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位点特异性抗体如何实现靶向蛋白降解？
靶向蛋白降解技术应运而生，其核心思想是利用细胞自身的降解系统（如泛素-蛋白酶体或溶酶体途径）来特异性清除致病蛋白，从而实现对疾病根源的更彻底干预。 对于肝脏相关疾病，人脱唾液酸糖蛋白受体因其在肝细胞表面高特异性、高丰度表达以及高效的内吞循环能力，成为一个极具吸引力的溶酶体靶向受体。 二、如何构建位点特异性的抗体-配体偶联物？抗体-配体偶联物的构建策略直接影响其稳定性、均一性及最终生物学效应。传统的随机偶联方法可能导致抗体活性丧失、药物抗体比不均一以及产物异质性高等问题。 位点特异性偶联技术旨在解决这些难题，通过在抗体分子特定位置（如重链恒定区糖基化位点）引入化学反应手柄或利用酶促反应，实现配体分子的精准、均一连接。 首先，通过酶切去除抗体Fc区域天然的N-连接聚糖，暴露出特定的糖基化位点。随后，利用糖基转移酶，将预先合成或改造的、末端携带化学反应基团的非天然糖基“安装”到该位点。
16410编辑于 2026-02-05卵巢癌突变过程驱动位点特异性免疫逃避（突变 + scRNA + 空间）
癌细胞cluster的差异在于主要组织相容性复合体(MHC)编码基因的表达 癌细胞在迁移到远端位点时具有更大的表型多样性能力。 由于突变特征的作用，观察到幼稚T细胞和功能失调T细胞的明显组成差异，在HRD-Dup肿瘤中发现了更高的表型T细胞状态多样性，并伴有非常一致的患者内部布雷-柯蒂斯指数，这表明多样化过程在患者中反复发生 结果3、 空间 + 肿瘤特征 空间分析进一步强调了位点和突变特征依赖的TMEs与基于scrna序列的观察结果一致。 小结 HGSOC TMEs的细胞成分，并将它们与突变过程和空间背景联系起来。
27310编辑于 2024-09-24- 来自专栏生信宝典
Nucleic Acids Research | 李磊团队构建单细胞遗传调控平台解析疾病位点的细胞特异性机制
全基因组关联分析（Genome-Wide Association Studies，GWAS）已经确定了数千个与复杂性状和疾病相关的遗传位点，然而超过90%的GWAS风险位点位于非编码区域，这为确定疾病相关变异的分子机制带来了极大的挑战 因此，研究人员开发了SNP与基因表达变化关联的分析方法，即表达数量性状位点（expression Quantitative Trait Locus，eQTL）将疾病变异与靶基因联系起来。 该研究建立了标准化的数据预处理和整合分析流程，将多个来源的sc-eQLT划分为三种类型：①与特定细胞类型表达相关的细胞类型特异性eQTL（Cell-type-specific eQTLs）；②与时间或细胞轨迹相关的动态 这为疾病风险位点的精细定位提供了宝贵的资源，极大地促进理解遗传变异在细胞水平上的基因调控作用。 Nat Rev Genet, 24, 535-549. 3.
