检测目标区域内或外部的BLAST匹配

Question

在那里，我将从一个目标序列位点提取一段DNA序列，用它来攻击一个基因组。然后从blast结果输出中，我想知道除了匹配目标站点之外，是否还有来自其他区域的匹配序列。如何从BLAST输出中知道？基因组站点有什么指标吗？谢谢

Answer 1

• 您可以检查100%匹配(或其他截止值)的区域的blast输出。
• 然后检查匹配的区域是否接近查询序列的总长度。
• 如果有多个匹配参数通过这些参数，则可以通过检查匹配的脚手架以及匹配区域的开始和结束坐标来确定它们是否与基因组的不同区域匹配。