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单细胞测序—PBMC注释的细胞类型
1 外周血与PBMC1.1 外周血外周血（Peripheral Blood）是循环系统中的血液，负责将氧气、营养物质、废物和免疫细胞运输到身体各个部位。外周血的组成包括血浆和血细胞两大部分。 正常成年人每微升血液中约有450万至600万个红细胞。（2）白细胞（Leukocytes）白细胞是免疫系统的关键组成部分，负责抵抗感染和外来病原体。 B细胞（B Lymphocytes）：占PBMC的约5-10%。主要负责生产抗体，通过体液免疫应答来中和病原体。单核细胞（Monocytes）：占PBMC的约10-20%。 2.3 单核细胞、CD14+ Mono、FCGR3A+ Mono单核细胞（Monocytes）是外周血中的一种重要白细胞，属于先天免疫系统的组成部分。它们在炎症反应、抗感染和组织修复中发挥关键作用。 它们占外周血白细胞的约5-10%。单核细胞起源于骨髓，由单核祖细胞（monoblasts）分化而来。功能：吞噬作用：单核细胞是强大的吞噬细胞，能够吞噬并消化病原体、受损细胞和细胞碎片。
4K21编辑于 2024-08-15 - 来自专栏生信宝典
PNAS & NAT COMMUN | 北大郑晓峰揭示DNA损伤修复调控的新机制
该研究在揭示hCINAP调控DDR的分子机制的基础上，发现在急性髓系白血病（acute myelocytic leukemia，AML）病人的外周血白细胞中，hCINAP表达量比正常人的外周血白细胞低。 此外，还构建了人源肿瘤异种移植AML小鼠模型，用hCINAP敲低的恶性白血病细胞移植到AML小鼠尾静脉中，追踪观察AML小鼠的疾病发展和对化疗药物的耐药性，并且进行生存曲线分析(R语言 - 非参数法生存分析 发现在AML小鼠中进一步敲低恶性白细胞中hCINAP蛋白的表达，可以增强化疗药物的治疗效果，有助于小鼠AML疾病的治疗。 ? hCINAP参与调控DDR的分子机制及其对AML白细胞耐药性的影响 北京大学郑晓峰课题组的博士研究生臧维成为PNAS论文第一作者，徐瑞丹为Nature Communications论文的第一作者。
91710发布于 2019-12-12 人Th2极化套装的组成与应用研究
其核心组分包括白细胞介素-2（IL-2）、白细胞介素-4（IL-4）、抗分化簇3（CD3）单克隆抗体、抗分化簇28（CD28）单克隆抗体、抗人白细胞介素-4（IL-4）单克隆抗体、抗人干扰素-γ（IFN-γ 白细胞介素-4是驱动Th2极化的关键细胞因子，其通过激活信号转导及转录激活因子6（STAT6）信号通路，诱导GATA结合蛋白3（GATA3）等Th2特异性转录因子的表达。 次日，从健康供体外周血中分离初始CD4⁺ T细胞，调整密度至1×10⁶细胞每毫升，重悬于含有IL-2、IL-4、抗人IFN-γ单克隆抗体、抗CD28单克隆抗体及β-巯基乙醇的完全培养基中，接种至包被孔内进行培养 此后需定期观察细胞密度，当细胞密度超过2×10⁶细胞每毫升时进行半量换液或传代。培养至第5天，可通过流式细胞术检测Th2极化效率。 Th0组使用含抗人IL-4单克隆抗体和抗人IFN-γ单克隆抗体的培养基，在不添加极化细胞因子的条件下培养，确保T细胞维持在初始未极化状态。
9810编辑于 2026-03-16- 来自专栏用户7627119的专栏
你不知道的PBMC
指外PBMC（peripheral blood mononuclear cell，外周血单核细胞），指外周血中具有单个核的细胞，包含淋巴细胞、单核细胞等。 相对于淋巴细胞，其余的单核细胞的比例在10-30%，受到刺激之后会发育成树突状细胞(DC)或巨噬细胞。干细胞的比例非常低，只有0.1-0.2%，因此很难从全血样本中分离到。 ? 【提取PBMC常见问题解答】 1.人外周血单个核细胞分离后培养，有很多针尖大小的圆形细胞，是什么东西，如何去除？ 可能可能是血小板。血小板密度低，主要在血浆中，吸膜层需要注意，尽量不吸到过多血浆。 可能复苏时最佳的条件是使用20％S-RPMI（小牛血清），预热至37度，离心力和离心时间设置为500g×10分钟，最后PBMC的孵育37度30分钟～1小时。 LAK疗法是将健康人外周血单核白细胞 (PBL)在体外培养，经淋巴因子白介素2 (IL-2)激活后扩增，回输至患者体内从而广谱地杀伤肿瘤细胞（杀伤对NK细胞不敏感的肿瘤细胞）的治疗方法。
