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Oxford Nanopore 的临床应用
来自一名患有胎儿心动过缓（低心率）的女性新生儿的未解决样本数据表明，存在两种complex structural variations (cxSVs)结构的替代模型，其中一种或两种与早期婴儿癫痫性脑病相关的CDKL5基因拷贝被破坏 5. 下呼吸道感染 金标准培养需要48-72 hours 基于PCR的方法能减少时间但不能检测整个病原谱，而且不能检测耐药性 纳米孔测序提供的实时数据分析。 使用便携式纳米孔测序的一个显著优势，小型设备是直接现场应用的设施，它允许快速部署，并且无需将样品运回实验室 ?
90810发布于 2020-08-10 - 来自专栏生信菜鸟团
宏基因组之临床应用
学术方面，时不时推出一个新的组学概念，旨在用多维度去透过现象看本质，而在应用场景，正在或者已经进入了白热化竞争。 高通量检测在临床应用可以简单理解为，根据已有研究基础、经验，通过测序的方法寻求关键”证据“，并加以解读。 今天就后者简单分享宏基因组在临床应用上的一些观点，初入临检方向，若有不当之处，烦请指正。 - ? - 伴随着检验技术发展及医院经验累积，面对感染，临床已经有了一套比较成熟的解决方案。 借助数据库的优化，区分定植、环境菌、条件致病菌，可以在报告中体现疑似致病微生物，结合临床表征及报道，可以快速、准确地缩小感染病原怀疑范围，协助临床确认病原学诊断。 中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识[本文附更正][J]. 中华传染病杂志, 2020, 38(11):681-689.
94420发布于 2020-11-23 腾讯首款数字疗法进入临床应用
现在，一款专为他们设计的认知功能训练软件，获批上市了——腾讯自主研发的认知功能训练软件「腾讯脑力锻炼」，获批广东省药监局颁发的医疗器械注册证，将进入临床应用阶段，可以帮助轻度认知障碍患者有效改善认知能力 在中国康复研究中心（北京博爱医院）和南方医科大学附属珠江医院进行的临床探索性试验数据显示，98%的患者完成12周完整训练后，认知能力得到显著改善。 基于丰富的医学影像AI产品经验，结合认知训练的特点，有效助力联合团队落实认知训练产品的设计、研发、验证及注册工作；● 主导了治疗机理研究及产品化工作，将认知域的训练范式概念转化为产品的游戏机制；● 参与制定临床验证方案
93020编辑于 2025-06-24- 来自专栏用户7627119的专栏
【R语言】因子在临床分组中的应用
前面给大家简单介绍了 ☞【R语言】R中的因子（factor） 今天我们来结合具体的例子给大家讲解一下因子在临床分组中的应用。 我们还是以TCGA数据中的CHOL（胆管癌）这套数据为例。 关于这套临床数据的下载可以参考 ☞如何从TCGA数据库下载RNAseq数据以及临床信息(一) 前面我们也给大家介绍过一些处理临床数据的小技巧 ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 接下来我们先读入临床数据 #读取临床数据 clin=read.table("clinical.tsv duplicated(clin$case_submitter_id) #提取非重复的样本的临床信息 clin=clin[index,] 可以得到如下临床信息表 前面给大家讲过☞肿瘤TNM分期，我们知道组织病理分期分成 (一) ☞【R语言】卡方检验和Fisher精确检验，复现临床paper ☞R生成临床信息统计表 ☞玩转TCGA临床信息 ☞TCGAbiolinks获取癌症临床信息 ☞肿瘤TNM分期 ☞R替换函数gsub
5.4K21编辑于 2022-09-21 【免疫笔记】Treg的调控机制与临床应用
5. 2011年：Treg疗法进入临床 首次开展Treg细胞治疗的Ⅰ期临床试验（C. G. Brunstein、Di Ianni M团队），标志着Treg从基础研究迈向临床应用。 这条时间线清晰展现了Treg研究从“发现细胞→明确功能/标志物→人工诱导→临床转化→前沿技术”的完整历程，核心是围绕“Treg的调控机制与临床应用”展开的。 Treg的体外诱导流程 如何在实验室里“人工制造Treg”： 起始材料：初始CD4⁺T细胞（Day 0） 诱导条件：用Anti-CD3、Anti-CD28抗体激活，加IL-2、TGFβ1细胞因子 结果：5天后得到 临床应用的3大核心挑战 1. 数量不足：如何通过体外扩增获得足够的治疗剂量（Treg本身在体内占比很低，需要大量扩增才能满足治疗需求） 2. 临床 / 研究价值 CD39 可以作为筛选 “优质 Treg” 的表面标志物— 比如在细胞治疗中，选择 CD39hi Treg 能提高治疗效果（避免 Treg 在体内失去功能）。
