R掩蔽冲突: packages和sna

Question

我在并行使用R包( bnlearn和sna )方面有问题。下面的示例很简单：

library(bnlearn)
data("asia")

# build network
a <- hc(asia)

# output
a

产出与预期相符：

  Bayesian network learned via Score-based methods

  model:
   [A][S][T][L|S][B|S][E|T:L][X|E][D|B:E] 
  nodes:                                 8 
  arcs:                                  7 
    undirected arcs:                     0 
    directed arcs:                       7 
  average markov blanket size:           2.25 
  average neighbourhood size:            1.75 
  average branching factor:              0.88 

  learning algorithm:                    Hill-Climbing 
  score:                                 BIC (disc.) 
  penalization coefficient:              4.258597 
  tests used in the learning procedure:  77 
  optimized:                             TRUE 

一旦加载了sna包，就会收到完全不同的信息：

library(sna)

#output
a

我得到：

Biased Net Model

Parameters:

Error in matrix(c(x$d, x$pi, x$sigma, x$rho), ncol = 1) : 
  'data' must be of a vector type, was 'NULL'

由于我并不真正调用任何函数(只想获得a的输出)，所以我认为使用::运算符是没有帮助的。

我想知道问题是否掩盖了我无法真正影响的内部功能。任何帮助都会很好！

Answer 1

这有点类似于其他q & a's，只是在本例中有一个对print的隐式调用，而不是一个显式函数调用。是这个print函数被蒙蔽了。

要打印a，可以在终端中键入a，也可以显式地键入print(a)。为了获得bn对象的良好打印布局，作者编写了一个print方法，这是在输入a或print(a)时分派的内容。(要在没有这种特定打印的情况下查看它，可以使用print.default(a))。注意到class(a) == "bn"之后，您可以使用methods("print")或键入bnlearn:::print，然后输入<tab>来查看可用函数，从而查找print方法:这将导致一个(非导出的)函数bnlearn:::print.bn。

长话短说，sna包也有一个print.bn方法，用于class "bn" (偏置网)的对象，而这个函数掩盖了bnlearn中的对象。

因此，如果您在sna之后加载bnlearn，仍然可以显式地使用bnlearn:::print.bn(a)或重新定义print方法print.bn <- bnlearn:::print.bn来获得良好的打印，并且应该按照预期进行打印。