7.6K31发布于 2020-08-05 - 来自专栏技术文章
Elabscience 手把手教学：中性粒细胞流式从样本准备到数据分析全拆解
不同实验目的标志物组合参考样本类型推荐方案及核心标记物应用人外周血常规检测：CD45/CD15/CD16基础表型鉴定，快速、标准地圈定外周血中性粒细胞群。 产品名称货号应用PE/Cyanine7 Anti-Human CD3 Antibody[OKT-3]E-AB-F1001H人外周血粒细胞检测9色Panel参考Elab Fluor® Violet 540 人外周血白细胞流式染色实验结果图。 ， κ Isotype Control[MM-30] （E-AB-F09782S）（右）对人外周血白细胞进行流式染色表2. 人外周血粒细胞检测9色Panel参考产品名称货号应用PE/Cyanine7 Anti-Human CD3 Antibody[OKT-3]E-AB-F1001H人外周血粒细胞检测9色Panel参考Elab
30010编辑于 2026-01-19 - 来自专栏单细胞天地
单细胞测序技术在循环肿瘤细胞检测中的应用
基于细胞表面标志物的富集：主要包括正选择和负选择，即抗上皮细胞粘附分子（EpCAM）和角蛋白（cytokeratin，CK）等抗体捕获和富集上皮来源的肿瘤细胞和/或利用白细胞-衍生抗体以去除白细胞。 通过多功能机器人系统自动检索单细胞和细胞克隆，实现单细胞分选，直接机械分离目标细胞或克隆，不影响细胞活力，实时、高精度观察细胞图像进行细胞分选；但是，这种方法很耗时 单细胞全基因组扩增 单个细胞的DNA 其中Hydro-Seq利用基于大小的单细胞捕获来防止可能由分子 CTC 选择导致的偏差，实现了高细胞捕获效率，用于分析 10 ml 血液样本中的少量 CTC。 有研究（https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24752078/）选取了 10 名外周血中未检测到 CTC 的转移性前列腺癌患者，对原发性肿瘤和转移性肿瘤的组织样本进行外显子组测序分析 在主要病灶中发现了 10 个突变，称为“早期突变”，在转移病灶中发现了 56 个突变，称为“转移性突变”。然后，又选择了两名外周血中含有超过 20 个 CTC 的转移性前列腺癌患者。
2.3K20编辑于 2022-03-14 - 来自专栏生信菜鸟团
【生信文献200篇】65 狼疮性肾炎患者肾脏免疫细胞图谱
03 数据及方法 分组情况 LN患者和健康人的肾脏（kidney）、尿液（urine）和血液（blood）样本 样本准备 研究人员按照图a的流程分析肾脏和尿液样本的细胞成分和分子状态的方法。 结果发现约一半的 LN 样本的白细胞产量远高于对照样本，包括 B细胞、T细胞、巨噬细胞和其他白细胞。 b）LN活检中按肾小球肾炎分级分类的白细胞数量。c）流式细胞术评估活检样本中B细胞、T细胞、单核细胞/巨噬细胞或其他白细胞的比例。 发现绝大多数外周血 CD16 细胞与 CM0 簇最相似，少数细胞映射到 CM1 或 CM3，没有细胞映射到 CM4 或 CM2。 据报道，SLE 患者外周血 CD8+ T 细胞中的耗竭特征与较低的发作率相关，并且在狼疮小鼠的肾脏中也检测到这种耗竭的 T 细胞。
2.4K21发布于 2021-09-17 - 来自专栏单细胞天地
外周血中PBMC细胞的分离流程
其中血浆作为运载细胞，营养物质及代谢物的循环液体，主要成分是水（约占90%），其次是细胞蛋白，酶，激素等物质；另外的一部分是血细胞主要包含红细胞，白细胞及血小板三个大类。 在血细胞中存在着参与机体免疫应答，调控相关的一类细胞，我们统称为外周血单个核细胞（Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)，是外周血中具有单个核的细胞（Mononuclear 因外周血中具有单个核的细胞在机体免疫中的重要性，所以单个核的血细胞成为很多科研工作者重点关注和研究的对象。 血液样本及血液组织示意图 根据单个核细胞的体积、形态和比重与外周血其他细胞不同，红细胞和多核白细胞的比重在1.092左右，单个核细胞的比重为1.075-1.090，血小板为1.030-1.035。 在室温平衡血液和 Ficoll(样本密度分离液) 30 min；冰上操作以下实验，在 15 mL 离心管中一次分别加入外周血和1× DPBS（外周血：1×DPBS=1：1）各 1mL，移液枪轻轻吹打5次稀释混匀
