如何使用Python为每个SNP生成随机浮点数

Question

我正在处理GWAS数据，这里我有一个列名SNP_Id，它有200万行，我需要为每个SNP_Id生成随机浮动值！如何做到这一点？

Input_Data:

SNP_Id
200610-10
200610-108
200610-109
200610-116
200610-118
200610-125
.
.

就像这样，我有200万排

Desired Output:

200610-10, 8.9
200610-108, 90.9
200610-109, 76.9
200610-116, 728.9
200610-118, 646.9
200610-125, 766.9
.
.

我试过这个：

with open('SNP.csv') as f:
    reader = csv.reader(f)
    for row in reader:
        snp_list = np.random.random(0, len(SNP.csv))

但没有用，告诉我我做错了什么？

Answer 1

您可以使用numpy，其中df1是包含GWAS snp数据的数据，如下所示，

   import numpy as np
   df1['randNumCol'] = np.random.uniform(0,len(df1), size=len(df1))

取自1。