如何顺序运行多个.sbatch脚本

Question

我必须为集群运行多个sbatch slurm脚本。假设我有50个sbatch文件，我在终端中按顺序运行它们(我使用Ubundu)，如下所示：

sbatch file1.sbatch  
sbatch file2.sbatch
.  
.  
.  
sbatch file50.sbatch

我想简化这50个不同的命令，使其在单个命令中运行。由于我是新接触终端和集群的人，我真的不知道如何处理这个问题。请给我一些执行此操作的解决方案(我猜我需要使用一些for loop语句，但我对哪种语法有疑问)。我完全迷惑了，一些相关的文档可能也会有所帮助。

谢谢。

更新:我尝试了以下脚本：

#!/bin/bash  
for i in {1..3}  
do   
    sbatch layer$i.sbatch  
done  

但是，它并没有创造出单独的就业机会。仅将单个作业作为整体提交。所以，这对我不起作用。

$ ~/Marabou% sbatch call_sbatch.sbatch  
Submitted batch job 4576049  

谢谢。

更新：

下面的脚本可以工作：

import os

os.system ("sbatch filename1.sbatch")

os.system ("sbatch filename2.sbatch")

Answer 1

您准备的代码应该在交互式shell中运行，而不是启动到队列中。

直接运行你的代码：

$ sh call_sbatch.sbatch

或者，如果你的文件是可执行的，

$ ./call_sbatch.sbatch

它应该使用您创建的循环运行内部行，该循环将向队列发送您感兴趣的作业(在您的示例代码中，有三个作业: layer1.sbatch、layer2.sbatch和layer3.sbatch)。