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  • 来自专栏生物信息云

    染色质免疫沉淀(ChIP)实验(附视频)

    染色质免疫沉淀技术是目前唯一研究体内 DNA与蛋白质相互作用的方法。 实验前准备 在实验开始前,先准备好本次实验所需的各种试剂盒和相关常规试剂,如本次实验分装 Pierce Agarose ChIP Kit, 此试剂盒, 提供了简化的方法来实现交联反交联、 蛋白消化、 免疫沉淀和 这时可继续进行接下来的免疫沉淀反应实验,也可以将样品冻存于-80℃中备用。 染色质免疫沉淀反应将上一步骤得到的上清,约 50μl,转移 5μl 至另一新的离心管中作为 Input对照。 DoctorA,您在实验中,以及上个问题中提到的 Input 对照,它是怎么来的,重要性体现在哪里呢? 在进行免疫沉淀前,取一部分断裂后的染色质做 Input 对照。 若想得到一个好的实验结果, 抗体的选择需要注意什么呢? 染色质免疫沉淀所选择的目的蛋白的抗体是 ChIP 实验成功的关键。

    2.8K22发布于 2019-09-17
  • 来自专栏生命科学

    蛋白 AG 磁珠免疫沉淀(IP)实验 精选参考文献|MCE

    蛋白 A/G 磁珠为 IP、Co-IP 和 ChIP 实验提供了一种快速便捷的方法。 MCE 蛋白质 A/G 磁珠通常用于从血清、细胞培养上清或腹水中分离抗体,以及从细胞或组织提取物中免疫沉淀和共免疫沉淀抗原。Free Sample (200 μL)限时可申请试用。 功能实验表明,MAGE-C3通过激活上皮间质转化(EMT)促进肿瘤转移。MAGE-C3抑制抗肿瘤免疫并调节T细胞的细胞因子分泌,这意味着免疫抑制功能。 用来自小鼠肝全细胞裂解物的泛Kbhb或泛Kac抗体进行免疫沉淀。赖氨酸β-羟基丁酰化(Kbhb)是由生酮饮食(KD)诱导的翻译后修饰,KD是一种对多种人类疾病具有治疗作用的饮食。 用针对Myc-标签或Flag-标签的抗体免疫沉淀蛋白质提取物,然后用指定的抗体进行免疫印迹。

    37310编辑于 2025-09-10
  • 【免疫学实验】揭秘蛋白互作:免疫沉淀与免疫共沉淀

    一、 免疫沉淀(IP):精准捕获目标蛋白 免疫沉淀是利用抗体从复杂的混合物中分离特定蛋白质的技术。 1. 免疫沉淀与 SDS-PAGE 分析 免疫沉淀法用于从细胞裂解液中富集特定抗原。细胞可通过 ³⁵S-蛋氨酸代谢标记(标记所有新合成蛋白)或 表面碘化/生物素化(仅标记膜蛋白)进行示踪。 最后通过放射自显影(或显色)确定蛋白位置 三、 免疫共沉淀(Co-IP):验证蛋白互作 如果说免疫沉淀是“抓单个”,那么免疫共沉淀就是“抓团伙”。 实验逻辑: 捕获: 在含有潜在复合物的细胞提取物中,使用蛋白A的抗体进行免疫沉淀。 验证: 将沉淀下来的复合物进行电泳和免疫印迹(Western Blot),使用蛋白B的抗体进行检测。 总结 免疫沉淀技术不仅帮助我们纯化和鉴定蛋白质(分子量、等电点),更是通过免疫共沉淀技术,成为了揭示蛋白质之间物理相互作用的金标准实验方法。

    36810编辑于 2025-12-29
  • 来自专栏AI机器学习与深度学习算法

    学习分类 2-2 内积

    对于分类问题,我们不再像回归问题那样,找出直线的斜率和截距。为了方便理解,将拥有一个特征的回归问题所绘制的图示和拥有两个特征的分类问题绘制的图示进行对比。

    56710编辑于 2022-11-08
  • 来自专栏IT技术圈

    习题2-2 阶梯电价 (15分)

    为了提倡居民节约用电,某省电力公司执行“阶梯电价”,安装一户一表的居民用户电价分为两个“阶梯”:月用电量50千瓦时(含50千瓦时)以内的,电价为0.53元/千瓦时;超过50千瓦时的,超出部分的用电量,电价上调0.05元/千瓦时。请编写程序计算电费。