7.8K31发布于 2021-10-09 - 来自专栏生信菜鸟团
Nature immunoloy | 新冠肺炎患者的单细胞免疫图谱
该团队对5例健康人和13例新冠肺炎病人的外周血进行了单细胞测序。通过确定免疫细胞的转录谱，结合组装好的T细胞受体和B细胞受体序列，分析免疫细胞的功能特性。 结果 外周免疫细胞的单细胞转录谱 用10X技术对13例COVID-19患者（中度、重度和恢复期）和5例健康人的外周血进行单细胞测序。 这些细胞包括幼稚T (naive T)细胞(CD3+CCR7+)、活化T细胞(CD3+PRF1+)，粘膜相关的不变T(MAIT)细胞(SLC4A10+TRAV1-2+)、(TRGV9+TRDV2+)、( 发现新冠肺炎患者外周血中主要细胞亚群对IFN-α的反应一致且显著的上调，在重症患者中，几乎所有主要细胞类型中均显示最高值。 ? ? 在先天免疫细胞中观察到强烈的干扰素反应 为了进一步研究SARS-CoV-2感染后先天免疫细胞的转录组变化，我们比较了中度或重度与对照组的CD14+和CD16+单核细胞的表达情况，发现显著差异表达基因参与了干扰素反应、骨髓白细胞激活
2.9K30发布于 2020-08-21 白细胞介素-10信号通路的分子机制与免疫调节功能
白细胞介素-10（IL-10）作为一类具有强效免疫抑制功能的多效性细胞因子，在限制免疫应答强度、维持免疫耐受及促进组织修复中发挥核心作用。 基于对IL-10信号通路的系统解析，人IL-10试剂盒（HICA）已成为免疫调节机制研究及炎症相关疾病评估的重要检测工具。 IL-10受体复合物：IL-10受体为异源二聚体跨膜蛋白，由IL-10R1与IL-10R2亚基构成。 IL-10与IL-10R1结合后招募IL-10R2，形成功能性三元复合物，启动胞内信号转导。下游信号分子：JAK1及TYK2分别与IL-10R1及IL-10R2胞内区结构性关联。 对循环及局部IL-10水平的动态监测可为疾病活动度评估提供参考，人IL-10试剂盒（HICA）在此类应用中发挥重要作用。感染性疾病：IL-10在感染免疫中呈现双重作用。
15310编辑于 2026-02-24- 来自专栏CSDNToQQCode
血常规(自动生成报告)(配套Python工具正在编码中)
孕妇在妊娠中后期、老年人或6个月-2岁婴幼儿会有正常的生理性降低，婴幼儿主要因为生长发育迅速而引起的造血系统造血的相对不足。妊娠中期和后期由于妊娠血容量增加而使血液被稀释。 老年人由于骨髓造血功能逐渐降低，可导致红细胞和血红蛋白含量减少。 5红细胞体积分布宽度(RDW) 红细胞体积分布宽度反应外周血红细胞体积异质性的参数。简而言之，是反映红细胞大小不等的客观指标。一般通过RDW和MCV这两个参数进行贫血的形态学分类。 二、白细胞系统（反应免疫状态） 1、白细胞(WBC) 白细胞生理性 ↑↑：妊娠期（特别是妊娠20周后），新生儿及激烈运动过后，冷热水浴后、紫外线照射、妇女月经期和排卵期、情绪激动。 白细胞病理性↑↑：常见于急性细菌性感染、严重组织损伤、恶性肿瘤、大出血、中毒等。 白细胞↓↓：①病毒感染；②放化疗的影响；③再生障碍性贫血；④长期接触放射线；⑤免疫系统衰弱；⑥药物引起。
69410编辑于 2023-03-09 - 来自专栏单细胞天地
单细胞水平分析红斑狼疮异质性
