手动安装pysam错误："ImportError:没有模块名为version“

Question

我正在尝试手动安装pysam，因为我正在处理一个没有internet连接的集群，并且我没有管理权限(因此通过conda是不可能的，我已经尝试过了)。我已经从开发人员的存储库(https://github.com/pysam-developers/pysam/archive/master.zip)下载了所有压缩文件，然后将它们传输到集群中的目录中。

我通过运行(如https://github.com/pysam-developers/pysam/blob/master/INSTALL说明中所示)尝试从解压缩存储库进行手动安装：

python path/to/pysam-master/setup.py build

但我得到了以下错误：

# pysam: cython is available - using cythonize if necessary
Traceback (most recent call last):
  File "path/to/pysam-master/setup.py", line 166, in <module>
    import version
ImportError: No module named version

setup.py文件中的第165、166和167行如下：

165. sys.path.insert(0, "pysam")
 166. import version
 167.version = version.__version__

不幸的是，我的知识只带我走了这么远。是否有必要修改setup.py文件？

我的系统规格：

• Python 2.7.13 :：Anaconda公司
• CentOS版本6.5
• Linux 2.6.32-431.20.5.el6.x86_64

Answer 1

version.py在路径/to/pysam-master/pysam中。在导入之前，脚本使用os-模块将pysam目录添加到环境的工作目录中：

sys.path.insert(0, "pysam")

因此，这个具体的问题应该通过替换

sys.path.insert(0, "pysam")

有到pysam目录的完整路径。