尝试读取SCF文件时出现分段错误(核心转储)错误。
我使用的是perl中的Bio::SCF模块,并遵循了"https://metacpan.org/pod/Bio::SCF“中的示例。
代码如下所示。
#!/usr/bin/perl
use warnings;
use Bio::SCF;
my $scf = Bio::SCF->new('filename.scf'); # line A
or
tie %scf, 'Bio::SCF', "filename.scf"; # line B我希望其中的一行读取scf文件,但两者都不起作用,只是发送了“分段错误(核心转储)”的消息。
我能做什么?有人能帮上忙吗?
发布于 2019-10-11 02:46:21
(这不是一个真正的答案,因为您没有提供太多信息,但这是我目前所能做的最好的……)
Bio::SCF是一个编译库(请注意.xs文件),因此如果perl安装和BIO::SCF中的某些更改没有重新编译,它很容易崩溃。我建议,作为第一步,重新安装BIO::SCF并确保它的测试通过(检查您正在使用的cpan客户端的日志)。
https://stackoverflow.com/questions/58278936
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