可以直接在biom.Table对象中获取轴的长度吗？

Question

是否可以在biom.Table对象中直接查找轴的长度，或者是否需要执行如下操作，其中t是Table对象：

if axis == 'sample':
    length = t.shape[0]
elif axis == 'observation':
    length = t.shape[1]
else:
   raise UnknownAxisError(axis)

使用像t.length(axis)这样的方法似乎是一种更好的方法。这样的功能存在吗？

Answer 1

现在最好的方法是：

>>> from biom import example_table
>>> axis = 'sample'
>>> print example_table.ids(axis).size
3

__len__目前没有重载，因为它不清楚应该返回哪个轴。但是，拥有一个length方法可能是有意义的，如果您认为这样做会更清楚，那么下一步最好是在github 项目上创建一个问题。