如何用Plink2在命令行中运行GWAS？

Question

我正在尝试用plink版本2在命令行中运行GWAS，但是当我运行以下命令plink2 --file hapmap1时，我得到了以下错误Error: Unrecognized flag ('--file')

我正在尝试遵循本教程https://zzz.bwh.harvard.edu/plink/tutorial.shtml#t6

是否需要替换命令中的文件名？(我已经尝试过了，但仍然得到相同的错误)

我不知道该怎么做，因为这是我第一次使用plink。我在某个地方读到这个命令与plink2不兼容，但那是在2017年，所以我不确定这与现在有多大关系。

Answer 1

查看您链接的文档，您需要的标志是--bflag：注意'b‘。