genbank文件中的SeqIO.parse抛出错误

Question

我正在处理一些genbank文件，并有以下代码：

for seq_record in SeqIO.parse("datafile_location, "genbank"):

虽然它可以通过seq文件中的大多数seqs运行(其中包含多个seqs)，但我得到以下错误。对如何解决这个问题有什么想法吗？

也许会删除冒犯的seq？它可以记录92126 of 93145，然后抛出错误。

我试过重新下载seq文件，但这并不能解决问题。

文件"C:\python38\lib\site-packages\Bio\GenBank\Scanner.py"，第516行，在parse_records record =self.parse(句柄，do_features)文件"C:\python38\lib\site-packages\Bio\GenBank\Scanner.py"，第499行中，在解析if self.feed(句柄，使用者，do_features)中:文件"C:\python38\lib\site-packages\Bio\GenBank\Scanner.py"，第466行，在提要self._feed_header_lines(使用者，"C:\python38\lib\site-packages\Bio\GenBank\Scanner.py"，self.parse_header()文件第1801行，以feed_header_lines previous_value_line = structured_comment_dict[ KeyError：'Assembly-Data‘)为单位

Answer 1

看起来类似于BioPython问题#2844。

一个最近合并了拉请求。来解决这个问题。