NII文件Voxel数据排序

Question

我有一个包含以下元数据的.nii文件

NII Header Size:               348
NII Magic Number:              n+1
Dimension Information:
       Frequency Dimension:    0
       Phase Dimension:        0
       Slice Dimension:        0
Number of Image Dimensions:    3
        Spatial Dimension X has length:         91
        Spatial Dimension Y has length:         109
        Spatial Dimension Z has length:         91
Intent Code:                   0
Data Type:                     FLOAT
Number of bits per Voxel:      32
Description:                   6.0.5:9e026117
Voxel Dimensions:
        Voxel Dimension X has length:         2.000000
        Voxel Dimension Y has length:         2.000000
        Voxel Dimension Z has length:         2.000000
Image data begins at byte:     352
Data Scaling:
        Slope:                 1.000000
        Y-Intercept:           0.000000
Color Range:
        Min:                   0.020708
        Max:                   9.358182
Slicing Information:
        Slice Start:            0
        Slice End:              0
        Slice Duration:         0.000000
        Slice Code:             0
Measurement Units:
       Spatial Dimension:      MILLIMETER
       Temporal Dimension:     SECOND
Auxiliary File:                render1t
Q Form Code:                   4
       b:                      0.000000
       c:                      1.000000
       d:                      0.000000
       x offset:               90.000000
       y offset:               -126.000000
       z offset:               -72.000000
S Form Code:                   4
Affine Matrix:
-2.000000      0.000000      0.000000      90.000000
0.000000      2.000000      0.000000      -126.000000
0.000000      0.000000      2.000000      -72.000000
0.000000      0.000000      0.000000      1.000000
Total number of voxels:        902629

我怎么知道如何读取图像数据？我知道它是一个浮动数组，但是对于该数组中的每个索引，如何将其转换为ijk体素坐标？我真的在寻找正确的函数来将.nii文件中的每个浮点索引转换成一个适当的ijk体素坐标。

我一直在看这个：https://brainder.org/2012/09/23/the-nifti-file-format/，但要么从来没有提到过，要么我就不明白了。

Answer 1

来自A.M. Winkler在您链接的页面上的评论：

存储是RAS，即要填充的第一个维度(即运行得更快)是“x”，从左到右，然后“y”从后到前，然后“z”，从下到上。当然，这些方向可能不符合实际的大脑方向(如果这完全是一个大脑)，但是一旦读取，您就可以使用标题中的三种定向方法中的一种来调整方向，如上面所述。