1.1K30编辑于 2023-10-13 - 来自专栏DrugIntel
波士顿大学团队 探究AlphaFold3赋能隐蔽位点预测：配体・AI・隐蔽位点
Pockets》，通过系统的实验设计与深度数据分析，揭示了AlphaFold3（AF3）在隐蔽位点预测中的潜在应用价值。 “无明显活性位点”蛋白成为药物靶点； 提升药物特异性：相比天然活性位点，隐蔽位点的结构特异性更高，可减少脱靶效应； 支持创新药物形式：为变构抑制剂、分子胶、PROTACs等新型药物提供结合靶点。 例如，GluR2蛋白在输入小分子谷氨酸（无法打开隐蔽位点）时，AF3预测为闭合构象；而输入参考配体ATPO（可诱导位点开放）时，预测为开放构象；TEM蛋白与3个氙原子结合时，AF3可预测氙原子在隐蔽位点的重叠结合模式 隐蔽位点药物发现的技术赋能 AF3的预测能力为药物研发提供了多维度支撑： 靶点筛选：通过AF3生成的构象系综，可快速识别潜在隐蔽位点，拓展“不可成药”蛋白的成药可能性； 机制研究：揭示配体-构象-位点形成的协同关系 预测策略优化的建议 基于研究结果，提出针对AF3隐蔽位点预测的优化策略： 配体选择：优先使用能诱导隐蔽位点开放的特异性配体，避免构象误判； 多种子采样：通过增加随机种子数量生成足够的构象系综，覆盖配体结合的多种可能模式
29410编辑于 2026-01-16 课前准备--卵巢癌突变过程驱动位点特异性免疫逃避（单细胞 + 空间 + 基因组）
结果1、位点特异性肿瘤微环境通过scRNA-seq数据构建细胞类型图谱深入分析免疫细胞表型状态实体瘤与腹水样本在患者内部及患者间均存在高度组成差异。 特别值得注意的是，不同解剖位点的表达轨迹也存在差异：腹水样本呈现高细胞毒性模块评分，而adnexa和大网膜样本则表现出高功能障碍T细胞评分.淋巴系与髓系细胞的表型免疫状态分化与肿瘤位点密切相关，这既是肿瘤微环境患者内 解剖位点特异性免疫调控附件原发灶：富集功能障碍T细胞及调节性免疫细胞（Treg、调节性NK细胞），提示免疫抑制微环境非附件转移灶：多见幼稚/中央记忆T细胞和细胞毒性T细胞，腹水样本中树突状细胞（DC）和 M1巨噬细胞增加FBI肿瘤的附件与非附件位点间表现更高表型异质性，提示转移过程中适应性增强3. 结果4、微环境空间拓扑结构通过多重免疫荧光（mpIF）空间拓扑分析发现，高级别浆液性卵巢癌的微环境空间组织受突变特征和解剖位点双重调控：HRD-Dup型肿瘤中抗原经历性CD8⁺PD-1⁺ T细胞与PD-L1
29420编辑于 2025-09-08- 来自专栏ROBOTEDU
【RAPID】程序计算点位（上）
未完待续
73980发布于 2018-04-24 - 来自专栏ROBOTEDU
【RAPID】程序计算点位（下）
谢谢侬~
66950发布于 2018-04-24 - 来自专栏生信技能树
业余程序员GitHub项目点赞达到3位数
排在榜首的居然是我三年前的ngs流程分享，有点尴尬，不过项目点赞达到3位数还是让我有点小高兴！ ? 虽然那些ngs流程是三年前啦，但是精华内容仍然是值得初学者学习的，而且我更新了最近的学徒视频教程，可以和我3年前粗狂浅薄的代码形成鲜明的对比。 ? 的确并不是经常玩它： ?
