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单细胞测序—PBMC注释的细胞类型
正常成年人每微升血液中约有450万至600万个红细胞。（2）白细胞（Leukocytes）白细胞是免疫系统的关键组成部分，负责抵抗感染和外来病原体。 单核细胞（Monocytes），占白细胞的3-8%，单核细胞在血液中循环，迁移到组织后分化为巨噬细胞或树突状细胞，参与吞噬和抗原呈递。 （3）血小板（Platelets, Thrombocytes）血小板是骨髓巨核细胞的胞质片段，无细胞核，正常成年人每微升血液中有约15万至45万个血小板。 2.3 单核细胞、CD14+ Mono、FCGR3A+ Mono单核细胞（Monocytes）是外周血中的一种重要白细胞，属于先天免疫系统的组成部分。它们在炎症反应、抗感染和组织修复中发挥关键作用。 它们占外周血白细胞的约5-10%。单核细胞起源于骨髓，由单核祖细胞（monoblasts）分化而来。功能：吞噬作用：单核细胞是强大的吞噬细胞，能够吞噬并消化病原体、受损细胞和细胞碎片。
4K21编辑于 2024-08-15 - 来自专栏生信宝典
PNAS & NAT COMMUN | 北大郑晓峰揭示DNA损伤修复调控的新机制
2019年12月3日，《美国科学院院报》（PNAS）在线发表了北京大学生命科学学院郑晓峰研究组的题为“Cellular redox sensor HSCARG negatively regulates 该研究在揭示hCINAP调控DDR的分子机制的基础上，发现在急性髓系白血病（acute myelocytic leukemia，AML）病人的外周血白细胞中，hCINAP表达量比正常人的外周血白细胞低。 此外，还构建了人源肿瘤异种移植AML小鼠模型，用hCINAP敲低的恶性白血病细胞移植到AML小鼠尾静脉中，追踪观察AML小鼠的疾病发展和对化疗药物的耐药性，并且进行生存曲线分析(R语言 - 非参数法生存分析 发现在AML小鼠中进一步敲低恶性白细胞中hCINAP蛋白的表达，可以增强化疗药物的治疗效果，有助于小鼠AML疾病的治疗。 ? hCINAP参与调控DDR的分子机制及其对AML白细胞耐药性的影响 北京大学郑晓峰课题组的博士研究生臧维成为PNAS论文第一作者，徐瑞丹为Nature Communications论文的第一作者。
91710发布于 2019-12-12 - 来自专栏单细胞天地
外周血中PBMC细胞的分离流程
其中血浆作为运载细胞，营养物质及代谢物的循环液体，主要成分是水（约占90%），其次是细胞蛋白，酶，激素等物质；另外的一部分是血细胞主要包含红细胞，白细胞及血小板三个大类。 在血细胞中存在着参与机体免疫应答，调控相关的一类细胞，我们统称为外周血单个核细胞（Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)，是外周血中具有单个核的细胞（Mononuclear 血液样本及血液组织示意图 根据单个核细胞的体积、形态和比重与外周血其他细胞不同，红细胞和多核白细胞的比重在1.092左右，单个核细胞的比重为1.075-1.090，血小板为1.030-1.035。 红细胞裂解： I．使用宽口枪头弃上清，加入300μl 1640培养基（含5%FBS）轻轻重悬细胞，后加入红细胞裂解液3mL，置于4℃（冰上），裂红计时 3min；如细胞悬液中红细胞较多（如：PBMC） 清洗：离心完成后，从离心机中取出富集了细胞沉淀的离心管，巴斯吸管弃除上清；加入3mL-5mL 的1640（含5%FBS）培养基(注：按照每个米粒大小的细胞沉淀用量3mL的参考标准加入清洗培养基)，使用宽口枪头
