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  • 来自专栏单细胞测序

    单细胞测序—PBMC注释的细胞类型

    1 外周血与PBMC1.1 外周血外周血(Peripheral Blood)是循环系统中的血液,负责将氧气、营养物质、废物和免疫细胞运输到身体各个部位。外周血的组成包括血浆和血细胞两大部分。 正常成年每微升血液中约有450万至600万个红细胞。(2)白细胞(Leukocytes)白细胞是免疫系统的关键组成部分,负责抵抗感染和外来病原体。 表面标志为CD5+(B-1a 细胞)或CD5-(B-1b 细胞)。它们在胚胎期发育,具有独特的自我更新能力。(2)B-2 细胞B-2细胞是常规B细胞,存在于大多数淋巴组织和血液中。 2.3 单核细胞、CD14+ Mono、FCGR3A+ Mono单核细胞(Monocytes)是外周血中的一种重要白细胞,属于先天免疫系统的组成部分。它们在炎症反应、抗感染和组织修复中发挥关键作用。 它们占外周血白细胞的约5-10%。单核细胞起源于骨髓,由单核祖细胞(monoblasts)分化而来。功能:吞噬作用:单核细胞是强大的吞噬细胞,能够吞噬并消化病原体、受损细胞和细胞碎片。

    4K21编辑于 2024-08-15
  • 来自专栏生信宝典

    PNAS & NAT COMMUN | 北大郑晓峰揭示DNA损伤修复调控的新机制

    该研究在揭示hCINAP调控DDR的分子机制的基础上,发现在急性髓系白血病(acute myelocytic leukemia,AML)病人的外周血白细胞中,hCINAP表达量比正常人的外周血白细胞低。 此外,还构建了源肿瘤异种移植AML小鼠模型,用hCINAP敲低的恶性白血病细胞移植到AML小鼠尾静脉中,追踪观察AML小鼠的疾病发展和对化疗药物的耐药性,并且进行生存曲线分析(R语言 - 非参数法生存分析 发现在AML小鼠中进一步敲低恶性白细胞中hCINAP蛋白的表达,可以增强化疗药物的治疗效果,有助于小鼠AML疾病的治疗。 ? hCINAP参与调控DDR的分子机制及其对AML白细胞耐药性的影响 北京大学郑晓峰课题组的博士研究生臧维成为PNAS论文第一作者,徐瑞丹为Nature Communications论文的第一作者。 https://www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.1910250116 https://www.nature.com/articles/s41467-019-11795-5

    91710发布于 2019-12-12
  • 白细胞介素-5(IL-5)的分子特性与免疫调节功能

    一、引言白细胞介素-5(IL-5)是一种主要由Th2型T细胞及肥大细胞分泌的多效性细胞因子,在调控特定白细胞谱系的发育与功能中发挥关键作用。 基于对IL-5分子机制的深入理解,针对IL-5的检测需求催生了相应免疫分析工具的开发,其中人IL-5试剂盒(HICA)即为核心应用之一。 IL-5基因定位于第5号染色体长臂,与IL-3、IL-4、粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子(GM-CSF)等造血相关细胞因子基因呈紧密连锁分布;小鼠IL-5基因则位于第11号染色体。 鼠IL-5在氨基酸序列水平同源性约为70%,且存在交叉生物学活性,提示该分子在进化过程中具备高度功能保守性,这一特性为人IL-5试剂盒(HICA)在基础研究及临床检测中的交叉应用提供了可行性依据。 在黏膜免疫研究领域,IL-5试剂盒(HICA)已被广泛应用于各类实验模型中IL-5表达水平的精确定量分析。

