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R包:regplot绘制回归模型的列线图

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生信学习者
发布2024-11-17 10:22:33
发布2024-11-17 10:22:33
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介绍

R包regplot:这个包提供了一个函数,用于绘制回归模型的列线图(Nomogram)。这种图形是一种可视化工具,用于展示预测模型的结果,使得模型的预测过程更加直观和易于理解。regplot函数可以处理多种类型的回归模型,包括线性回归、逻辑回归和Cox回归等。它允许用户自定义图形的各个方面,如协变量分布的展示方式、图形的标题、是否显示P值星号等。此外,regplot还支持动画,允许用户动态更改分布表示,并进行交互式结果计算。

加载R包

代码语言:r
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library(regplot)
library(survival)

# Survival model for pbc data

生存分析

代码语言:r
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data(pbc) 

pbccox <-  coxph(formula = Surv(time, status == 2) ~ age
                 + cut(bili, breaks=c(-Inf, 2, 4, Inf)) + sex  
                 + copper + as.factor(stage), data = pbc)

画图

绘制回归模型的列线图(Nomogram)

代码语言:r
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regplot(pbccox,
        observation = pbc[1, ], 
        clickable = TRUE, 
        points = TRUE, 
        rank = "sd", 
        failtime = c(730, 1825)) 

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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