314 float a ,

    31700编辑于 2024-10-23
  • 来自专栏学习

    浙江大学PTA程序设计C语言基础编程练习题6-10

    这是最终结果:程序正确读取输入并按指定格式输出,浮点数保留两位小数,符合样例预期。

    25210编辑于 2025-12-17
领券