7.8K31发布于 2021-10-09 人Th2极化套装的组成与应用研究
其核心组分包括白细胞介素-2（IL-2）、白细胞介素-4（IL-4）、抗分化簇3（CD3）单克隆抗体、抗分化簇28（CD28）单克隆抗体、抗人白细胞介素-4（IL-4）单克隆抗体、抗人干扰素-γ（IFN-γ 白细胞介素-4是驱动Th2极化的关键细胞因子，其通过激活信号转导及转录激活因子6（STAT6）信号通路，诱导GATA结合蛋白3（GATA3）等Th2特异性转录因子的表达。 STAT6磷酸化后形成二聚体转位至细胞核，直接结合于GATA3基因座，启动其转录。 次日，从健康供体外周血中分离初始CD4⁺ T细胞，调整密度至1×10⁶细胞每毫升，重悬于含有IL-2、IL-4、抗人IFN-γ单克隆抗体、抗CD28单克隆抗体及β-巯基乙醇的完全培养基中，接种至包被孔内进行培养 Th0组使用含抗人IL-4单克隆抗体和抗人IFN-γ单克隆抗体的培养基，在不添加极化细胞因子的条件下培养，确保T细胞维持在初始未极化状态。
9810编辑于 2026-03-16- 来自专栏用户7627119的专栏
你不知道的PBMC
指外PBMC（peripheral blood mononuclear cell，外周血单核细胞），指外周血中具有单个核的细胞，包含淋巴细胞、单核细胞等。 外周血中除单个核细胞外，还包含无核的血小板和成熟的红细胞，多核的粒细胞(granulocytes) 。 【人类PBMC的起源和衍生】 外周外周血单核细胞来源于骨髓中的造血干细胞(HSCs)。 【提取PBMC常见问题解答】 1.人外周血单个核细胞分离后培养，有很多针尖大小的圆形细胞，是什么东西，如何去除？ 可能可能是血小板。血小板密度低，主要在血浆中，吸膜层需要注意，尽量不吸到过多血浆。 LAK疗法是将健康人外周血单核白细胞 (PBL)在体外培养，经淋巴因子白介素2 (IL-2)激活后扩增，回输至患者体内从而广谱地杀伤肿瘤细胞（杀伤对NK细胞不敏感的肿瘤细胞）的治疗方法。 随后陆续有学者在人的冻胚和鲜胚移植周期、以及母牛的子宫进行了相关的研究，均得到了类似的结果。目前的临床数据显示，PBMCs治疗大幅度提高了反复着床失败患者的胚胎种植率和临床妊娠率。 ?
7.6K31发布于 2020-08-05 - 来自专栏技术文章
Elabscience 手把手教学：中性粒细胞流式从样本准备到数据分析全拆解
过200目筛网去除组织碎片；3. 红细胞裂解+洗涤离心（同外周血）l 筛网过滤步骤不可少，避免碎片干扰后续细胞分群组织样本（如肺、脾）1. 产品名称货号应用PE/Cyanine7 Anti-Human CD3 Antibody[OKT-3]E-AB-F1001H人外周血粒细胞检测9色Panel参考Elab Fluor® Violet 540 人外周血白细胞流式染色实验结果图。 Antibody[G10F5] (E-AB-F1267S)（左）及Elab Fluor® Red 780 Mouse IgM， κ Isotype Control[MM-30] （E-AB-F09782S）（右）对人外周血白细胞进行流式染色表 人外周血粒细胞检测9色Panel参考产品名称货号应用PE/Cyanine7 Anti-Human CD3 Antibody[OKT-3]E-AB-F1001H人外周血粒细胞检测9色Panel参考Elab
30010编辑于 2026-01-19 - 来自专栏生信菜鸟团
【生信文献200篇】65 狼疮性肾炎患者肾脏免疫细胞图谱
