蛋白质组学实验中的P与Q值

Question

我有一个关于我在分析蛋白质表达的统计中观察到的p和q值的问题。

我得到了下面的p值，它们是非常重要的，但是q值非常高。我已经在一个名为progenesis的软件中执行了这项分析，并希望以本论坛中描述的方式分析这些数据。

请看附件中的图片。你从这个输出中得出了什么结论-我可以不相信p值，因为q值太高了吗？我的学习动力不足，也许我需要一个更高的n值？

​

​

有关于q和p值的描述，但不清楚他们是否根据多次测试调整了p值。

链接至此处：http://www.nonlinear.com/support/progenesis/comet/faq/v2.0/pq-values.aspx

我们希望在这些数据的基础上进行更大的实验，但是我们不确定看到的影响是由于随机测试问题，研究动力不足还是任何其他问题。

Answer 1

谢谢你的回答。我们得出的结论是样本量太小。虽然我们看到了影响，但样本之间的噪声引入了更多的可变性。在进行PCA分析时，我们可以看到处理的效果，但是一些样本接近对照:因此FDR截断率很高，使得Q值不确定。因此，决定增加样本大小。