函数来创建和保存图形。

Question

我正在尝试创建和保存几个图形。我被困在factoextra包用来生成图形的情况下。

  pca.plot<-function(x){
  biplot<-paste(out_f,"\\biplot.jpg", sep="")
  jpeg(file=biplot, type="cairo")
  fviz_pca_biplot(x,  geom = "text")
  dev.off()
}

这是一个简单的函数，从一个输入pca对象(使用FactoMineR包创建的pca)创建一个双图，out_f是以前定义的。当我逐行运行脚本时，它可以工作。当我将它作为脚本运行时，不会创建任何内容。

  pca.plot<-function(x){
  pve<-paste(out_f,"\\proportion_of_variance_explained.jpg", sep="")
  jpeg(file=pve, type="cairo")
  barplot(x$eig[,2], names.arg=1:nrow(x$eig),
          main = "Variances",
          xlab = "Principal Components",
          ylab = "Percentage of variances",
          col ="steelblue")
  lines(x = 1:nrow(x$eig), x$eig[, 2], type="b", pch=19, col = "red")
  dev.off()   
}

在这种情况下，没有问题。有人知道为什么在第一种情况下会出现问题吗？

提前谢谢你，约翰

Answer 1

由因子外产生的地块是ggplot2。您应该使用print(fviz_pca_biplot(res.pca))如下：

# Principal component analysis
data(iris)
res.pca <- prcomp(iris[, -5],  scale = TRUE)

# This will do nothing
jpeg("biplot.jpg")
fviz_pca_biplot(res.pca)
dev.off()

# This will do the right thing
jpeg("biplot.jpg")
print(fviz_pca_biplot(res.pca))
dev.off()

祝好运!