03 数据及方法 分组情况 LN患者和健康人的肾脏（kidney）、尿液（urine）和血液（blood）样本 样本准备 研究人员按照图a的流程分析肾脏和尿液样本的细胞成分和分子状态的方法。 结果发现约一半的 LN 样本的白细胞产量远高于对照样本，包括 B细胞、T细胞、巨噬细胞和其他白细胞。 b）LN活检中按肾小球肾炎分级分类的白细胞数量。c）流式细胞术评估活检样本中B细胞、T细胞、单核细胞/巨噬细胞或其他白细胞的比例。 d）活检样本中B细胞在白细胞中的百分比 e）通过主成分分析(PCA)预测肾细胞在PC1-PC2(左)和PC2-PC3(右)平面的基因表达数据。 发现绝大多数外周血 CD16 细胞与 CM0 簇最相似，少数细胞映射到 CM1 或 CM3，没有细胞映射到 CM4 或 CM2。
2.4K21发布于 2021-09-17 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序技术在循环肿瘤细胞检测中的应用
CTC 可用于通过外周血分析监测肿瘤进展的观点已得到广泛认可。但由于外周血中 CTC 的丰度相对于血细胞数量较低，因此很难将它们与其他血细胞区分开来。 基于细胞表面标志物的富集：主要包括正选择和负选择，即抗上皮细胞粘附分子（EpCAM）和角蛋白（cytokeratin，CK）等抗体捕获和富集上皮来源的肿瘤细胞和/或利用白细胞-衍生抗体以去除白细胞。 研究表明，外周血中 CTC 的出现是上皮来源实体瘤形成的早期事件；外周血中的 CTC 可以同时或双向刺激原发性和转移性肿瘤中肿瘤细胞的生长。 通过多功能机器人系统自动检索单细胞和细胞克隆，实现单细胞分选，直接机械分离目标细胞或克隆，不影响细胞活力，实时、高精度观察细胞图像进行细胞分选；但是，这种方法很耗时 单细胞全基因组扩增 单个细胞的DNA 例如，在结直肠癌研究中，发现了不同 CTC 中的 BRAF、PIK3CA 和 KRAS 突变，表明个体之间和同一个体内部都存在大量肿瘤异质性；在恶性黑色素瘤中， BRAF 和 KIT 突变的测序揭示了
2.3K20编辑于 2022-03-14 - 来自专栏生信菜鸟团
Nature immunoloy | 新冠肺炎患者的单细胞免疫图谱
该团队对5例健康人和13例新冠肺炎病人的外周血进行了单细胞测序。通过确定免疫细胞的转录谱，结合组装好的T细胞受体和B细胞受体序列，分析免疫细胞的功能特性。 结果 外周免疫细胞的单细胞转录谱 用10X技术对13例COVID-19患者（中度、重度和恢复期）和5例健康人的外周血进行单细胞测序。 发现新冠肺炎患者外周血中主要细胞亚群对IFN-α的反应一致且显著的上调，在重症患者中，几乎所有主要细胞类型中均显示最高值。 ? ? 在先天免疫细胞中观察到强烈的干扰素反应 为了进一步研究SARS-CoV-2感染后先天免疫细胞的转录组变化，我们比较了中度或重度与对照组的CD14+和CD16+单核细胞的表达情况，发现显著差异表达基因参与了干扰素反应、骨髓白细胞激活 +)的6种亚型、CD8+ T细胞的3种亚型(CD3E+CD8A+)和3种NKT细胞亚型(CD3E + CD4-CD8A-TYROBP +)。
2.9K30发布于 2020-08-21 - 来自专栏CSDNToQQCode
血常规(自动生成报告)(配套Python工具正在编码中)