Immunology上 在线阅读链接：https://doi.org/10.1038/s41590-020-0743-0 单细胞实验设计 对33名儿童SLE患者（cSLE）和11名对照组进行了约276,000个外周血单个核细胞 ] GSM4029933 cSLE31 [JB18080] GSM4029934 cSLE32 [JB18081] GSM4029935 cSLE33 [JB18082] GSM4029936 cHD10 five CD8+ T cell clusters 通过BioinfoArk提供的中国区chatGPT查询到各个细分亚群的解释： 树突状细胞（Dendritic cells, DCs）：这是一种专门的白细胞 单核细胞（Monocytes, CD14+ and CD16+）：这是一种白细胞，可以进入组织变成巨噬细胞，吞噬病毒和细菌。 对来自成年SLE患者的约82,000个外周血单个核细胞（PBMCs）的分析证实了在疾病活动度最高的患者中存在类似的亚群扩增。
46140编辑于 2023-10-06 - 来自专栏作图丫
细数免疫应答中重要的细胞因子
1.白细胞介素(interleukin，IL) 2.集落刺激因子（colony-stimulating factor, CSF） 3.干扰素（inteferon, IFN） 4.肿瘤坏死因子(tumor 内皮细胞、成纤维细胞、T细胞（Th2为主）、B细胞 1)促进肝脏合成急性期蛋白;2)促进B细胞增殖、分化，产生抗体;3)联合IL-1和IL-23诱导Th17细胞分化;4)内源性致热源，参与炎症反应; IL-10 抑制巨噬细胞及树突状细胞表达IL-12、共刺激分子和MHC II类分子;2)参与胃肠道粘膜炎症反应; IL-12 巨噬细胞、树突状细胞、T细胞、B细胞 1)诱导Th1细胞分化;2)抑制Th2细胞合成IL-4、IL-5、IL-10 树突状细胞 1)维持并稳定Th17细胞分泌IL-17;2)诱导T淋巴母细胞和记忆性T细胞产生IFN-r，并促进其增殖; IL-27 巨噬细胞、树突状细胞 1)诱导Th1细胞分化;2)抑制Th17细胞;3)抑制外周血 T细胞转变为Treg;4)限制中枢神经系统、眼睛、胎盘等部位炎症反应； 趋化因子 巨噬细胞、内皮细胞、T细胞、成纤维细胞、血小板 趋化白细胞进入组织局部，活化白细胞; Type I IFNs IFN-a
1.7K20编辑于 2022-03-29 AbMole| 人源化单抗动物实验黄金指南(上)
该品系小鼠可以通过移植人脐带血CD34+细胞，在免疫缺陷鼠NOG/NPG体内重建免疫系统后获得。特别适用于免疫肿瘤学、传染病、宿主-抗体疾病的长期研究。b. PBMC（外周血单核细胞）人源化小鼠。 该品系小鼠则多通过静脉注射或腹腔注射分离的人外周血单核细胞入免疫缺陷鼠并重建免疫系统后获得。适合用于研究T细胞调节的药物及感染和免疫排斥研究。 首先分离收集人的淋巴细胞，并通过尾静脉注射将其注入NPG小鼠体内以构建PBMC人源化小鼠。 待小鼠血液中人CD45阳性细胞超过25%后，为小鼠皮下接种KHOS细胞，并每隔5天以10mg/kg的剂量腹膜内注射无菌盐水或Nivolumab，总共注射五次。 培养来自于正常健康白细胞供体的外周血单核细胞（PBMC），并用不同浓度的SEB刺激。然后将10μg/mL的Ipilimumab，Nivolumab或HuIgG4同种型对照加入其中。
26210编辑于 2025-12-23- 来自专栏单细胞天地
“成熟”：中性粒细胞命运的十字路口？
然而，也有其他作者记录了即使在成熟中性粒细胞计数高（由于总白细胞计数高）的情况下，仍然发生了严重的细菌感染。 研究方法和材料部分描述了对36名急性白血病患者的临床观察，包括他们的血液学诊断、白细胞计数、血红蛋白水平、血小板计数等。 在急性白血病患者中，细菌感染的发作通常是由外周血成熟中性粒细胞数量的动态减少所造成的。在18名患者中，有17名在感染发作前成熟中性粒细胞计数下降，与无感染期相比，中位数减少了54%。 Heterogeneity of neutrophils 通常情况下，中性粒细胞只有在骨髓中发育成熟后才会进入外周血。
85610编辑于 2024-06-25 - 来自专栏作图丫
Nature Communication|解析非小细胞肺癌的免疫组库
数据介绍 肺癌患者：236个初治NSCLC患者，每例患者都采集其癌组织样本、癌旁样本、外周血白细胞(PBMC)； 慢性阻塞性肺疾病患者：11例无肺癌的慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者; 健康对照样本：24 例健康人的肺组织。 图:PBMC T cell density越高，有更好的OS b-c图:癌旁的T cell density和clonality越高，有更好的OS 小编总结 作者检测了NSCLC的癌组织、癌旁组织、外周血的
