(shell script - qsub)等待提交的作业完成，然后再执行下一个命令

Question

我的shell脚本涉及qsub作业提交，然后将该作业生成的文件复制到其他位置。如何做到这一点？

下面是我的shell脚本的样子：

...
qsub synplify.csh
cp ./rev_1/netlist.vqm ~/sample
...

在这里，synplify.csh作业已在服务器上提交，但尚未完成。并且它为执行第二行扫清了道路。因此，在处理第一个作业时执行第二行。我希望在作业完成后执行第二行。

Answer 1

使用-sync y选项。

qsub -sync y synplify.csh
cp ./rev_1/netlist.vqm ~/sample

从man page

-sync y使qsub在退出前等待作业完成。

Answer 2

您可以按如下所述链接命令：

https://unix.stackexchange.com/questions/63648/how-to-send-many-commands-to-shell-and-wait-for-the-command-behind-ends

或者，您可以提交使用作业依赖关系的单独脚本(使用afterok)：

http://docs.adaptivecomputing.com/torque/6-0-2/adminGuide/help.htm#topics/moabWorkloadManager/topics/jobAdministration/jobdependencies.html