42810编辑于 2025-11-30- 来自专栏单细胞天地
单细胞技术在临床上的应用方向
在我们错过的岁月里，我们看到NGS在临床上的应用主要是检测和诊断。近来，随着NGS技术的下沉和成熟，我们看到它开始在药物开发中得到应用。 身边有不少产品经理问我如何基于单细胞技术开发临床产品以让这个技术尽快落地，为人类的健康提供新的见解（早日上市）。其实在回答这个问题之前，我们需要知道目前NGS的临床应用走到了一个什么样的阶段。 ? 2019年之前，NGS的检测没有这么大的规模，也不是它在临床应用的主力。那么主力是什么呢？ 诊断。 为什么？ 感冒了我们需要做诊断吗？ 所以我们看到做诊断的公司基本都有： 自己的检测方法（一般是panel，试剂盒，测序仪） 超大的样本量 如果你们家公司也想致力于NGS的临床应用，这两个技术指标几乎是躲不掉的。 汤神直播ppt 当我们思考单细胞技术在临床上的应用方向的时候，其实我们是想在临床的这块田里种下单细胞的果实，这个果实是通过一个又一个技术体现出来的。
76020发布于 2020-07-21 癫痫中的人工智能——应用及临床路径
此外，虽然我们描述了涉及目前用于临床实践的工具的应用（例如，结构 MRI、PET 和 iEEG），但我们还描述了涉及目前尚未在临床中使用但有可能在集成时提供帮助的模态的应用（例如，弥散加权成像、静息态 鉴于其临床效用，神经影像自然成为众多癫痫 AI 研究的焦点。在本节中，我们将回顾神经影像中 AI 应用的当前状态。 这些国际、多机构合作是确保癫痫管理中 AI 算法可推广性的努力的好例子，取得的进展使得 FCD 检测算法有望在接下来的 5-10 年内被纳入临床应用。AI 也可以通过检测结构异常来帮助诊断癫痫。 随着技术的进步和数据量的增加，多模态方法和 AI 应用的潜力将不断增长，为癫痫的诊断和管理提供新的工具和策略。5. 一个相当大的障碍是需要在临床试验中对癫痫管理中的 AI 应用进行严格验证，目前该领域缺乏此类试验。鉴于一些所需的技术目前尚不存在，许多问题仍未得到解答。
1K10编辑于 2024-09-06空间组学前沿：新兴技术、分析创新与临床应用
团队整合前沿的单细胞与空间多组学技术、细胞成像，并开发和创新应用先进的生物信息学工具与计算框架，以推动新发现。 空间代谢组学通过质谱成像（MSI）技术直接在组织切片上绘制小分子（代谢物、脂质、糖类等）分布：MALDI-IMS 是主流方法，分辨率10–50 μm，支持靶向与非靶向分析；DESI 样本处理简单，适合临床快速应用 临床关联：与免疫检查点抑制剂（ICI）响应、生存期延长正相关。 一、其他具有临床意义但研究不足的空间生态位除前述九大TME生态位外，以下五类空间组织化微环境也具有重要临床价值，但目前仍缺乏系统刻画：淋巴生态位（Lymphatic niches）调控免疫细胞迁移与活化 空间组学的临床与转化应用应用方向空间信息如何指导决策免疫治疗选择TLS成熟度、T细胞排除模式、耗竭生态位 → 指导ICB联合策略（如CXCL13/CXCR5激动剂、CAF靶向药）放疗/药物递送优化缺氧梯度
40720编辑于 2026-01-03- 来自专栏DrugOne
CellPress | 人工智能在临床试验中的应用
在以下各节中，重点介绍了具有直接AI潜在入口点的临床试验设计方面，并解释了特定的AI技术及其应用将如何改善临床试验性能。 ? 图2. 人工智能在临床试验设计中的应用。 相反，数据科学家和医学科学家应该共同定义可实现的用例，在这些用例中，将易于理解的AI工具应用于临床试验设计的特定子任务，有望最大程度地改善整体试验性能。 遵循这种方法，可以逐步将AI应用于临床试验生态系统，从而加快试验速度，同时希望降低失败率和研发成本。几家制药公司和AI公司已开始联合探索这一途径。 值得注意的是，任何此类步骤对药物研发管线效率的可衡量的影响（即使现在已成功实施）也要等5到8年的延迟之后，才能在统计中显示出来。 AI技术具有现实的实用性；但是，特别是在可解释性方面，这些技术必须成熟，以使其能够更广泛地应用于医疗保健和生命科学应用中。