孕妇在妊娠中后期、老年人或6个月-2岁婴幼儿会有正常的生理性降低，婴幼儿主要因为生长发育迅速而引起的造血系统造血的相对不足。妊娠中期和后期由于妊娠血容量增加而使血液被稀释。 老年人由于骨髓造血功能逐渐降低，可导致红细胞和血红蛋白含量减少。 3、红细胞比容(HCT) 红细胞所占全血的百分比就是红细胞比容。HCT的测定有助于了解红细胞的增多与减少，临床上常用于了解脱水病人的血液浓缩程度，作为计算补液量的参考。 5红细胞体积分布宽度(RDW) 红细胞体积分布宽度反应外周血红细胞体积异质性的参数。简而言之，是反映红细胞大小不等的客观指标。一般通过RDW和MCV这两个参数进行贫血的形态学分类。 二、白细胞系统（反应免疫状态） 1、白细胞(WBC) 白细胞生理性 ↑↑：妊娠期（特别是妊娠20周后），新生儿及激烈运动过后，冷热水浴后、紫外线照射、妇女月经期和排卵期、情绪激动。
69410编辑于 2023-03-09 - 来自专栏作图丫
Nature Communication|解析非小细胞肺癌的免疫组库
背景介绍 T细胞受体中有一段高度可变区域，即CDR3区域，机体内所有的T细胞受体构成了T细胞受体库(T cell repertoire，TCR)，我们称其为免疫组库（关于免疫组库介绍）。 基于对CDR3区域的靶向测序，可以识别T细胞的克隆以及它们的频率（关于TCR指标链接），借此来判断是否存在抗原反应。 数据介绍 肺癌患者：236个初治NSCLC患者，每例患者都采集其癌组织样本、癌旁样本、外周血白细胞(PBMC)； 慢性阻塞性肺疾病患者：11例无肺癌的慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者; 健康对照样本：24 例健康人的肺组织。 图:PBMC T cell density越高，有更好的OS b-c图:癌旁的T cell density和clonality越高，有更好的OS 小编总结 作者检测了NSCLC的癌组织、癌旁组织、外周血的
89441编辑于 2022-03-29 AbMole| 人源化单抗动物实验黄金指南(上)
该品系小鼠可以通过移植人脐带血CD34+细胞，在免疫缺陷鼠NOG/NPG体内重建免疫系统后获得。特别适用于免疫肿瘤学、传染病、宿主-抗体疾病的长期研究。b. PBMC（外周血单核细胞）人源化小鼠。 该品系小鼠则多通过静脉注射或腹腔注射分离的人外周血单核细胞入免疫缺陷鼠并重建免疫系统后获得。适合用于研究T细胞调节的药物及感染和免疫排斥研究。 对荷瘤小鼠进行腹腔注射3次，每次间隔3天。由于Avelumab是人IgG1，因此必须在7-9天的窗口内集中注射3次，以避免中和小鼠抗人Ig的出现。 培养来自于正常健康白细胞供体的外周血单核细胞（PBMC），并用不同浓度的SEB刺激。然后将10μg/mL的Ipilimumab，Nivolumab或HuIgG4同种型对照加入其中。 第3天通过ELISA测量IL-2分泌。
26210编辑于 2025-12-23- 来自专栏作图丫
细数免疫应答中重要的细胞因子
1.白细胞介素(interleukin，IL) 2.集落刺激因子（colony-stimulating factor, CSF） 3.干扰素（inteferon, IFN） 4.肿瘤坏死因子(tumor , GF） 6.趋化因子（chemokin） 固有免疫应答中的重要细胞因子 细胞因子 细胞来源 主要生物学效应 TNF 巨噬细胞、T细胞 1)活化内皮细胞、中性粒细胞、介导炎症反应；2)引起发热；3) 促进肝脏合成急性期蛋白；4)促进肌肉、脂肪组织分解代谢，导致恶病质；5)促进细胞凋亡； IL-1 巨噬细胞、内皮细胞、某些表皮细胞 1)活化内皮细胞、介导炎症；2)引起发热；3)促进肝脏合成急性期蛋白； IL-17;2)诱导T淋巴母细胞和记忆性T细胞产生IFN-r，并促进其增殖; IL-27 巨噬细胞、树突状细胞 1)诱导Th1细胞分化;2)抑制Th17细胞;3)抑制外周血T细胞转变为Treg;4)限制中枢神经系统 、眼睛、胎盘等部位炎症反应； 趋化因子 巨噬细胞、内皮细胞、T细胞、成纤维细胞、血小板 趋化白细胞进入组织局部，活化白细胞; Type I IFNs IFN-a：巨噬细胞、浆细胞样树突状细胞;IFN-b