    8810编辑于 2026-02-24
  • 来自专栏单细胞天地

    外周血中PBMC细胞的分离流程

    其中血浆作为运载细胞,营养物质及代谢物的循环液体,主要成分是水(约占90%),其次是细胞蛋白,酶,激素等物质;另外的一部分是血细胞主要包含红细胞,白细胞及血小板三个大类。 在血细胞中存在着参与机体免疫应答,调控相关的一类细胞,我们统称为外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC),是外周血中具有单个核的细胞(Mononuclear 血液样本及血液组织示意图 根据单个核细胞的体积、形态和比重与外周血其他细胞不同,红细胞和多核白细胞的比重在1.092左右,单个核细胞的比重为1.075-1.090,血小板为1.030-1.035。 在室温平衡血液和 Ficoll(样本密度分离液) 30 min;冰上操作以下实验,在 15 mL 离心管中一次分别加入外周血和1× DPBS(外周血:1×DPBS=1:1)各 1mL,移液枪轻轻吹打5次稀释混匀 制备结果 细胞量:200万左右,活率95%以上,结团率5% 注意:联川生物几百例单细胞测序样本经验提示:离体后的外周血样本需在8小时内进行分离,尽量不要超过12小时,特别是做5’免疫组(VDJ)测序的样本最好在

    7.8K31发布于 2021-10-09
  • Th2极化套装的组成与应用研究

    其核心组分包括白细胞介素-2(IL-2)、白细胞介素-4(IL-4)、抗分化簇3(CD3)单克隆抗体、抗分化簇28(CD28)单克隆抗体、抗白细胞介素-4(IL-4)单克隆抗体、抗干扰素-γ(IFN-γ GATA3作为Th2细胞的主转录因子,一方面促进IL-4、IL-5和IL-13等Th2型细胞因子的表达,另一方面通过抑制STAT4和T-box转录因子21(T-bet),进一步巩固Th2分化方向,形成正反馈调控环路 实验首日需完成抗CD3单克隆抗体的包被步骤,将其稀释至5微克每毫升的工作浓度后加入培养板,在37摄氏度条件下孵育2小时或4摄氏度过夜。 次日,从健康供体外周血中分离初始CD4⁺ T细胞,调整密度至1×10⁶细胞每毫升,重悬于含有IL-2、IL-4、抗IFN-γ单克隆抗体、抗CD28单克隆抗体及β-巯基乙醇的完全培养基中,接种至包被孔内进行培养 培养至第5天,可通过流式细胞术检测Th2极化效率。检测前需用佛波酯(PMA)、离子霉素和布雷菲德菌素A(BFA)对细胞进行再刺激,以捕获细胞内细胞因子的表达情况。

    9810编辑于 2026-03-16
  • 来自专栏技术文章

    Elabscience 手把手教学:中性粒细胞流式从样本准备到数据分析全拆解

    不同实验目的标志物组合参考样本类型推荐方案及核心标记物应用人外周血常规检测:CD45/CD15/CD16基础表型鉴定,快速、标准地圈定外周血中性粒细胞群。 产品名称货号应用PE/Cyanine7 Anti-Human CD3 Antibody[OKT-3]E-AB-F1001H外周血粒细胞检测9色Panel参考Elab Fluor® Violet 540 外周血白细胞流式染色实验结果图。 , κ Isotype Control[MM-30] (E-AB-F09782S)(右)对外周血白细胞进行流式染色表2. 外周血粒细胞检测9色Panel参考产品名称货号应用PE/Cyanine7 Anti-Human CD3 Antibody[OKT-3]E-AB-F1001H外周血粒细胞检测9色Panel参考Elab

    30010编辑于 2026-01-19
  • 来自专栏生信菜鸟团

    【生信文献200篇】65 狼疮性肾炎患者肾脏免疫细胞图谱

    03 数据及方法 分组情况 LN患者和健康的肾脏(kidney)、尿液(urine)和血液(blood)样本 样本准备 研究人员按照图a的流程分析肾脏和尿液样本的细胞成分和分子状态的方法。 结果发现约一半的 LN 样本的白细胞产量远高于对照样本,包括 B细胞、T细胞、巨噬细胞和其他白细胞。 b)LN活检中按肾小球肾炎分级分类的白细胞数量。c)流式细胞术评估活检样本中B细胞、T细胞、单核细胞/巨噬细胞或其他白细胞的比例。 发现绝大多数外周血 CD16 细胞与 CM0 簇最相似,少数细胞映射到 CM1 或 CM3,没有细胞映射到 CM4 或 CM2。 据报道,SLE 患者外周血 CD8+ T 细胞中的耗竭特征与较低的发作率相关,并且在狼疮小鼠的肾脏中也检测到这种耗竭的 T 细胞。