1.1K20发布于 2018-12-29 - 来自专栏python3
3位反序数
一个3位数各位上的数字都不相同，它和它的反序数的乘积是280021，这个3位数应是多少？ +y,b) if s1*s2==280021 and s1<s2 : print s1,s2 结果： 367 763 我的思路： 因为有三位数的第一位和第三位数不能是 然后将原数和反序后的数分别存到列表中，通过reduce函数(基于lambda实现)获得两个数的整型值，最后判断两值之积是否等于280021即可； 另外，我没有判断三位数的各数是否相等，我觉得虽然如121 if t1 * t2 == 280021: print t1, t2 代码分析： 示例代码是直接算的没有保存到列表再转换(练习一下reduce的用法)，这节省了时间,而且，保证了三位数各数不相等
71910发布于 2020-01-14 - 来自专栏生信修炼手册
bismark 识别甲基化位点
在bismark中，根据甲基化的C所处的上下文环境，分成以下3类； CpG CHG CHH p代表磷酸二酯键，CpG指的是甲基化的C的下游是1个G碱基。 默认情况下，软件会自动根据两个因素生成结果文件 甲基化的C的类型 就是前面提到的CpG, CHG, CHH 3种类型 比对情况 包括比对到四条链上OT, OB, CTOT, CTOB 4种情况 所以会生成 3 X 4 = 12 个文件，对于链特异性文库来说，会生成3 X 2 = 6 个文件，这6个文件内容是类似的，都是记录了甲基化的C的染色体位置。 comprehensive选项的作用就是在生成最终文件时，只考虑3种甲基化类型，将所有的比对情况进行合并，这样最终只会生成3个文件. CHG context: 0.2% C methylated in CHH context: 0.4% test_data_bismark_bt2.M-bias.txt 定义了每一个甲基化位点的详细信息
2.5K10发布于 2020-05-09 - 来自专栏CSDN小华
概率论--上a分位点
概况 上a分位点是指在概率分布中，从右侧起的a百分位处的点。具体来说，对于一个随机变量X的概率密度函数，其上a分位点是使得该点及其右侧区域的概率为a的值。 在统计学中，分位点（或称分位数）是将数据集合分成等概率的部分的数值点。例如，中位数就是二分位数，四分位数则是将数据分为四等份的数值点。 此外，上a分位点具有对称性，即正态分布的上a分位点与下(1-a)分位点在分布曲线上关于均值对称。这表示如果已知某点是上a分位点，则其对应的对称点是下(1-a)分位点。 可以通过查阅标准正态分布表来获取这个值，例如查表得到 0.99865=3z0.99865=3 。 上a分位点与下(1-a)分位点的关系及其应用场景如下： 上a分位点与下(1-a)分位点的关系 在概率论中，上a分位点和下(1-a)分位点是关于均值对称的。
1.9K10编辑于 2024-10-16 - 来自专栏arXiv每日学术速递
3位得主提前揭晓，炫彩「量子点」摘桂冠
编辑：桃子 润 【新智元导读】今年，诺贝尔化学奖的公布没有「亿点点」意外。大奖公布前4小时，电邮外泄，3位得主提前揭晓了。 刚刚，诺贝尔化学奖开奖了。 今年，MIT的Moungi G. 在1990到1993年之间，一种 「金属有机-配位溶剂-高温」合成路线被提出，成为了量子点合成化学的突破。 这个方法发明于Bell实验室，成熟于Moungi Bawendi在MIT的课题组。 它以二甲基镉作为镉源，在高温（300摄氏度左右）、有机配位溶剂中合成高质量的硒化镉量子点。 该方法对于整个量子点领域的研究都具有里程碑式意义。 Moungi Bawendi也因此分享了诺贝尔奖。 除了已经进行了商业化落地的量子点液晶显示外，量子点在未来显示、光源技术和新能源等领域都有巨大的应用潜力。 3位诺奖得主 接下来，具体介绍下今年诺奖获得者。 Moungi G. 1993年，Bawendi带着2位博士生首次合成出高质量的「量子点」，从而推动了该领域的发展，论文被引超1万。
34520编辑于 2023-10-06 空转数据分析之特异性生态位基因依赖的细胞通讯