    3.3K10发布于 2021-04-01
  • 来自专栏Hank’s Blog

    2-2 R语言基础 向量

    > x <- vector("character",length=10) > x1 <- 1:4 > x2 <- c(1,2,3,4) > x3 <- c(TRUE,10,"a") #如果给向量赋值时元素类型不一致,R就会强制转换,将他们变为同一类型 > x4 <- c("a","b","c","d")

    76410发布于 2020-09-16
  • 来自专栏生命科学

    MCE | 磁珠 VS 琼脂糖珠

    琼脂糖珠长久以来,多孔的琼脂糖珠(也称琼脂糖树脂)作为免疫沉淀实验中的固相支持物常用的材料 但值得注意的是,在免疫沉淀实验中,抗体的量常常不足以满足琼脂糖珠的饱和荷载量,没有被抗体覆盖的琼脂糖珠的部分则可以自由地结合任何可粘附的物质,这种非特异性结合升高引起背景信号升高,这时,“高荷载量优势” 排除由于微珠本身材质引起的非特异性结合:将裂解样本与微珠单独混合孵育,随后去除微珠并收集上清液,再进行免疫沉淀实验。b. 琼脂糖珠:琼脂糖珠必须通过离心浓缩在管底部,并在每次孵育和洗涤除去上清液,通常需要肉眼识别管底部的琼脂糖珠,因此,每个免疫沉淀实验至少需要使用25-50 μL 的琼脂糖珠。 相反,磁珠免疫沉淀反应不需要离心,配合使用磁性分离架磁性分离,在 30 分钟内即可完成实验,因此可以在较短时间内轻松处理并获得较多样本的分析数据。

    60020编辑于 2023-03-15
  • 来自专栏波波烤鸭

    2-2 SPU和SKU详解及MyBatisPlus自动生成

    2-2 SPU和SKU详解   商城系统中的商品信息肯定避免不了SPU和SKU这两个概念,本节就给大家详细介绍下这块的内容 1、掌握SKU和SPU关系 SPU = Standard Product Unit

    3.2K41发布于 2021-01-21
  • 来自专栏生命科学

    免疫沉淀常见问题解答 | MedChemExpress

    其次根据实验目的,选择合适的表面活性基团以及由此衍生的偶联方式、蛋白结合量等。 注 1:Co-IP 实验时,常用 NP-40 等非离子型裂解液,以免破坏蛋白-蛋白相互作用。注 2:确保目的蛋白在抗原样品中有较高水平表达。 例如,同型对照抗体 (没有特异靶标的一抗,但在类别和亚型上,其跟实验应用中的靶标一抗一致) 等。 Output:在某些 Co-IP 实验中,实验人员会把 IP 后的上清分别进行诱饵蛋白 X 和靶蛋白 Y 的 WB 检测,该对照组称为 output 组。...... 好了,说了这么多,希望本篇对大家有所帮助,祝伙伴们拿到心仪的实验结果。

    71820编辑于 2023-02-03
  • 来自专栏刷题笔记

    2-2 学生成绩链表处理 (20 分)

    本文链接:https://blog.csdn.net/shiliang97/article/details/101169860 2-2 学生成绩链表处理 (20 分) 本题要求实现两个函数,一个将输入的学生成绩组织成单向链表

    1.6K20发布于 2019-11-08
  • 来自专栏mysql

    hhdb数据库介绍(2-2)

    HHDB Server在计算节点、数据节点、配置库等层次提供全面的高可用保障。提供完善的心跳检测、故障切换对存储节点同步追平判断、全局自增序列在故障时自动跳号、客户端连接Hold等机制,保障数据服务的可用性与数据的一致性。

    20010编辑于 2024-11-28
  • 来自专栏生命科学

    MCE丨重组蛋白常见的融合标签

    相关产品Tag Peptides标签多肽,可用于标签蛋白的竞争性洗脱,可作为相关检测的阳性对照Anti-HA Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 HA 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。 Anti-c-Myc Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 c-Myc 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。 Anti-Flag Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 Flag 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验。 Anti-GST Magnetic Beads用于细菌和哺乳动物细胞裂解物以及体外表达系统中 GST 标记蛋白的免疫沉淀 (IP) 实验

    53310编辑于 2023-03-22
  • 来自专栏育种数据分析之放飞自我

    笔记 | GWAS 操作流程2-2:性别质控

    「原理:」检查性别差异。先验信息,女性的受试者的F值必须小于0.2,男性的受试者的F值必须大于0.8。这个F值是基于X染色体近交(纯合子)估计。不符合这些要求的受试者被PLINK标记为“PROBLEM”。

    1.6K31发布于 2020-05-18
  • 来自专栏python3

    Python自动化开发学习2-2

    open()打开文件。windows系统默认的是gbk编码,如果不指定字符编码,就会使用系统默认的字符编码打开文件。比如这时python就会使用gbk编码去读utf-8文件,运行后会报错或者读到乱码。