    2.4K21发布于 2021-09-17
  • 来自专栏用户7627119的专栏

    你不知道的PBMC

    指外PBMC(peripheral blood mononuclear cell,外周血单核细胞),指外周血中具有单个核的细胞,包含淋巴细胞、单核细胞等。 外周血中除单个核细胞外,还包含无核的血小板和成熟的红细胞,多核的粒细胞(granulocytes) 。 【人类PBMC的起源和衍生】 外周外周血单核细胞来源于骨髓中的造血干细胞(HSCs)。 【提取PBMC常见问题解答】 1.外周血单个核细胞分离后培养,有很多针尖大小的圆形细胞,是什么东西,如何去除? 可能可能是血小板。血小板密度低,主要在血浆中,吸膜层需要注意,尽量不吸到过多血浆。 LAK疗法是将健康外周血单核白细胞 (PBL)在体外培养,经淋巴因子白介素2 (IL-2)激活后扩增,回输至患者体内从而广谱地杀伤肿瘤细胞(杀伤对NK细胞不敏感的肿瘤细胞)的治疗方法。 随后陆续有学者在的冻胚和鲜胚移植周期、以及母牛的子宫进行了相关的研究,均得到了类似的结果。目前的临床数据显示,PBMCs治疗大幅度提高了反复着床失败患者的胚胎种植率和临床妊娠率。 ?

    7.6K31发布于 2020-08-05
  • 来自专栏单细胞天地

    单细胞测序技术在循环肿瘤细胞检测中的应用

    CTC 可用于通过外周血分析监测肿瘤进展的观点已得到广泛认可。但由于外周血中 CTC 的丰度相对于血细胞数量较低,因此很难将它们与其他血细胞区分开来。 基于细胞表面标志物的富集:主要包括正选择和负选择,即抗上皮细胞粘附分子(EpCAM)和角蛋白(cytokeratin,CK)等抗体捕获和富集上皮来源的肿瘤细胞和/或利用白细胞-衍生抗体以去除白细胞。 研究表明,外周血中 CTC 的出现是上皮来源实体瘤形成的早期事件;外周血中的 CTC 可以同时或双向刺激原发性和转移性肿瘤中肿瘤细胞的生长。 通过多功能机器系统自动检索单细胞和细胞克隆,实现单细胞分选,直接机械分离目标细胞或克隆,不影响细胞活力,实时、高精度观察细胞图像进行细胞分选;但是,这种方法很耗时 单细胞全基因组扩增 单个细胞的DNA MALBAC) :一种线性扩增方法,由于所用 Taq DNA 聚合酶保真度低,该方法检测 SNV 的假阳性率较高(约为 MDA 的 40 倍) 转座子插入线性扩增(LIANTI):引入了一个特殊设计的Tn5转座子

    2.3K20编辑于 2022-03-14
  • 来自专栏CSDNToQQCode

    血常规(自动生成报告)(配套Python工具正在编码中)

    孕妇在妊娠中后期、老年或6个月-2岁婴幼儿会有正常的生理性降低,婴幼儿主要因为生长发育迅速而引起的造血系统造血的相对不足。妊娠中期和后期由于妊娠血容量增加而使血液被稀释。 老年由于骨髓造血功能逐渐降低,可导致红细胞和血红蛋白含量减少。 5红细胞体积分布宽度(RDW) 红细胞体积分布宽度反应外周血红细胞体积异质性的参数。简而言之,是反映红细胞大小不等的客观指标。一般通过RDW和MCV这两个参数进行贫血的形态学分类。 二、白细胞系统(反应免疫状态) 1、白细胞(WBC) 白细胞生理性 ↑↑:妊娠期(特别是妊娠20周后),新生儿及激烈运动过后,冷热水浴后、紫外线照射、妇女月经期和排卵期、情绪激动。 一、基础版本·只对数据高低进行分析 1、手工输入 2、图像识别 二、整体版本·根据总体数据进行分析(数据体量达到5万之前不发布)

