没有在foreach循环中接收到标准输出

Question

我使用doParallel与foreach进行相当长的并行处理。与我看到的大多数例子不同，在循环中输入了计算密集型但输入光的代码，我使用foreach来协调大量独立的大型数据集的同时处理。因此，在循环中，我使用元数据从磁盘读取文件，对其进行操作，然后将其写出来。

在将此操作转换为foreach循环之前，我正在使用messages()编写调试消息。然而，由于我已经切换到使用foreach和%dopar%，我注意到循环“变暗了”：它正在做它应该做的事情，但是我没有收到任何输出。(我应该提到，这个循环被写进了我用Rscript从shell调用的脚本中。)

我猜想这与doParallel从其他线程派生出来这一事实有关--也许那些线程不再知道在哪里转储标准输出？有什么想法？

Answer 1

如果您想要从并行foreach循环中输出，只需使用选项outfile：makeCluster(no_cores, outfile = "")。