替代JAGS/BUGS的方法

Question

是否有一个R-包，我可以使用贝叶斯参数估计，作为替代JAGS？我在R中发现了一个关于JAGS/BUGS替代品的老问题，然而，上一篇文章已经有9年历史了。也许在R中有新的和灵活的gibbs抽样包可供选择？我想用它来获得具有随机效应和协变量等新的层次隐马尔可夫模型的参数估计。我高度重视JAGS的灵活性，认为JAGS是很棒的，但是，我想编写便于模型规范的R函数，并正在寻找一个可用于参数估计的包。

Answer 1

有一些替代办法：

• 斯坦，带着rstan R包。Stan看起来优化得很好，但不能做某些类型的模型(比如二项式/泊松混合模型)，因为他不能采样一个离散变量(或者类似的.)。
• 灵巧
• 如果您希望基于C++进行高度优化的采样，则可能需要检查基于Rcpp的Dirk Eddelbuettel解决方案。