    69410编辑于 2023-03-09
  • 来自专栏生信菜鸟团

    Nature immunoloy | 新冠肺炎患者的单细胞免疫图谱

    该团队对5例健康人和13例新冠肺炎病人的外周血进行了单细胞测序。通过确定免疫细胞的转录谱,结合组装好的T细胞受体和B细胞受体序列,分析免疫细胞的功能特性。 结果 外周免疫细胞的单细胞转录谱 用10X技术对13例COVID-19患者(中度、重度和恢复期)和5例健康外周血进行单细胞测序。 发现新冠肺炎患者外周血中主要细胞亚群对IFN-α的反应一致且显著的上调,在重症患者中,几乎所有主要细胞类型中均显示最高值。 ? ? 在先天免疫细胞中观察到强烈的干扰素反应 为了进一步研究SARS-CoV-2感染后先天免疫细胞的转录组变化,我们比较了中度或重度与对照组的CD14+和CD16+单核细胞的表达情况,发现显著差异表达基因参与了干扰素反应、骨髓白细胞激活 转录组数据,结合详细的TCR和基于BCR的谱系信息,可以为深入了解COVID-19患者的外周血淋巴细胞提供丰富的资源,为合理设计治疗方案和开发新冠肺炎的治疗方法铺平道路。

    2.9K30发布于 2020-08-21
  • 来自专栏作图丫

    细数免疫应答中重要的细胞因子

    1.白细胞介素(interleukin,IL) 2.集落刺激因子(colony-stimulating factor, CSF) 3.干扰素(inteferon, IFN) 4.肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor, TNF) 5.生长因子(growth factor, GF) 6.趋化因子(chemokin) 固有免疫应答中的重要细胞因子 细胞因子 细胞来源 主要生物学效应 、某些表皮细胞 1)活化内皮细胞、介导炎症;2)引起发热;3)促进肝脏合成急性期蛋白;4)诱导Th17细胞分化;5)诱导抗原提呈细胞上调MHC II类分子、黏附分子以及IFN-r的表达; IL-6 单核 树突状细胞 1)维持并稳定Th17细胞分泌IL-17;2)诱导T淋巴母细胞和记忆性T细胞产生IFN-r,并促进其增殖; IL-27 巨噬细胞、树突状细胞 1)诱导Th1细胞分化;2)抑制Th17细胞;3)抑制外周血 T细胞转变为Treg;4)限制中枢神经系统、眼睛、胎盘等部位炎症反应; 趋化因子 巨噬细胞、内皮细胞、T细胞、成纤维细胞、血小板 趋化白细胞进入组织局部,活化白细胞; Type I IFNs IFN-a

    1.7K20编辑于 2022-03-29
  • 来自专栏作图丫

    Nature Communication|解析非小细胞肺癌的免疫组库

    数据介绍 肺癌患者:236个初治NSCLC患者,每例患者都采集其癌组织样本、癌旁样本、外周血白细胞(PBMC); 慢性阻塞性肺疾病患者:11例无肺癌的慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者; 健康对照样本:24 例健康的肺组织。 5.PBMC,癌症,癌旁的TCR overlap a-c图:PBMC与肺癌组织、与癌旁组织所share的克隆较少,癌组织和癌旁组织的overlap显著更高。 图:PBMC T cell density越高,有更好的OS b-c图:癌旁的T cell density和clonality越高,有更好的OS 小编总结 作者检测了NSCLC的癌组织、癌旁组织、外周血

