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社区首页 >问答首页 >2.1.8版本的biom add-add和2.1.7版本的结果不一致,这是正常的吗?

2.1.8版本的biom add-add和2.1.7版本的结果不一致,这是正常的吗?
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Stack Overflow用户
提问于 2020-07-01 22:32:31
回答 1查看 15关注 0票数 0

我正在尝试使用命令BIOM add-metadata (元数据文件是206Bytes)将样本元数据添加到一个非常小的biom文件(658Bytes,2个样本)。然而,我发现使用biom版本2.1.8产生的文件(36.17KB)比我使用biom版本2.1.7 (615Bytes)大得多。此外,v2.1.8创建的文件似乎不是纯文本文件,因为当我尝试使用终端上的"more“或文本编辑器打开它时,有许多难以辨认的字符,而v2.1.7创建的文件是普通文本文件。

我使用的机器已经安装了biom v2.1.7,但是当我尝试使用conda安装v2.1.7和2.1.8时,我看到了相同的行为。然后,我尝试使用pip (在conda环境中)安装v2.1.8,但仍然存在上面提到的区别。

我想知道这是正常的还是意料之中的。

提前感谢您的投入!

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回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2021-03-10 09:56:55

是否可以复制/粘贴所使用的命令?可以在here中找到2.1.7 - 2.1.8的changelog条目,尽管我不知道会修改add-metadata的输出行为的更改。有没有可能在2.1.7的环境中没有安装h5py包?

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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/62679208

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