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  • 来自专栏蛋白表达与生物实验技术

    BioIVT生物样本体系解析:血液样本、生物体液与组织样本在药物研发中的应用

    关键词:BioIVT、生物样本血液样本、生物体液、组织样本、伦理合规样本、临床研究样本、药物研发、体外诊断一、BioIVT品牌简介BioIVT作为生物样本及研究服务提供机构,以“ElevatingScience BioIVT建立了覆盖样本采集、处理、保存、运输以及质量控制的标准化流程体系,其样本资源可覆盖及动物样本,并支持从基础研究到临床前开发等多个阶段的应用需求。 其生物体液样本库规模接近5万份,包括全血、血浆、血清、脑脊液以及其他特殊类型样本,同时还可支持健康对照以及不同疾病状态样本获取,以满足不同研究方案设计需求。 1、及动物血液样本BioIVT可提供多种以及动物血液样本资源,并支持不同类型、规格以及研究需求。其人血液样本包括全血、血浆以及血清等类型,同时支持不同抗凝体系以及指定组分处理要求。 图1:BioIVT提供人及动物血液样本2、多种特殊生物体液样本除常规血液样本外,BioIVT还可提供多种特殊生物体液资源,用于神经系统疾病研究、代谢研究以及无创检测等方向。

    11310编辑于 2026-05-26
  • 来自专栏思考是一种快乐

    5法则:小样本也有力量

    而公司员工有上千,一个一个问太费时。你并不需要得到精确的结果,有没有好的办法呢? 有一个简单的办法:你只需要随机问5即可! 这5个数字的最小值为30,最大值为60。那么,你就可以断定:所有员工通勤时间的中间值,有93.75%的可能性在30~60分钟之间。 原理 上面用到的方法叫5法则。 假如我们随机选的5个都大于或都小于中间值,那么中间值就在30~60的范围之外。这样的情况概率有多大呢? 根据定义,随机算一个值,其大于中间值的概率是50%。这个扔一个硬币,正面朝上的概率是一样的。 随机选择5个都大于中间值的概率,等于连续扔5次硬币全部正面朝上的概率。这样的概率是1/32,即3.125%。同样,所有5个都小于中间值的概率也是3.125%。 中间值在5范围(30~60)的概率 = 100% - 3.125% - 3.125% = 93.75% 有时候,一个好的测量方法,能够大大节省成本!

    1.5K10发布于 2019-09-23
  • 来自专栏医学数据库百科

    血液外泌体数据库

    旨在收集和表征血液外泌体中所有长的RNA。目前包含58330个circRNA、15501个lncRNA和18333个mRNA,并提供了注释、表达水平和可能的来源组织。 以结直肠癌为例,我们可以研究的任何潜在血液生物标志物。 首先,从“Sample types”选项的下拉列表中选择“CRC”。 其次,我们可以通过在” Tissue specificity”选择结肠,“Different group”选项中选择“CRC(up)”来选择在CRC样本中表达上调的RNA。 浏览结果以表格形式显示,该举例结果主要为mRNA在CRC样本中的表达上调和结肠组织中的特异性表达情况,该RNA可以被认为是结直肠癌患者的血液生物标志物候选物。 通过这些图,我们可以快速概览所有外泌体样本组中TRAF3,GAB2,SNX1的表达水平。 Home 通过搜索框,输入基因名称可以实现快速搜索。具体操作及结果解释同“2”。

    69120编辑于 2022-05-17
  • 来自专栏组学

    代谢组学研究中血液样本的采集与前处理

    血液样本是最常见的样本类型之一,血液在生物体内有着广泛的流动性和最重要的物质传输作用,分子成分主要包含代谢产物、生物激素、抗体、酶、无机盐等,用以反应生物体最直接、最有效代谢情况是非常合适的。 血液样本主要来源于人体采血和动物实验(例如大鼠小鼠造模),根据检测物质的不同,可以分成血浆样本和血清样本,两种样本中的代谢物总体相近,在某些种类的代谢物方面血清中数量较多,需要根据具体实验目的而确定采集哪种样本 9781449422.png 血液中含有血细胞,在采血后血细胞仍有短时间的存活,所以在采集血液样本后需要尽快分离血细胞,例如高速离心可以将微小杂质及血细胞沉淀,减少离体血细胞的代谢造成的影响。 从微观角度来说,借鉴化学反应速率常数随温度变化关系公式(阿伦尼乌斯公式),生物样本的代谢活动与样本所处温度成正相关,在-80℃或液氮(-196℃)这种极低温度下,血液中的酶或其他活性物质的活动才会减弱或停止 血液样本的前处理相比于尿液等其他类型的体液样本,过程更多也更细致一些。