98070发布于 2021-01-29 - 来自专栏生信菜鸟团
临床模型 | 大型语言模型编码临床知识 | Nature
我们的人工评估揭示了当今模型的局限性，强调了在创建安全、有用的临床应用 LLMs 时，评估框架和方法开发的重要性。 此类模型在医学领域有几种令人兴奋的潜在应用，包括知识检索、临床决策支持、关键发现的总结、患者分类、解决初级保健问题等。 现有的医学问答基准通常仅限于评估分类准确性或自动自然语言生成指标（例如，BLEU），无法支持实际临床应用所需的详细分析。 在更困难的带有 5 个选项的问题集合中，我们的模型达到了 62.0% 的准确率。 然而，鉴于领域无关的指令调优在回答多项选择题方面的成功，在领域内的指令提示调优看起来很有前景，我们在扩展数据表 5 中展示了初步结果，并在补充信息第 5 节中进一步描述了该实验。
52000编辑于 2025-03-28 - 来自专栏EpiHub
让ChatGPT编写交互式网页应用的临床预测模型
R Shiny是一种基于Web的交互式数据可视化工具，能够帮助研究人员和临床医生快速构建交互式应用程序，从而进行数据分析和可视化。 在临床决策中，R Shiny可以用于以下方面： 数据可视化：医生可以使用R Shiny构建交互式图表和图形，以更好地展示和解释患者的病情和治疗效果。 临床预测模型：R Shiny可以帮助医生构建和验证临床预测模型，以便更好地了解患者的风险和预测未来病情的可能性。 临床试验监管：R Shiny可以用于临床试验监管，帮助研究人员快速掌握数据，监测研究的进展和效果。 那么，结合R强大的数据分析能力，在医学领域Shiny有哪些应用呢？这里给出了介绍。 1)), # blood sugar (normally distributed, mean=5, sd=1) heart_rate = round(rnorm(500, 70, 10)), #
2.6K30编辑于 2023-03-08 - 来自专栏生信喵实验柴
临床样本检测
国际顶级学术期刊 Nature Biotechnology 以《纳米孔上的临床宏基因组学》（Clinical metagenomics on a nanopore）为封面，刊登了英国东安格利亚大学 Justin 据悉，为了能够准确、快速地识别细菌病原体，研究团队开发了一种能够从临床样本中去除多达 99.99％的宿主核酸的流程，并在便携式 MinION 测序仪上开展了实时的检测和分析。 该团队在 40 个临床呼吸道样品上进行初期测试，在另外 41 个样品上进行了优化和测试。与培养法和 PCR 相比，优化的流程具有较高对病原体鉴定的敏感性（96.6％）和临床特异性（41.7％）。 文章地址： https://www.nature.com/articles/s41587-019-0156-5 1.2 文章详细解读 宏基因组公众号文章《NBT 封面：纳米孔基因组测序快速临床诊断细菌性下呼吸道感染 5. 纳米孔宏基因组学可以快速准确地表征细菌 LRI，有助于减少广谱抗生素的使用。
81420编辑于 2023-02-24 - 来自专栏百味科研芝士
5分+整合多中心临床样本构建5分子胰腺癌预后模型
文章利用从临床搜集的胰腺导管腺癌（PDAC）病人样本，通过LASSO算法及Cox回归分析，构建5分子预后模型，同时利用生存曲线、ROC曲线和多变量Cox回归分析验证了该模型的预后价值，并评估该模型预测术后 在多变量分析中，5分子预测模型是唯一重要的预后指标。此外，该预测模型与传统的临床病理变量相结合，可以大大提高其长期生存的预测能力。 将相同的临界值应用于RJH验证数据集时，高风险组的DSS也显著低于低风险组。ROC曲线在1年和2年时的AUC分别为0.66和0.72。 此外，与临床病理特征不同，该5分子预测模型是唯一的在3类数据中均为独立预后因素的因素（表1）。 ? 在根据上述临床病理参数分层的大多数癌症亚组中，5分子预测模型也可有效区分不同的DSS（图3）。 此外，与单独的临床病理因素相比，单独的临床病理变量和该预测模型的组合显示出更好的预测能力（图4d）。因此，本文推测5分子预测模型可以为临床病理特征增加明显的预后价值。 ? ? ? ?
