我试图使用doParallel包来估计多个非参数模型。不过,我的问题似乎与np包有关。看看这个可复制的例子:
library(np)
library(doParallel)
df <- data.frame(Y = runif(100, 0, 10), X = rnorm(100))
models <- list(as.formula(Y ~ X))
npestimate <- function(m, data) {
LCLS <- npregbw(m, data = data, regtype = "lc", bwmethod = "cv.ls")
LLLS <- npregbw(m, data = data, regtype = "ll", bwmethod = "cv.ls")
# sigt <- npsigtest(LCLS, boot.method = "wild", boot.type = "I")
return(list(LCLS = LCLS, LLLS = LLLS))
}
cl <- makeCluster(length(models))
registerDoParallel(cl)
results <- foreach(m = models, .packages = "np", .verbose = T) %dopar%
npestimate(m, data = df)
stopCluster(cl)如您所见,我创建了一个名为npestimate()的函数,以便为每个模型计算不同的内容。我注释掉了一行我希望使用npsigtest运行重要测试的行。通常,npsigtest通过查看调用npregbw的环境获得所使用的数据。
但这在这里行不通。我不知道为什么,但是npsigtest就是找不到上面两行代码中使用的数据。数据自动导出到节点,因此在.export中使用foreach是多余的。
有什么建议可以让这件事成功吗?
发布于 2018-06-22 10:49:27
npsigtest很大程度上复制了lm和lm对象函数中使用的方法。因此,它有着同样的潜在范围陷阱。问题是与公式有关的环境:
environment(models[[1]])
#<environment: R_GlobalEnv>很容易修复:
npestimate <- function(m, data) {
environment(m) <- environment()
LCLS <- npregbw(m, data = data, regtype = "lc", bwmethod = "cv.ls")
LLLS <- npregbw(m, data = data, regtype = "ll", bwmethod = "cv.ls")
sigt <- npsigtest(LCLS, boot.method = "wild", boot.type = "I")
return(list(LCLS = LCLS, LLLS = LLLS))
}实际上,由于这样的问题,我更喜欢eval(bquote())结构。
https://stackoverflow.com/questions/50985028
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