1.7K20编辑于 2022-03-29 靶向TGF-β2：重塑免疫抑制性肿瘤微环境以增强抗肿瘤免疫
二、TGF-β2蛋白作为特定靶点的聚焦TGF-β家族包含三个主要亚型（TGF-β1、β2、β3），它们共享信号通路（主要通过Smad蛋白）但具有不同的表达调控模式与生物学功能。 1.治疗策略设计：研究采用TGF-β2反义寡核苷酸（TASO）来特异性抑制肿瘤微环境中TGF-β2蛋白的产生，并联合应用免疫刺激因子白细胞介素-2，旨在同时解除免疫抑制并激活抗肿瘤免疫应答。 2.主要发现：-增强细胞毒性：TASO处理能显著增强IL-2刺激的人外周血单个核细胞对胰腺癌细胞的体外杀伤活性。-抑制肿瘤生长：在动物模型中，TASO联合IL-2治疗能有效延缓胰腺癌的生长。 -重塑纤维化微环境：联合治疗抑制了Akt的磷酸化并激活了糖原合成酶激酶-3β（GSK-3β），进而下调了β-连环蛋白和α-平滑肌肌动蛋白的表达。 -调节免疫细胞组成：联合治疗显著减少了外周血和肿瘤组织中的Foxp3+调节性T细胞，同时增加了促炎细胞因子（如IFN-γ、TNF-α）的产生，降低了抗炎细胞因子（如TGF-βs）的水平，从而将免疫微环境从抑制状态向促炎
14810编辑于 2026-01-30- 来自专栏单细胞天地
“成熟”：中性粒细胞命运的十字路口？
然而，也有其他作者记录了即使在成熟中性粒细胞计数高（由于总白细胞计数高）的情况下，仍然发生了严重的细菌感染。 研究方法和材料部分描述了对36名急性白血病患者的临床观察，包括他们的血液学诊断、白细胞计数、血红蛋白水平、血小板计数等。 在急性白血病患者中，细菌感染的发作通常是由外周血成熟中性粒细胞数量的动态减少所造成的。在18名患者中，有17名在感染发作前成熟中性粒细胞计数下降，与无感染期相比，中位数减少了54%。 Heterogeneity of neutrophils 通常情况下，中性粒细胞只有在骨髓中发育成熟后才会进入外周血。
85610编辑于 2024-06-25 - 来自专栏单细胞天地
单细胞水平分析红斑狼疮异质性
Immunology上 在线阅读链接：https://doi.org/10.1038/s41590-020-0743-0 单细胞实验设计 对33名儿童SLE患者（cSLE）和11名对照组进行了约276,000个外周血单个核细胞 名儿童SLE患者（cSLE）和11名对照组组织样品进行分析： GSM4029896 cSLE1 [JB17001] GSM4029897 cSLE2 [JB17002] GSM4029898 cSLE3 JB17022] GSM4029912 cSLE16 [JB17023] GSM4029913 cSLE17 [JB17024] GSM4029914 cHD2 [JB17017] GSM4029915 cHD3 单核细胞（Monocytes, CD14+ and CD16+）：这是一种白细胞，可以进入组织变成巨噬细胞，吞噬病毒和细菌。 对来自成年SLE患者的约82,000个外周血单个核细胞（PBMCs）的分析证实了在疾病活动度最高的患者中存在类似的亚群扩增。
46140编辑于 2023-10-06 - 来自专栏生信宝典
解读文献里的那些图——流式细胞术