    1.7K20编辑于 2021-12-24
  • 来自专栏量子位

    最新研究:宇航员血液样本中个个都带基因突变

    最近,纽约一家顶尖私立医学院公布了一项研究结论,他们收集了一些宇航员血液样本,对比了其中变异情况—— 结果发现,每个样本都有基因突变。 血液中的「CHIP」是关键 研究者选取了1998年-2001年间执行航天任务的14名宇航员,提取他们的血液样本。 △图:美国国家癌症研究所,National Cancer Institute 每位宇航员样本都有突变 通过上述方法,科学家在样本的基因中确定了34个等位基因的非同义突变,且属同受试者的每组样本均有突变情况 其中,最常出现的突变基因是TP53,出现频次为7,其次是DNTM3A,有6样本中检测出此变异。 另外,研究者还指出,目前结论样本仅来自14,后续需要进一步研究获取更多结论。 目前该项研究在网上已有不少表达看法。

    26820编辑于 2022-09-08
  • 探索SLE:基于SLE患者样本开发的血液转录模块基因的富集分析

    介绍预设基因集的文献如下,该研究建立了一种血液基因组学模块化分析方法,通过整合多数据集的共表达基因,揭示了红斑狼疮的免疫机制并开发了疾病进展监测指标。 特定细胞谱系 6 DC.M3.6, DC.M4.10, DC.M5.15 指示血液中特定免疫细胞类型的存在或浸润(如T细胞、B细胞、NK细胞、中性粒细胞、红细胞等)。 准备文件 1.GMT文件:上述与SLE 相关的血液转录模块基因集作为背景基因集。 如下图所示:第一列是模块名称,第二列是描述列或链接。第三列开始就是基因名称。 # 显示 Top 5 富集的 term # 绘制气泡图 dotplot(enrich_result, showCategory = 5) # --- 保存结果 --- # 将结果导出为数据框 result_df 分析逻辑:利用 ORA 计算每个患者样本中特定模块的富集得分(Enrichment Score)。

    22110编辑于 2026-02-04
  • 来自专栏fred 随笔

    centos5的yum

    ://vault.centos.org/5.11/os/$basearch/ gpgcheck=1 gpgkey=http://vault.centos.org/RPM-GPG-KEY-CentOS-5 vault.centos.org/5.11/updates/$basearch/ gpgcheck=1 gpgkey=http://vault.centos.org/RPM-GPG-KEY-CentOS-5 vault.centos.org/5.11/addons/$basearch/ gpgcheck=1 gpgkey=http://vault.centos.org/RPM-GPG-KEY-CentOS-5 vault.centos.org/5.11/extras/$basearch/ gpgcheck=1 gpgkey=http://vault.centos.org/RPM-GPG-KEY-CentOS-5 epel.repo root@mirrors:~# wget http://archives.fedoraproject.org/pub/archive/epel/5/x86_64/epel-release

    1.1K20编辑于 2022-06-27
  • 5-2.Binding指定

    5-2.Binding指定 指定的集中方法: 普通对象 集合 ADO.NET XML 依赖对象 DataContext 通过ElementName 通过RelativeSource ObjectDataProvider XML作为 使用XML数据作为Binding的Source时要使用XPath属性而不是Path属性来指定数据的来源 <! 所以会认为前两个TextBox应该是ObjectDataProvider的数据,但实际上,3个TextBox都是以ObjectDataProvider为数据,前两个TextBox只是在数据流上做了限制 使用Binding的RelativSource 当不确定的名字,但是知道和目标在UI上的相对关系,这时便可以使用RelativeSource属性。 RelativSource属性的数据类型为RelativeSource,可以通过这个类控制搜索相对数据的方式。

