PubMed是美国国家医学图书馆的综合性数据库，免费提供MEDLINE和生命科学文献。使用布尔运算符、MeSH术语和字段标签构建高级查询，通过E-utilities API以编程方式访问数据，适用于系统评价和文献分析。

使用布尔运算符、字段标签和特殊语法构建复杂的PubMed查询。

# 关于糖尿病治疗的近期系统评价
diabetes mellitus[mh] AND treatment[tiab] AND systematic review[pt] AND 2023:2024[dp]

# 比较两种药物的临床试验
(metformin[nm] OR insulin[nm]) AND diabetes mellitus, type 2[mh] AND randomized controlled trial[pt]

# 特定作者的研究
smith ja[au] AND cancer[tiab] AND 2023[dp] AND english[la]

字段标签的Grep模式：\[au\] \[ti\] \[ab\] \[mh\] \[pt\] \[dp\]

使用医学主题词表（MeSH）在生物医学文献中进行精确、一致的搜索。

# 糖尿病治疗，重点关注
diabetes mellitus, type 2[mh]/drug therapy AND cardiovascular diseases[mh]/prevention & control

按出版类型、日期、文本可用性和其他属性过滤结果。

出版类型（使用[pt]字段标签）：

# 关于高血压的近期免费全文RCT
hypertension[mh] AND randomized controlled trial[pt] AND 2023:2024[dp] AND free full text[sb]

使用NCBI E-utilities REST API以编程方式访问PubMed数据，用于自动化和批量操作。

import requests

# 步骤1：搜索文章
base_url = "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/"
search_url = f"{base_url}esearch.fcgi"
params = {
    "db": "pubmed",
    "term": "diabetes[tiab] AND 2024[dp]",
    "retmax": 100,
    "retmode": "json",
    "api_key": "YOUR_API_KEY"  # 可选但推荐
}
response = requests.get(search_url, params=params)
pmids = response.json()["esearchresult"]["idlist"]

# 步骤2：获取文章详情
fetch_url = f"{base_url}efetch.fcgi"
params = {
    "db": "pubmed",
    "id": ",".join(pmids),
    "rettype": "abstract",
    "retmode": "text",
    "api_key": "YOUR_API_KEY"
}
response = requests.get(fetch_url, params=params)
abstracts = response.text

API端点的Grep模式：esearch efetch esummary epost elink einfo

使用部分引文信息或特定标识符查找文章。

# 按PMID
12345678[pmid]

# 按DOI
10.1056/NEJMoa123456[doi]

# 按PMC ID
PMC123456[pmc]

使用期刊名称、年份、卷、页码和作者查找PMID：

格式：journal|year|volume|page|author|key|
示例：Science|2008|320|5880|1185|key1|

# 第一作者加上年份和主题
smith ja[1au] AND 2023[dp] AND cancer[tiab]

# 期刊、卷和页码
nature[ta] AND 2024[dp] AND 456[vi] AND 123-130[pg]

进行系统评价和元分析的全面文献搜索。

PICO框架（人群、干预、比较、结果）：

# 示例：糖尿病治疗效果
# P: diabetes mellitus, type 2[mh]
# I: metformin[nm]
# C: lifestyle modification[tiab]
# O: glycemic control[tiab]

diabetes mellitus, type 2[mh] AND
(metformin[nm] OR lifestyle modification[tiab]) AND
glycemic control[tiab] AND
randomized controlled trial[pt]

# 包含多个同义词和MeSH术语
(疾病名称[tiab] OR 疾病名称[mh] OR 同义词[tiab]) AND
(治疗[tiab] OR 疗法[tiab] OR 干预[tiab]) AND
(系统评价[pt] OR 元分析[pt] OR 随机对照试验[pt]) AND
2020:2024[dp] AND
english[la]

查询示例的Grep模式：diabetes cancer cardiovascular clinical trial systematic review

使用PubMed的搜索历史和My NCBI功能实现高效的研究工作流。

#1: diabetes mellitus[mh]
#2: cardiovascular diseases[mh]
#3: #1 AND #2 AND risk factors[tiab]

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查找相关研究并探索引文网络。

每篇PubMed文章都包含基于以下内容的预计算相关文章：

# 以编程方式查找相关文章
elink.fcgi?dbfrom=pubmed&db=pubmed&id=PMID&cmd=neighbor

以多种格式导出搜索结果，用于引文管理和进一步分析。

# 以MEDLINE格式导出引文
efetch.fcgi?db=pubmed&id=PMID1,PMID2&rettype=medline&retmode=text

此技能在references/目录中包含三个全面的参考文件：

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PubMed直接REST API访问。高级布尔/MeSH查询、E-utilities API、批量处理、引文管理。对于Python工作流，推荐使用biopython（Bio.Entrez）。用于直接HTTP/REST工作或自定义API实现。

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