使用bioperl从GFF3数据库中获取属性值

Question

我已经用GFF3商店对象(BIO: DB :SeqFeature: Store )创建了一个BioPerl DB，我自己从Blastx结果创建了GFF3文件，并创建了一系列我自己的标记作为属性。现在，我将从BioPerl为我创建的数据库中获取此值。

我该怎么做呢？

请帮帮我！非常感谢。

Answer 1

我发现现有的函数在BIO::SeqFeature::Generic包中可以做到这一点。最有用的是get_tag_values，它返回一个数组，每个值都包含在属性中，并在输入中给出一个特定的标记！

用法：

my @values= $feature->get_tag_values('go');

再见所有人！