    89441编辑于 2022-03-29
  • AbMole| 源化单抗动物实验黄金指南(上)

    该品系小鼠可以通过移植脐带血CD34+细胞,在免疫缺陷鼠NOG/NPG体内重建免疫系统后获得。特别适用于免疫肿瘤学、传染病、宿主-抗体疾病的长期研究。b. PBMC(外周血单核细胞)源化小鼠。 该品系小鼠则多通过静脉注射或腹腔注射分离的人外周血单核细胞入免疫缺陷鼠并重建免疫系统后获得。适合用于研究T细胞调节的药物及感染和免疫排斥研究。 待小鼠血液中人CD45阳性细胞超过25%后,为小鼠皮下接种KHOS细胞,并每隔5天以10mg/kg的剂量腹膜内注射无菌盐水或Nivolumab,总共注射五次。 当肿瘤长至适当体积时,随机分为对照组和实验组,分别以5 mg/kg的剂量每周一次注射HuIgG和Bevacizumab。在第22天检测肿瘤体积以及Nluc活性。 培养来自于正常健康白细胞供体的外周血单核细胞(PBMC),并用不同浓度的SEB刺激。然后将10μg/mL的Ipilimumab,Nivolumab或HuIgG4同种型对照加入其中。

    26210编辑于 2025-12-23
  • 来自专栏单细胞天地

    单细胞水平分析红斑狼疮异质性

    Immunology上 在线阅读链接:https://doi.org/10.1038/s41590-020-0743-0 单细胞实验设计 对33名儿童SLE患者(cSLE)和11名对照组进行了约276,000个外周血单个核细胞 JB17001] GSM4029897 cSLE2 [JB17002] GSM4029898 cSLE3 [JB17003] GSM4029899 cSLE4 [JB17004] GSM4029900 cSLE5 five CD8+ T cell clusters 通过BioinfoArk提供的中国区chatGPT查询到各个细分亚群的解释: 树突状细胞(Dendritic cells, DCs):这是一种专门的白细胞 单核细胞(Monocytes, CD14+ and CD16+):这是一种白细胞,可以进入组织变成巨噬细胞,吞噬病毒和细菌。 对来自成年SLE患者的约82,000个外周血单个核细胞(PBMCs)的分析证实了在疾病活动度最高的患者中存在类似的亚群扩增。

    46140编辑于 2023-10-06
  • 来自专栏单细胞天地

    “成熟”:中性粒细胞命运的十字路口?

    然而,也有其他作者记录了即使在成熟中性粒细胞计数高(由于总白细胞计数高)的情况下,仍然发生了严重的细菌感染。 研究方法和材料部分描述了对36名急性白血病患者的临床观察,包括他们的血液学诊断、白细胞计数、血红蛋白水平、血小板计数等。 在急性白血病患者中,细菌感染的发作通常是由外周血成熟中性粒细胞数量的动态减少所造成的。在18名患者中,有17名在感染发作前成熟中性粒细胞计数下降,与无感染期相比,中位数减少了54%。 Heterogeneity of neutrophils 通常情况下,中性粒细胞只有在骨髓中发育成熟后才会进入外周血

    85610编辑于 2024-06-25
  • 来自专栏集智书童

    MFDS-DETR开源 | HS-FPN多级特征融合+Deformable Self-Attention,再续DETR传奇

    [5]提出了基于改进的YOLOv5白细胞检测模型YOLOv5-CHE。该模型解决样本缺乏和类别差异问题,通过将坐标注意力机制集成到卷积层中,增强了模型的特征提取能力。 然而,这些关于白细胞目标检测的研究使用卷积神经网络(CNNs)来提取特征,然后进行目标定位和分类。这种方法受到卷积运算符的影响,无法学习白细胞图像的全局特征,从而阻碍了外周血白细胞的准确定位和分类。 图5显示了来自每个数据集的白细胞图像,而表1和表2详细列出了每个数据集中各种细胞类型的数量。 作者从多个当地医院获取了WBCDD数据集。 L1SC数据集是一个早期的白细胞数据集,由健康个体的外周血样本衍生而来。 此外,作者的模型MFDS-DETR在当前最先进的白细胞检测方法(TE-YOLOF和YOLOv5-ALT)中脱颖而出。