    70530发布于 2020-01-10
  • 来自专栏悟道

    2-2 二分&前缀和模板

    二分模板 int mid=0; while(left<right){ mid=(left+right)/2; if(check(mid)<K) r=mid; else l=mid+1; } 前缀和模板 : 前缀呢 无非就是 从left->right的和: ( s[right] - s[left-1]) import java.util.Scanner; public class Main { public static void main(Stri

    36330发布于 2021-03-11
  • 链霉亲和素-生物素系统在免疫沉淀中的应用 - MedChemExpress

    因此 SABS 广泛应用于免疫沉淀 (IP)、蛋白纯化以及成像实验的信号放大,如免疫荧光 (IF)、酶联免疫吸附实验 (ELISA)、原位杂交等实验。 MCE链霉亲和素磁珠在涉及多种应用的 64 篇文献中被引用 (累计影响因子 360+),如免疫沉淀 (IP)、染色质免疫共沉淀 (CHIP)、RNA pull down、蛋白纯化等。 为了验证这一假设,作者使用三种生物素标记的 CnHsf3-线粒体靶向寡核苷酸进行 CHIP 实验。 ▐ 案例 3:RNA 免疫沉淀 (RIP)作者假设 YTHDC1 参与 HaCaT 细胞中 SQSTM1 表达的调节。 RNA 免疫沉淀(RIP)-qPCR 实验表明,YTHDC1 蛋白可以与 SQSTM1 mRNA 相互作用。

    1.9K00编辑于 2024-01-18
  • 来自专栏生信菜鸟团

    Cell:对亚细胞蛋白质组进行全局表征,发现许多蛋白质是通过其空间分布的变化而非丰度变化来调节的

    所有免疫沉淀和N/O/C分离均使用每个重复107个细胞进行了三次实验。 Para_02 定量分析揭示了每种细胞器免疫沉淀的丰富的蛋白质富集谱(图1F–1L;图S1D;STAR方法)。 线粒体外膜蛋白TOMM20的天然免疫沉淀显示982种蛋白质的富集(富集≥2倍,p值≤0.01,在三次实验中;图1F和1G),其中线粒体蛋白质的富集最大(图1H)。 我们的数据集总共包括8,192个独特的表达基因("猎物",在至少一次免疫沉淀的所有重复实验中被检测到;STAR方法)和8,538个总蛋白质,包括相同基因产物的异构体。 可以在天然免疫沉淀下游进行PTM富集,以提供更多见解。 最后,我们的质谱实验是在大量细胞群体中进行的,无法解析单细胞水平上的蛋白质定位变化。 所有实验均在二级生物安全实验室中进行。

    77210编辑于 2025-02-27
  • 来自专栏韦东山嵌入式

    鸿蒙系统开发教程_韦东山 2-2必备基础知识

    在RTOS中,本质也是去读写寄存器,但是需要有统一的驱动程序框架。 所以:RTOS驱动 = 驱动框架 + 硬件操作

    60120编辑于 2022-05-05
  • 来自专栏数据科学(冷冻工厂)

    HiChIP 数据分析: 分析简介

    摘要 HiChIP 是一种基于原位 Hi-C 的新型方法,用于分析染色质相互作用,它在流程中加入了一个免疫沉淀 (ChIP) 步骤,以研究由特定蛋白质驱动的染色质结构。 在本文中,我们描述了一种计算流程,用于分析在人类胚胎干细胞中,在热休克处理前后,通过 Rad21(黏连蛋白复合体的一部分)免疫沉淀获得的 HiChIP 数据。 它属于 3C 技术 的一种,并复现了经典的原位 Hi-C 流程,只是在 DNA 消化和连接之后额外增加了一个染色质免疫沉淀 (ChIP) 步骤,从而仅分离并测序与特定蛋白质交联的片段。 尽管具备方法学优势,免疫沉淀步骤的加入会导致测序读取在分布上不均匀,并偏向特定限制性片段,这一点必须在识别局部富集的相互作用(loops)时予以特别考虑。 来自公共 HiChIP 数据集(包含不同实验条件)的原始测序数据,首先使用 HiC-Pro进行处理,该流程对读段对进行比对和过滤。

    48110编辑于 2025-09-17
  • 来自专栏HenCoder

    HenCoder UI 部分 2-2 全新定义 View 的尺寸

    这期是 HenCoder 布局部分的第二期:重写 onMeasure() 来全新定制自定义 View 的尺寸。

    36430发布于 2018-08-20
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