将pardiso解算器与eigen结合使用

Question

我正在尝试用eigen和pardiso求解器来解决非常大的sparse matrix system (Ax = b)。当我使用g++编译代码时，出现以下错误：

In file included from ${Eigenroot}/Eigen/PardisoSupport:31,
                 from code.cpp:8:
${Eigenroot}/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h: In static member function 'static IndexType Eigen::internal::pardiso_run_selector<IndexType>::run(void*, IndexType, IndexType, IndexType, IndexType, IndexType, void*, IndexType*, IndexType*, IndexType*, IndexType, IndexType*, IndexType, void*, void*) [with IndexType = int]':
${Eigenroot}/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h:269:   instantiated from 'Derived& Eigen::PardisoImpl<Derived>::compute(const typename Eigen::internal::pardiso_traits<Derived>::MatrixType&) [with Derived = Eigen::PardisoLU<Eigen::SparseMatrix<double, 0, int> >]'
${Eigenroot}/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h:409:   instantiated from 'Eigen::PardisoLU<_MatrixType>::PardisoLU(const MatrixType&) [with MatrixType = Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>]'
code.cpp:82:   instantiated from here
${Eigenroot}/Eigen/src/PardisoSupport/PardisoSupport.h:50: error: cannot convert 'int*' to 'const long long int*' for argument '2' to 'void pardiso(void*, const long long int*, const long long int*, const long long int*, const long long int*, const long long int*, const void*, const long long int*, const long long int*, long long int*, const long long int*, long long int*, const long long int*, void*, void*, long long int*)'

我认为我不需要改变sparse matrices的形式，但似乎我需要改变稀疏矩阵的形式应该适合pardiso。但是当我找到别人的示例代码时，他们并没有改变sparse matrix的形式。而且它似乎也起作用了。

我做得对吗？我不很清楚。谁能告诉我问题出在哪里？

(关于A和B，它们与这个问题无关。因为我确实用sparseLU得到了答案，它是eigen的内置求解器。但是它的速度太慢了，我尝试使用pardisoLU。)

#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <Eigen/Sparse>
#include <unsupported/Eigen/SparseExtra>
#include <Eigen/PardisoSupport>

using namespace std;
using namespace Eigen;
typedef Eigen::Triplet<double> T;
typedef Eigen::SparseMatrix<double> SpMat;

int main(){ 
int m = 10000; // number of rows;
int n = 10000; // number of cols;
SpMat A(m,n); // declare sparse matrix A
//
make tripletlist
//
A.setFromTriplets(TripletList.begin(), TripletList.end());
SpMat B(m,1);
// 
insert values into B
//
PardisoLU< SparseMatrix<double> > solver( A );
x = solver.solve( B );
}

并使用g++将其编译为

g++ -I ${Eigenroot} -DEIGEN_USE_MKL_ALL -DMKL_ILP64 -m64 -I ${mklroot}/linux/mkl/include -o out.out code.cpp -L ${mklroot}/linux/mkl/lib/intel64 -Wl, -lmkl_intel_ilp64 -lmkl_gnu_thread -lmkl_core -lmkl_blacs_intelmpi_ilp64 -lgomp -lpthread -lm -ldl

Answer 1

ILP64链接可能会出现一些问题。您是否可以尝试在没有-DMKL_ILP64选项的情况下使用-lmkl_intel_lp64而不是-lmkl_intel_ilp64进行链接