如图表示的是某正常人外周血白细胞FSC－SSC散点图。FSC代表细胞的大小，SSC代表细胞的颗粒度，从图中可以看出，根据细胞的大小和颗粒度，正常人外周血白细胞可以分为3群。 3.流式等高线图 流式等高线图与流式散点图相似，一张流式等高线图也能同时显示两个通道的信息，所不同的是，流式等高线图借助地理等高线图表示细胞的密集程度，流式等高线图的环线代表的是细胞密度相同的区域，所以
5.1K33发布于 2021-10-11 - 来自专栏生信宝典
Nature系列 | 整合单细胞转录组学和质谱流式确定类风湿性关节炎滑膜组织中的炎症细胞状态 | 详细解读
； 双门控通道选定活细胞：B细胞（CD45 + CD3-CD14-CD19 +），成纤维细胞（CD45-PDPN +），单核细胞（CD45 + CD3-CD14 +）和T细胞（CD45 + CD3 + +单核细胞相关的基因，包括NR4A2，HBEGF，PLAUR和IFN激活的基因IFITM3显着在富含白细胞的RA样品中上调。 和浆母细胞（SC-B4）；SC-B3细胞表达高水平的ITGAX和TBX21（T-bet），它们是自身免疫相关B细胞的标志物，AICDA的高表达与最近报道的来自系统性红斑狼疮（SLE）样品的外周血的CD11c 干扰素刺激的基因（GBP1和ISG15）也在ABCs（SC-B3）中表达并在富含白细胞的RA中上调。 富含白细胞的RA样本在成纤维细胞和单核细胞中具有显着更高的基因表达：炎症反应基因（PTGS2，PTGER3和ICAM1），干扰素应答基因（IFIT2，RSAD2，STAT1和XAF1），以及趋化因子或细胞因子基因
6.3K54发布于 2019-06-05 - 来自专栏集智书童
MFDS-DETR开源 | HS-FPN多级特征融合+Deformable Self-Attention，再续DETR传奇
因此，它成为许多专注于白细胞目标检测的研究[31]的组成部分。[1]利用SSD和YOLOv3模型进行自动化白细胞检测，实现了对11种外围白细胞的检测。 考虑到单模型使用可能导致偏差，[6]设计了一个基于YOLOv3、YOLOv3-SPP和YOLOv3-tiny的集成模型，在IoU为0.5时，平均精确度（AP）达到88.6%。 然而，这些关于白细胞目标检测的研究使用卷积神经网络（CNNs）来提取特征，然后进行目标定位和分类。这种方法受到卷积运算符的影响，无法学习白细胞图像的全局特征，从而阻碍了外周血白细胞的准确定位和分类。 L1SC数据集是一个早期的白细胞数据集，由健康个体的外周血样本衍生而来。 此外，表3中每个白细胞类别的AP值有助于更深入地分析模型的改进。
8.4K10编辑于 2024-01-10 - 来自专栏生信菜鸟团
荷瘤环境下【中性粒细胞】：我黑化了？
中性粒细胞是人外周血中数量最多的白细胞，它专门捕捉和杀死微生物，这一过程被称为吞噬作用。吞噬细胞不止一种，而中性粒细胞是最具杀伤力的吞噬细胞。 此外，癌细胞会直接或间接--通过产生白细胞介素-1β（IL-1β）的巨噬细胞和产生 IL-17 的 γδ T 细胞--产生 G-CSF。 中性粒细胞衍生的 BV8 也会诱导中性粒细胞扩张。 重编程的 dcTRAIL-R1+ T3中性粒细胞主要定位于肿瘤核心的糖酵解和缺氧龛位，并发挥有利于肿瘤生长的促血管生成功能。 文章还用3个亚群的marker进行TCGA的免疫评分： 发现在人类实体癌中，T3 中性粒细胞基因特征与患者较差的生存期有关。 这些浸润的中性粒细胞可被肿瘤核心的缺氧和糖酵解龛进一步重编程为 T3 中性粒细胞。与 T1 和 T2 亚群相比，T3 亚群表达更高的 Vegfa 并促进血管生成以支持肿瘤生长。
41010编辑于 2024-05-30
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