大脑MRI调情注册工具给出了难以置信的结果

Question

我有一个脑MRI，其中包含来自角度的切片。

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我在玩注册工具的脑部核磁共振，叫做。该代码也可用于

我试着用另一个病人的脑部MRI作为参考，并以不同的角度进行检查。在这里，从这个核磁共振切片(所有的文件都是nifti格式)：

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现在，魔法已经发生了。将第一个MRI作为注册工具的输入，最后这个MRI作为参考MRI

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结果是，注册工具(Flirt)的输出是一个MRI，其中切片具有这样的角度：

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因此，注册工具似乎从输入的MRI中提取了参考MRI的角度。这太不可思议了。这怎么可能？

Answer 1

您用什么包装器来转换dicom映像？dcm2niix包装器将自动应用转换来正确地定位它。调情是一个强大的工具，做出色的注册。许多预处理管道，如fmriprep，已经在使用它。我对它如何能够解释图像的倾斜感兴趣。在这里的使用页面，https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsl/fslwiki/FLIRT/UserGuide，它没有看到任何关于它的角度。我想知道它是否只是覆盖在MNI模板上的每个体素上的激活。这将是一个很好的测试，首先定位nifti形象，然后再进行一遍。

您可以为无方向和面向方向的图像创建一个掩码，并将其通过并使用parcellation程序检查特定ROI中的体素计数，以确定它们对于两个掩码是否相同。

我很想看看你发现了什么！