联合的核心也很简单，一方面需要识别细胞类型特异性生态位相关基因，另一方面结合特异性生态位相关基因的所对应的LR或者转录因子，全方位认知生态位的形成。 细胞之间的局部相互作用，如基于信号通路或细胞外基质的化学和生物力学重塑的相互作用，是高度细胞类型特异性的。因此，需要探索细胞类型特异性模型，以了解细胞基因表达程序对其局部微环境生态位的依赖性。 Niche-DE鉴定细胞类型特异性生态位相关基因，定义为与细胞类型特异性平均表达相比，在特定空间生态位背景下，特定细胞类型中的表达显著上调或下调的基因。 平台是10X Visium首先第一步：细胞解卷积，拿到空间细胞类型分布第二步，识别核心细胞类型类型的Niche-DE：由于成纤维细胞占所有样本细胞的很大一部分，并且由于癌症相关成纤维细胞是抗癌治疗的新兴靶点， 将Niche-DE应用于该样本，将成纤维细胞作为索引细胞类型，将两个亚克隆中的每一个作为生态位细胞类型，检测到每个亚克隆特异性的生态位差异表达。
84920编辑于 2024-04-09- 来自专栏气python风雨
WRFOUT 位温剖面和位温单格点高度图
在分析WRF模型输出数据时，常常需要绘制位温（Potential Temperature）剖面和位温单格点的高度图。 通过观察不同高度上的位温值，我们可以推断出对流层中的温度递减率、大气边界层的稳定性等信息。而绘制位温单格点的高度图，则能够更直观地展示不同位置的位温分布及其随高度的变化趋势。 在本文中，我们将使用WRF模型的输出数据，利用Python编程语言以及相关库（如wrf-python、numpy和matplotlib）绘制位温剖面和位温单格点的高度图。 =12) # Add a title ax.set_title("Cross-Section of Potential Temperature", fontsize=14) plt.show() 位温格点高度图 从剖面再取格点貌似绕了远路（难道我会告诉你只是剖面图的副产物吗） 这时候有同学要问了，这地形图怎么这么难看啊？都说是仓促作图。废话少说赶紧点赞。
1K10编辑于 2024-06-20 - 来自专栏新智元
3位得主提前揭晓，炫彩「量子点」摘桂冠
新智元报道 编辑：桃子 润 【新智元导读】今年，诺贝尔化学奖的公布没有「亿点点」意外。大奖公布前4小时，电邮外泄，3位得主提前揭晓了。 刚刚，诺贝尔化学奖开奖了。 在1990到1993年之间，一种 「金属有机-配位溶剂-高温」合成路线被提出，成为了量子点合成化学的突破。 这个方法发明于Bell实验室，成熟于Moungi Bawendi在MIT的课题组。 它以二甲基镉作为镉源，在高温（300摄氏度左右）、有机配位溶剂中合成高质量的硒化镉量子点。 该方法对于整个量子点领域的研究都具有里程碑式意义。 Moungi Bawendi也因此分享了诺贝尔奖。 除了已经进行了商业化落地的量子点液晶显示外，量子点在未来显示、光源技术和新能源等领域都有巨大的应用潜力。 3位诺奖得主 接下来，具体介绍下今年诺奖获得者。 Moungi G. 1993年，Bawendi带着2位博士生首次合成出高质量的「量子点」，从而推动了该领域的发展，论文被引超1万。
46220编辑于 2023-10-05 - 来自专栏用户7627119的专栏
RNA m6A位点预测
首先我们需要确定m6A究竟发生在mRNA上的什么位置，接下来才能确定究竟应该在哪里放特异性引物。 下图是一个m6A位点在mRNA上的分布图，可以看出m6A修饰倾向于富集在终止密码子附近。 以上只是一个大规模的统计结果，那么针对于不同的mRNA，m6A位点究竟存在于什么位置呢？今天就给大家介绍一个免费在线预测哺乳动物m6A修饰位点的网站SRAMP。 我们用网站默认的test1(TROVE2)序列演示一下，后面的选项都是默认的，点击“Submit”就可以预测序列的m6A结合位点了。 3. 预测结果 有两个结合位点，在“Decision”列中可以看出预测的两个结合位点具有很高的可信度。 SRAMP网站还提供了RNA二级结构m6A位点结合预测功能，写材料，发文章，有个图不是更加美观？
1.4K10编辑于 2022-09-21 - 来自专栏数据挖掘
JASPAR分析转录因子与某基因启动子的结合位点及MUT位点