    11310编辑于 2026-06-17
  • 来自专栏运维

    CentOS 5至CentOS 5.8 YUM

    经过分析 CentOS 5至CentOs 5.7可以用同一个,  同样可以用到相应的RHEL版本 CentOS 5.8用另一个,其软件版本更新,同样可以用到相应的RHEL版本 CentOS release=5&arch=$basearch&repo=os baseurl=http://mirrors.163.com/centos/5/os/$basearch/ gpgcheck=1 gpgkey=http://mirrors.163.com/centos/5/os/x86_64/RPM-GPG-KEY-CentOS-5 #released updates [updates =1 gpgkey=http://mirrors.163.com/centos/5/os/x86_64/RPM-GPG-KEY-CentOS-5 #additional packages that =1 gpgkey=http://mirrors.163.com/centos/5/os/x86_64/RPM-GPG-KEY-CentOS-5 #additional packages that

    5.6K20发布于 2018-11-14
  • 来自专栏自律神仙ScarSu

    月刊#5 - 2021.7月信息分享

    【Grow Up With You】指路人系列 Mike Shakes[1]:从0开始自学一切 信息流管理 一个(自动化)信息流管理的案例[2] RSS收集:大多数网站都有RSS;没有RSS的网站可以上 rsshub[3]、rss.lilydjwg.me[4]找;可以在Feedly中搜索;可以用 feed43[5] 转一个;可以自己写个 serverless function 转下,部署在 now[6] 上 Feedly 工具[7]用于抓取你收集的RSS上更新的内容 笔记应用Obsidian[8]:本地化存储、工作区 文件树 管理、个人用户免费、开放丰富的插件API库、双向链接、关系图谱、思维导图。 ref=appinn [25] Octo微博相册批量下载: https://chrome.google.com/webstore/detail/octo%E5%BE%AE%E5%8D%9A%E7%9B% B8%E5%86%8C%E6%89%B9%E9%87%8F%E4%B8%8B%E8%BD%BD/cdimdlckbkfelaogjhfbkjcfncbpngkn - END -

    84860发布于 2021-07-20
  • AbMole| 化单抗动物实验黄金指南(下)

    化抗体主要指鼠单克隆抗体以基因克隆及DNA重组技术改造,重新表达的抗体,其大部分氨基酸序列为人序列取代,基本保留亲本鼠单克隆抗体的亲和力和特异性,又降低了其异性。 构建化小鼠成功后,通过超声引导将携带荧光素酶的MDA-MB-231乳腺癌细胞移植到正常成年NSG小鼠和化小鼠的心腔内,构建小鼠肿瘤模型。 Niche by Modulating Macrophage FcgR ExpressionPembrolizumab(M6102)Pembrolizumab (派姆单抗)是一种有效的、高选择性的、 将脐带血CD34 +细胞移植入BRGS(BALB/c Rag2 -/- IL-2Rγc -/- NOD.sirpa )小鼠,19周后,将从裸鼠获得的CU-ACC2-M2B PDX组织植入化hu-CB-BRGS 将脂肪来源的干细胞(ADSCs)和内皮集落形成细胞(ECFCs)按1:4的比例混合于Matrigel中后,皮下注射到雌性无胸腺Nude小鼠的腹侧。移植后三天内开始血管生成,第四天出现血液灌注。

    21910编辑于 2025-12-23
  • AbMole| 化单抗动物实验黄金指南(上)

    在NOD-SCID小鼠基础之上,人们又进一步构建了化小鼠,用以模拟人体免疫细胞应答的微环境和探索免疫系统与人类肿瘤细胞或组织之间的相互作用。常见的人化小鼠有如下2种:a. CD34+化小鼠。 待小鼠血液中人CD45阳性细胞超过25%后,为小鼠皮下接种KHOS细胞,并每隔5天以10mg/kg的剂量腹膜内注射无菌盐水或Nivolumab,总共注射五次。 ,抑制TNF-alpha,适用于及非人化小鼠。 (VEGF)抗体,适用于及非人化小鼠。 当肿瘤长至适当体积时,随机分为对照组和实验组,分别以5 mg/kg的剂量每周一次注射HuIgG和Bevacizumab。在第22天检测肿瘤体积以及Nluc活性。

    36710编辑于 2025-12-23
  • 来自专栏大数据文摘

    从VR游戏到有血液系统的机器,培养一个医生有多“血腥”?