90210发布于 2020-07-15 - 来自专栏音乐与健康
音疗与音乐治疗的科学实证与临床应用分享
二、现代科学验证：从情绪安抚到神经重塑音疗不仅仅是 “安慰剂”，最新的临床研究证实了它在生理层面的显著作用。神经重塑与耳鸣管理这是音疗在神经科学领域的重要突破。 三、临床应用与未来展望在临床实践中，音疗和音乐治疗通常作为综合治疗方案的一部分，与心理咨询、药物治疗等手段相结合，以达到最佳效果。 四、揭秘音乐治疗的 5 大核心力量对于喜爱音乐的人来说，旋律的魅力无须多言。但音乐之所以能从 “娱乐” 升华为 “治疗工具”，背后有着严谨的科学逻辑。除了悦耳，音乐还能如何疗愈我们？ 以下是 5 个已被科学证实的音乐治疗核心效益：转移焦点，天然的 “止痛剂” (Distraction & Pain Relief)音乐具有强大的 “感官占据” 能力。 这在临床上被称为 **“闸门控制理论”**—— 音乐关闭了部分传递痛苦的闸门。应用：这也是为什么在牙医诊所或术后恢复期，音乐能有效降低患者的焦虑感，甚至减少对止痛药的依赖。
21710编辑于 2026-04-27 - 来自专栏科研菌
5+分思路：非编码RNA结合临床预后进行分析
BLCA患者的临床特征 作者再次排除了34例没有缺少TNM分期和年龄等临床特征数据的患者，随机定义剩下一半患者为”primary dataset“，而整体患者为”entire dataset“，两组间临床特征无显著性差异 图5. 而对于IV期患者，高/低风险组的生存期没有显著差别(图5A-C)。按年龄进行分层分析时，高低风险组也仅在大于65岁的亚群中有显著差异(图5D-E)。 4. 用列线图预测5年总生存期的校准图 D图：(数据集：primary dataset) 用列线图预测3年总生存期的校准图 E图：(数据集：primary dataset) 用列线图预测5年总生存期的校准图 5. 列线图以及其单个因素的生存预测能力 ? 图7.
83220发布于 2020-06-29 - 来自专栏NetCore 从壹开始
5-5 各个服务应用启动
5、修改域名解析映射 添加解析这块，如果是泛域名或者通用域名解析就很简单的， 但是我这边毕竟是免费的，动动手，十分钟就能解决了的。 等待十分钟，就表示迁移完成了。
32020编辑于 2023-01-09 - 来自专栏剑指工控
MACS5应用
Hoyllsys在工业自动化领域应用越来越广泛和普及，尤其在化工和电厂，铁路等大面积推广，今天就对MACS5做一些案例分享。 ，配置完成后，进行“数据库跟新”，“完全编译”,对“操作员站和服务器”进行下装，在CODESYS里面“在线登录”“参数下载” 上位机中的单元设备和下位机CODESYS的组态，右键单击如图HSSCS5顺控火电模块 总结MACS5的组态修改步骤： 数据库修改： 数据库总控￫选择域￫编辑数据库￫数据操作￫选择类名￫选择项名￫确定￫保存￫更新数据库￫确定￫校验￫完全编译。
88720发布于 2021-11-09 - 来自专栏用户7627119的专栏
玩转TCGA临床信息
对作者是如何从307个early-stage cervical cancer (CESC)病人中根据临床信息挑选出145个病人的过程有些疑惑。下面是原作者筛选样本的标准。 ? 首先我们要从TCGA中下载CESC的临床信息，在TCGA中搜索CESC，选择TCGA-CESC。 ? 选择miRNA样本，点击307这个超链接。 ? 任意选择一个样本，点击进入。 ? 点击Download下载，里面就包含所有样本的临床信息 ? 解压到当前文件夹 ? 更多临床信息解读可以参考肿瘤TNM分期。 ? ? 这就和原文中的表1中的数字相同了。 ? 接着我们检查一下相应的Tumor Grade样本数是否正确。
1.8K41发布于 2020-08-06 - 来自专栏文大师的新世界
5. ListView应用
ListView大概是所有移动应用都会用到的组件了，大部分都在首页，这章结合redux来看如何从API取数据再到如何应用redux更新渲染组件ListView。
84550发布于 2018-08-30 - 来自专栏临床预测模型
临床预测模型—基于dcurves包的临床决策曲线(DCA)绘制学习
净收益考虑了模型在某个阈值下的灵敏度（True Positives）与特异性（False Positives），提供了一种可以用于临床实际决策的量化指标。 Biom J. 2020 May;62(3):764-776.一点统计：https://mp.weixin.qq.com/s/0xLtnx5JppypsQdywKteXQ https://mp.weixin.qq.com 0iycRpUsDm1Ds3DTkEu4-A https://mp.weixin.qq.com/s/IrZwwQYCBDT63xH7QtfDvA https://mp.weixin.qq.com/s/g5iWSE6hwXh6rbpOn08DOg https://mp.weixin.qq.com/s/buajk82tUFH02ht9DH3RwA生信星球：https://mp.weixin.qq.com/s/PV5Ik5UW37r4V3E0UrKI8QYuLabSMU
1K10编辑于 2024-11-24
腾讯云开发者
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