JASPAR分析转录因子与某基因启动子的结合位点及MUT位点最近实验室有个分析需求，要求用JASPAR数据库预测转录因子Sox18与Itch 结合位点（物种：小鼠），需要Itch的启动子区域以及突变后的序列 位点可使用chatgpt辅助，但突变后的序列需通过验证即可）1.Itch启动子序列获取UCSC数据库中检索“Itch”（Mouse），将转录起始位点（TSS）前2000bp序列作为启动子序列（根据基因位于 序列，设置 Relative profile score threshold = 80% 进行扫描综合考虑转录起始位点（TSS）最近的位点和Relative score 较高的位点，选择以下位点Matrix Itch-MUT位点2中分析得到其结合位点为WT:5′- AAC AAT AA -3′该位点评分极高，且含有SOX 核心：CAA，距离TSS位点近，结果理想MUT位点设计，遵循完全破坏 SOX（HMG-box ），不引入新的 TF motif，AT 含量变化合理的原则进行，将“CAA”改为“TTT”MUT: 5′- AAT TTT AA -3′验证：将突变后的序列重新使用JASPAR，设置 Relative
1.5K10编辑于 2026-01-05 - 来自专栏嵌入式程序猿
2点？3点？还是多点？
1 两点校准 ? 选择两个位于屏幕对角线的点进行校准，是比较常见的校准，也是比较经典的一种校准算法，利用y=ax+b直线方程完成，一般选点的位置如下 ? 分别在据x,y轴5%的地方选取校准点，四点校准类似两点的选点标准。 2 三点校准 ? 三点校准相较于两点可以考虑参考值和采样值之间的缩放，变换和旋转，一般选择的三个点也有讲究，如下图所示 ? 3 多点校准 ? 一般大于三点的我们都叫多点校准，像常见的四点校准，五点校准，九点校准等。四点校准的选点可参照两点校准，分别选择去四个脚的点，五点和九点校准选点如下 ? ? 一般来说，选点越多，校准系数计算的越好，但是为了简化设计，一般四点就足够满足大多数应用，所以四点，五点校准比较多应用一些。 所以我们主要以四点来说明一下，以emwin的仿真环境来介绍，在emwin的下载包里有一个两点的校准例程，我们可以修改将其移植为4点校准，并可以应用于自己的产品，打开仿真环境，可以使用VS2009，或者VC6.0
1.2K10发布于 2020-09-23 - 来自专栏Linux驱动
汇编指令-bic(位清除)、orr(位或)(3)
1. bic (Bit Clear)位清除指令 bic指令的格式为： bic{条件}{S} Rd，Rn，operand bic指令将Rn 的值与操作数operand2 的反码按位逻辑”与”，结果存放到目的寄存器 指令示例： bic R0,R0,#0x1F ； //将R0最低5位清零，其余位不变。 2.orr 位或指令 orr指令的格式为： orr{条件}{S} Rd，Rn，operand orr指令将Rn 的值与操作数operand2按位逻辑”或”，结果存放到目的寄存器Rd 中。 指令示例： orr R0,R0,#0xd3 ；将R0的第[7:0]位与b'1101 0011按位或，并保存在R0中 3.eor异或指令(exclusive or) eor指令的格式为： eor{条件}{ // 对r0低5位进行清0，清除模式位 orr r0,r0,#0xd3 // 低8位或(110 10011), 设为管理(svc32)模式,禁止IRQ和FIQ中断
6.2K60发布于 2018-01-03 - 来自专栏Initial programming
初识算法 · 位运算(3)
前言： 本文的主题是位运算，通过两道题目讲解，一道是只出现一次的数字II，一道是两整数之和。 链接分别为： 137. 只出现一次的数字 II - 力扣（LeetCode） 371. ，就相对来说麻烦一点，题目的要求我们清楚了，直接进入到算法原理吧。 算法原理 虽然说是使用的异或运算，但是这里我们不妨列出一个规律： 由于整个数组中，需要找的元素只出现了「⼀次」，其余的数都出现的「三次」，因此我们可以根 据所有数的「某⼀个⽐特位」的总和 %3 的结果， 快速定位到 0 还是 1，所以我们可以通过修改每个bit位上的值，将原来的数字还原出来。 int x : nums) if (((x >> i) & 1) == 1) sum++; sum %= 3;
26510编辑于 2024-11-19
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