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问仅获取包含特定字符的行名-R
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Stack Overflow用户

提问于 2019-07-19 17:23:03

回答 1查看 461关注 0票数 0

我有一个Seurat R对象。我只想选择与特定样本对应的数据。因此，我只想获取包含特定字符的行名。我的行名的差异示例: CTAAGCTT-1和CGTAAAT-2。我想根据1和2来区分。下面的代码显示了我已经尝试过的内容。但它只返回总行数。而不是有多少行与字符匹配。

length <- length(rownames(seuratObject@meta.data) %in% "1")

或

length <- length(grepl("-1",rownames(seuratObj@meta.data)))
Idents(seuratObject, cells = 1:length)

感谢您的任何意见。

回答已采纳

发布于 2019-07-19 17:40:47

只是缺少which()

length(which(grepl("-1", rownames(seuratObject@meta.data))))

票数 2

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/57109415

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