我开始使用mothur版本- v.1.36.1-，但是我收到了一些错误消息(如下所示)。我怎么能克服这一切？

Question

启动Mothur教程(https://www.mothur.org/wiki/MiSeq). 但是从一开始，当我在mothur*中创建“make.file”(错误命令如下所示)时，我收到了一些错误消息。我改变了参数，但结果是阴性的。我如何解决这个问题？

****mothur > make.file(inputdir=MiSeq_SOP, type=fastq, prefix=stability)
Setting input directory to: MiSeq_SOP/
prefix is not a valid parameter.
The valid parameters are: type, seed, inputdir, and outputdir.
[ERROR]: did not complete make.file.****

Answer 1

实际上，prefix参数是 记忆中的有效参数。就我个人而言，我从未遇到使用make.file命令前缀的问题，但是您的命令应该是有效的。

您可以测试您的inputdir是否被正确指定( mothur错误和警告消息不一定是最清楚的)。如果这也有效的话，我建议您很好地记录这种行为和团队 (在我的经验中，它们非常响应并随时准备提供帮助)。