89441编辑于 2022-03-29 顶刊分享----空间免疫评分系统预测肝癌复发
REC和非REC HCC之间最显著的差异是非REC HCC IF中NK细胞的富集评分显著高于REC HCC（P = 4.3 × 10-4），表明IF中NK细胞浸润增加的患者复发风险较低。 = 3.0 × 10-3）和CD3-CD57+ mature NK（P = 8.0 × 10-4）。 人外周血的流式细胞术分析进一步证明，SPON2+NK细胞比SPON2-NK细胞表达显著更高水平的IFNγ（P = 1.0 × 10-4）和穿孔素（P = 2.0 × 10-4）。 TC中SPON2+NKhigh富集在与免疫激活、细胞运动、白细胞迁移和白细胞介导的免疫相关的途径中。 从TC的DSP ROI的基因集富集分析显示，SPON2highCD57highROI富集在与白细胞趋化、细胞粘附、天然免疫应答以及对IFNγ、IL-12和IL-18的免疫应答相关的途径中，表明SPON2
24620编辑于 2025-03-17- 来自专栏生信宝典
Nature系列 | 整合单细胞转录组学和质谱流式确定类风湿性关节炎滑膜组织中的炎症细胞状态 | 详细解读
然后作者进行以下条件的筛选：（1）细胞检测到的genes数>1000;(2)线粒体相关基因的表达占比少于25%； 质谱流式+scRNA-seq 作者收集6个富含白细胞、9个白细胞缺乏的RA和11个OA样品用于质谱流式分析 相反，与富含白细胞的RA相比，与NUPR1 +单核细胞（SC-M2）相关的标记基因下调。 SC-B3）和浆母细胞（SC-B4）；SC-B3细胞表达高水平的ITGAX和TBX21（T-bet），它们是自身免疫相关B细胞的标志物，AICDA的高表达与最近报道的来自系统性红斑狼疮（SLE）样品的外周血的 质谱流式分型划分10个细胞clusters,进一步分型发现CD11c +细胞内的三个亚组：IgM-IgD-HLA-DR ++ CD20 + CD11c +，CD38 + HLA-DR ++ CD20-CD11c Toll样受体信号通路富含白细胞丰富的RA组织中的B细胞和单核细胞。 在单细胞水平，TLR10仅由活化的B细胞表达，表明TLR10在B细胞谱系中具有功能性作用。
6.3K54发布于 2019-06-05 - 来自专栏冰河技术
最近一周，10人面试，10人全挂在这个问题上！
有些小伙伴心里会想：我从一开始学习Java时，就知道了：Java中的对象是在堆上创建的，对象的引用是存储到栈中的，那Java中的对象是在堆上分配的啊！难道不是吗？
23710编辑于 2024-05-18 - 来自专栏集智书童
MFDS-DETR开源 | HS-FPN多级特征融合+Deformable Self-Attention，再续DETR传奇
然而，这些关于白细胞目标检测的研究使用卷积神经网络（CNNs）来提取特征，然后进行目标定位和分类。这种方法受到卷积运算符的影响，无法学习白细胞图像的全局特征，从而阻碍了外周血白细胞的准确定位和分类。 这可以通过公式（10）来表示： \begin{split}\mathcal{L}_{\mathit{box}}(\mathit{box}_{y},\mathit{ box}_{\hat{y}})=&\lambda box}_{\hat{y}})\\ &+\lambda_{\mathrm{L1}}|\mathit{box}_{y}-\mathit{box}_{\hat{y}}|, \end{split} \tag{10 L1SC数据集是一个早期的白细胞数据集，由健康个体的外周血样本衍生而来。 如图10和表10所示，GIoU损失比L1损失更为重要。L1损失的缺失导致AP下降1.4%，而GIoU损失的缺失导致AP下降1.9%。
8.4K10编辑于 2024-01-10
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