当使用gbm.plot (dismo)和部分依赖(pdp)时，部分依赖图的差异，为什么？

Question

我使用增强回归树(gbm和dismo软件包)建立生境模型，并使用部分依赖图来观察每个预测变量对响应变量的影响。我最初使用的是dismo包中的gbm.plot函数，但是发现了来自pdp包的部分函数，它创建了更好看的图，但是这两个图之间存在差异。参见示例图像以获取纬度

这两条线看起来很相似，但是y轴在这两幅图上都是不同的，我想知道为什么。我试着使用print()查看函数，但是对于分部函数，它不会产生太大的效果。

final.model：贴体快速反应装置

ceta_dd_final：用于构建快速BRT的数据

gbm.plot代码：

gbm.plot(final.model, n.plots = 17, write.title = T,
  show.contrib = T, y.label = "fitted function")

部分代码：

final.model %>%
  partial(pred.var = "lat", plot=FALSE, train = ceta_dd_final, n.trees = 2400) %>%
  plotPartial(smooth = TRUE, train = ceta_dd_final, rug = TRUE,
      lwd = 2, ylab = expression(f(lat)))

Answer 1

不同的是，gbm.plot使用普通的logit作为绘图的结果，而partial使用以类为中心的logit，这个选择使得y-轴在二项式和多项模型中具有相同的尺度。