    由于小样本偏差,有一些证据表明,游戏至少可以与传统的学习方法(如讲座和教科书)一样有效。 但是,仍需要进一步的研究来提供更严谨的理论支持,证明视频游戏在经济层面的可行性,及其能够真正为患者带来福音。 一些医院体系还使用更强大的机器假人来同时练习新旧技术。 ? 总部位于迈阿密的一家拥有70年历史的公司,高玛德科学(Gaumard Scientific)生产了一种有血液系统、会咳嗽的机器,他们会告诉医生他们的感觉,甚至还会朝医生扭头。 这些无线机器用电池运行,一次三到六个小时,将他们连接到真实的医疗设备上,可以跟踪患者在手术过程中的心率和氧气水平。 高玛德科学向全国各地的学校,消防局和教学医院提供了300种产品,其中包括能够分娩的机器,颅脑受伤的机器,受枪伤的机器人和四肢感染、需要被截肢的机器。 ?

    49710发布于 2020-03-10
  • 来自专栏大飞的部落阁

    5分钟学会本地Pypi搭建

    前言 通常我们在下载 python 包时都会选择清华源或者阿里。但是当我们的开发环境无法访问外网的时候,就需要搭建私有源。今天我们就一起花 5 分钟时间学习如何搭建一个本地私有源。 后两个适用于搭建企业级的,因为其拥有自动同步包的功能。 我们选择直接从外下载。 下载示例包 cd ~/packages pip download -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple simplejson 从本地搜索 PS C:\ Tip 此次试验搭建的仅供开发使用,如果需要搭建企业级的私有源,需要定时同步官方,建议您使用 bandsnatch 进行搭建。 以上就是今天的全部内容了,感谢您的阅读,我们下节再会。

    1.8K21编辑于 2022-06-17
  • 来自专栏生信菜鸟团

    肿瘤体细胞突变分析,应该用癌旁还是外周血作为对照

    血液样本 优点: 无肿瘤污染风险: 血液(白细胞)DNA 代表纯粹的胚系基因组,基本不存在肿瘤细胞污染问题(但白血病、淋巴瘤等血液肿瘤除外)。 选择建议 【1】首要考虑:排除克隆性造血干扰(CH): 如果研究对象是老年血液样本存在CH高风险(如特定突变检出),优先选择癌旁组织作为对照更可靠。 血液样本本身即包含肿瘤细胞,不能作为对照。 【5】技术成本与流程:使用血液样本通常流程更简单、成本更低。使用癌旁组织需额外的病理评估(确认无肿瘤)、DNA提取步骤。 通过大型人群数据库中的变体进行过滤:如dbsnp、千基因组、GnomAD等 已知的癌症数据库:COSMIC、OncoKB等 致病性:clinvar数据库、SIFT 或者 PolyPhen 致病性预测

    48110编辑于 2025-07-12
  • 来自专栏DrugOne

    . | 动物性抗体化,Weizmann院团队打造CUMAb

    用该方法人化的5个抗体与亲本动物抗体具有类似的亲和力,有些设计的稳定性还有明显提高。 之前使用AbLIFT方法部分化该抗体,光重链同源性分别为66%和57%。本研究直接对mαQSOX1使用CUMAb化。测试了5个光链和3个重链的所有组合,有12对组合的表达水平良好。 通过特异性确定残基嫁接增加人性 图5:anti-HEWL抗体的SDR移植 为进一步提高人化抗体的人性,我们将CUMAb energy-based方法应用于仅移植抗原结合关键位点(SDR)的策略。 实验表明设计1(hαHEWL)与亲本抗体相比,表达量更高、热稳定性提高了5°C(图5)。亲和力方面,hαHEWL的亲和力为44nM,略低于亲本的6.5nM。 我们分析了5个案例发现,大多数表现最好的设计并非来源于与亲本抗体序列最接近的人区段。这说明与亲本区段同源性高的人框架不一定能重建亲本抗体的稳定性和功能。

