我正在尝试使用命令BIOM add-metadata (元数据文件是206Bytes)将样本元数据添加到一个非常小的biom文件(658Bytes,2个样本)。然而,我发现使用biom版本2.1.8产生的文件(36.17KB)比我使用biom版本2.1.7 (615Bytes)大得多。此外,v2.1.8创建的文件似乎不是纯文本文件,因为当我尝试使用终端上的"more“或文本编辑器打开它时,有许多难以辨认的字符,而v2.1.7创建的文件是普通文本文件。
我使用的机器已经安装了biom v2.1.7,但是当我尝试使用conda安装v2.1.7和2.1.8时,我看到了相同的行为。然后,我尝试使用pip (在conda环境中)安装v2.1.8,但仍然存在上面提到的区别。
我想知道这是正常的还是意料之中的。
提前感谢您的投入!
发布于 2021-03-10 09:56:55
是否可以复制/粘贴所使用的命令?可以在here中找到2.1.7 - 2.1.8的changelog条目,尽管我不知道会修改add-metadata的输出行为的更改。有没有可能在2.1.7的环境中没有安装h5py包?
https://stackoverflow.com/questions/62679208
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