    8.4K10编辑于 2024-01-10
  • 靶向TGF-β2:重塑免疫抑制性肿瘤微环境以增强抗肿瘤免疫

    1.治疗策略设计:研究采用TGF-β2反义寡核苷酸(TASO)来特异性抑制肿瘤微环境中TGF-β2蛋白的产生,并联合应用免疫刺激因子白细胞介素-2,旨在同时解除免疫抑制并激活抗肿瘤免疫应答。 2.主要发现:-增强细胞毒性:TASO处理能显著增强IL-2刺激的人外周血单个核细胞对胰腺癌细胞的体外杀伤活性。-抑制肿瘤生长:在动物模型中,TASO联合IL-2治疗能有效延缓胰腺癌的生长。 -调节免疫细胞组成:联合治疗显著减少了外周血和肿瘤组织中的Foxp3+调节性T细胞,同时增加了促炎细胞因子(如IFN-γ、TNF-α)的产生,降低了抗炎细胞因子(如TGF-βs)的水平,从而将免疫微环境从抑制状态向促炎

    14810编辑于 2026-01-30
  • 来自专栏生信宝典

    Nature系列 | 整合单细胞转录组学和质谱流式确定类风湿性关节炎滑膜组织中的炎症细胞状态 | 详细解读

    Utilizing an integrated strategy based on canonical correlation analysis of 5,265 scRNA-seq profiles, 然后作者进行以下条件的筛选:(1)细胞检测到的genes数>1000;(2)线粒体相关基因的表达占比少于25%; 质谱流式+scRNA-seq 作者收集6个富含白细胞、9个白细胞缺乏的RA和11个OA样品用于质谱流式分析 (3)单细胞分析揭示不同细胞亚型;在5,265个细胞中发现1,142 B cells, 1,844 fibroblasts, 750 monocytes and 1529 T cells (作者在这里说明传统基于 (这个只需一步就可做富集分析的网站还未发表就被CNS等引用超过350次) (5)激活状态定义了滑膜单核细胞的异质性;在来自患有白细胞丰富的RA和OA的个体的大量RNA-seq单核细胞样品中,作者发现与IL1B SC-B3)和浆母细胞(SC-B4);SC-B3细胞表达高水平的ITGAX和TBX21(T-bet),它们是自身免疫相关B细胞的标志物,AICDA的高表达与最近报道的来自系统性红斑狼疮(SLE)样品的外周血

    6.3K54发布于 2019-06-05
  • 来自专栏百味科研芝士

    令人眼前一亮的5分+免疫浸润新套路!

    标题:Tumor immune microenvironment in cancer patients with leukocytosis 白细胞增多肿瘤患者的肿瘤免疫微环境 一、研究背景 肿瘤相关白细胞 (TRL)指肿瘤患者外周血中异常升高的白细胞。 进行生存分析后作者发现,高LS组的病人预后显著差于低LS组(图5a)。此外,高LS组肿瘤相对于低LS组的MDSC signature评分显著更高(图5b)。 图5a.泛癌队列中高低LS组与预后;图5b.泛癌队列中高低LS组与MDSC signature;图5c.泛癌队列中高低LS组与免疫相关过程 对泛癌队列的生存分析提示在肾上腺皮质癌,膀胱尿路上皮癌,头颈鳞状细胞癌 小结 作者从一个在某些肿瘤患者中观测到的异常指标——肿瘤相关白细胞入手,并通过将LS分数作为无白细胞计数患者的替代指标而使研究可以从8名患者的数据延拓到TCGA CESC数据集以至于TCGA的泛癌数据。

    2K40发布于 2020-11-04
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