    72720编辑于 2023-09-27
  • 来自专栏Python编程爱好者

    5分钟Flink - 自定义Source

    我们可以使用SourceFunction也可以使用它的实现类,看具体情况 可以通过-非并行Source实现SourceFunction,或者通过实现ParallelSourceFunction接口或为并行扩展 RichParallelSourceFunction来编写自己的自定义 以下有四个案例,可以根据代码直接进行跑通实现 自定义Source,实现自定义&并行度为1的source 自定义Source,实现一个支持并行度的 Source,实现自定义&并行度为1的source 自定义source,实现SourceFunction接口,实现一个没有并行度的案例 功能:每隔 1s 进行自增加1 实现的方法:run(),作为数据, env.execute("StreamWithMyRichParallelSourceFunction") } } 从 “资源链接” 可以看到是执行在所有数据流最之前的,可以用来定义一些数据的连接信息 PRIMARY KEY (`id`) ) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=10 DEFAULT CHARSET=utf8 COMMENT='人员定义'; 随后插入一些数据,作为数据的内容

    7.6K20发布于 2020-09-08
  • 来自专栏腾源会

    开源与闭5 个最大区别

    相反,专有或闭软件是只有所有者才有权访问源代码的软件。闭的软件不能被外界合法更改或复制,通常付费用户才能使用该软件。 三 开源与闭5 个区别 在选择开源或是闭软件时,考虑它们的特点是很有必要的,我们在下面列出了前 5 个差异[3]: 1、价格:开源是没有许可或使用费,而闭的使用成本会取决于软件的规模等。 5、供应商锁定:开源没有供应商锁定。然而,在闭源代码中,使用专有软件要求大量投资,因此更换到不同的供应商可能会花费很多钱。 四 谁在为开源做贡献 与闭软件相比,开源具有许多优势也被更广泛地使用。 根据一项开源调查 [5],与男性相比,为开源做出贡献的女性人数非常少,因为女性更有可能遇到让她们感到不受欢迎的语言或内容以及刻板印象。 欢迎关注「腾会」公众号,期待你的「在看」

    7.6K20编辑于 2022-05-10
  • 来自专栏百味科研芝士

    5分+整合多中心临床样本构建5分子胰腺癌预后模型

    文章利用从临床搜集的胰腺导管腺癌(PDAC)病人样本,通过LASSO算法及Cox回归分析,构建5分子预后模型,同时利用生存曲线、ROC曲线和多变量Cox回归分析验证了该模型的预后价值,并评估该模型预测术后 病人样本的获取 从北京协和医院(PUMCH)获取了381个病人样本,作为模型的训练数据集;从仁济医院(RJH)获取了169个病人样本;从哈尔滨医科大学附属第一医院(HMH)获取了116个病人样本,作为模型的两个不同的验证数据集 此外,与临床病理特征不同,该5分子预测模型是唯一的在3类数据中均为独立预后因素的因素(表1)。 ? 在根据上述临床病理参数分层的大多数癌症亚组中,5分子预测模型也可有效区分不同的DSS(图3)。 5. 5分子预测模型预测ACT治疗患者预后 在所有三个数据集(整个数据集,训练数据集和验证数据集)中,接受术后ACT治疗的患者的预后均未比未接受术后ACT的患者好。 这些结果表明,5分子预测模型可能有助于区分可从ACT中获益更多的患者。 ? ? 结语 本研究利用临床收集的病例样本,旨在构建一个多分子生物标志物预测模型,以更准确地预测PDAC术后患者的预后。

    94010发布于 2020-07-15
  • 来自专栏大数据文摘

    女乔布斯,颠覆血液检测的亿万富翁

    一般而言,医生需要使用长针头和几个装血液的试管瓶完成血液采集,然后将样本送往实验室进行分析。 这些机器都很轻便,一个就能搬动。血液样本被放入机器后,下面的流程有如国家机密一般不为人知。福尔摩斯对这一分析检测过程的描述也是含糊不清:“我们加入了一种化学物质,从而引起化学反应,生成一种信号。 克拉克说,在过去的数十年中,血液分析需求的样本从两整管血液下降到1/5血液,已经有了明显进步。 的确,大型诊断实验室的流程比弗里斯特描述的更加自动化,可它依旧是一个劳动力密集型工作。 抽血工作人员会在医院和医生办公室里将血液样本贴上标签并封装,接着有人会将样本运输到中心实验室。在那里,工人手动将样本分类然后放上传送带。 福尔摩斯认为人们想要更加便利的完成血液检测,证据就是5成的人拿到医生要求进行血检医嘱后没有去验血。不过,她也承认这一数据是公司通过消费者调查内部得出的。

    92810发布于 2018-05-23
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