单发奥迪赫尔标签

Question

我想用素食者中的函数ordihull来绘制我的排序表。然而，我有一些网站，只有一次发生。使用ordihull，这个站点不会出现在地块中。请参阅下面的示例，当只有一个站点有BF作为管理。我想要的是一个BF标签，其中剩下的一个BF管理站点位于排序图中。

library(vegan)
data(dune)
data(dune.env)

#remove all but one row with BF as management
dune <- dune[-c(2,11),]
dune.env <- dune.env[-c(2,11),]

mod <- cca(dune ~ Management, dune.env)
attach(dune.env)
plot(mod, type="n", scaling = 3)
pl <- ordihull(mod, Management, scaling = 3, label = TRUE)

Answer 1

orihull忽略具有单一观测值的组，因此不会用凸包的中心填充组质心对象。您可能会说应该这样做；我需要与Jari一起讨论这个问题，看看我们是否能解决这个问题。

要解决这个问题，您必须使用text()方法在次要步骤中添加单个观测的位置。在正确删除所有条形图后，BF的一个观察结果- -c(2,11) --可以做您想做的事情：

plot(mod, type="n", scaling = 3)
with(dune.env, ordihull(mod, Management, scaling = 3, label = TRUE))
with(dune.env,
     text(mod, labels = Management, select = Management == "BF",
          scaling = 3, display = "sites"))

给予

​

​

这很简单，因为您可以指定select来选择用Management == "BF"绘制一个观察结果。