我想使用我的贝叶斯网络作为分类器,首先是完整证据数据(predict),但也是不完整数据(bnlearn::cpquery)。但似乎,即使使用相同的证据,函数也会给出不同的结果(不仅仅是基于采样造成的轻微偏差)。
有了完整的数据,就可以很容易地使用R的predict函数:
predict(object = BN,
node = "TargetVar",
data = FullEvidence ,
method = "bayes-lw",
prob = TRUE)通过分析prob属性,我了解到predict-function只选择具有最高概率的因子级别。
当涉及到不完整的证据(只知道某些节点的结果)时,predict不再工作:
Error in check.fit.vs.data(fitted = fitted,
data = data,
subset = setdiff(names(fitted), :
required variables [.....] are not present in the data.` 因此,我想使用带有已知证据列表的bnlearn::cpquery:
cpquery(fitted = BN,
event = TargetVar == "TRUE",
evidence = evidenceList,
method = "lw",
n = 100000)同样,我只想使用概率最高的因子作为预测。因此,如果cpquery的结果高于0.5,我将预测设置为TRUE,否则设置为FALSE。
我试图通过给两个函数提供相同的(完整的)数据来监控这个过程,但它们没有给我返回相同的结果。
做这件事的“正确”方法是什么?只使用cpquery,也可以处理完整的数据?为什么会有很大的差异?
谢谢你的帮忙!
发布于 2018-05-15 18:11:59
正如user20650所说,增加预测呼叫中的样本数量是获得非常相似结果的解决方案。所以只需在函数调用中提供参数n = ...即可。
当然这是有道理的,我只是不知道predict()函数中的这个参数。在bn.fit utilities中没有关于它的文档,在predict的非常通用的文档中也没有。
https://stackoverflow.com/questions/50251413
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