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多基因评分（PGS）和分子标记辅助选择（MAS）
大家好，我是邓飞，人类中多基因得分（PGS）这个方法，相当于动植物中的分子标记辅助（MAS）或者是基因组选择（GS）。虽然概念有所区分，但是理论都是相通的。下面...
邓飞 4小时前2026-03-12 18:27:15
数据库、教程、模型、数据、统计
孟德尔抽样误差与 GBLUP 的关系
孟德尔抽样误差（Mendelian sampling error）是指个体育种值与父母平均育种值的离差，用数学表达为：
邓飞 4小时前2026-03-12 18:25:47
优化、管理、实践、数据、数学
使用TASSEL软件学习GWAS笔记总结
大家好，我是邓飞，今天重新发一下之前写的TASSEL做GWAS分析的教程，前几天有幸和TASSEL和GAPIT软件包的作者张志武老师做了一个腾讯会议的视频沟通，...
邓飞 4小时前2026-03-12 18:24:34
模型、软件、数据、笔记、可视化
How to | 知道单倍型+表型数据，如何做显著性分析可视化
大家好，我是邓飞，今天介绍一下，知道群体的单倍型数据，知道群体的表型数据，如何计算单倍型和表型数据的显著性分析，以及做一个小提琴图？
邓飞 4小时前2026-03-12 18:20:56
图表、教程、可视化、数据、统计
围棋学不好的数据分析师如何能做好育种？
围棋作为最后被计算机攻克的棋牌类游戏，它的复杂度相对于其它游戏遥遥领先，之前没有接触过，一直感觉到高深莫测，也没有机会学习，这次入门围棋让我想到了很多，写篇博客...
邓飞 5小时前2026-03-12 18:19:02
人工智能、数据分析、模块化、配置、效率
根红苗正的GWAS软件：GEMMA
跑GWAS项目，几百个样本，几万个位点，rMVP、GAPIT都可以用，如果是几千万个位点，几千个样本，GEMMA运算速率更高，占用内存和运行时间都比较理想，下面...
邓飞 5小时前2026-03-12 18:09:08
数据、语法、txt、变量、软件
工具推荐 | 支持动物模型中系谱常见的错误检测：个体重复、父母本交叉和系谱循环
在进行数据分析特别是动物模型计算BLUP值时，会用到系谱数据，原始的系谱数据各种问题，分析起来头大，之前写过一些清洗数据的函数，但是对于很多老师还是门槛太高，今...
邓飞 5小时前2026-03-12 18:06:53
软件、数据、数据分析、工具、教程
单性状动物模型计算BLUP值
同事去大骨头, 吃过之后进行了抽奖, 然后向我炫耀, 看我抽到了一个小猪佩奇. 照片如下:
邓飞 5小时前2026-03-12 17:53:16
模型、数据、变量、工具、函数
群体遗传三剑客第一剑：主成分分析PCA
群体遗传学中常用的三大分析工具：主成分分析（PCA）、Admixture分析和进化树（Phylogenetic Tree），它们在分析基因型数据时各有侧重，互为...
邓飞 5小时前2026-03-12 17:52:12
二进制、工具、数据、原理、pca
滴滴代跑大基因组/转录组分析—数信院
大基因组的大样本重测序数据量动辄几十G上百G，本地电脑CPU、内存和硬盘空间根本吃不消；
邓飞 5小时前2026-03-12 17:48:59
网络、效率、服务器、内存、数据
进化树分析直接上传数据，很快的
https://asreml.cn/population-genetics/phylogenetic
邓飞 5小时前2026-03-12 17:46:43
命令行、软件、数据、二进制、可视化
TASSEL软件下载
大家好，我是邓飞，这一篇主要是灌水，因为有小伙伴问我Tassel的安装包，因为tassel下载网络不太好:
邓飞 5小时前2026-03-12 17:33:04
软件、数据、tiff、可视化、模型
GWAS功效（Power）分析？一篇讲透
做GWAS的小伙伴谁没踩过这坑：吭哧吭哧测了样本、跑了模型、画了曼哈顿图，结果要么没检出显著位点，要么检出的位点验证不出来——大概率是功效（Power）没算对...
邓飞 5小时前2026-03-12 17:24:44
效率、教程、模型、数据、统计
道友请留步！教你在R语言中召唤plink法器，无需跨界切换
修仙之路，法器为先。R语言与plink宝刃，皆是咱们数据修仙界的常用本命法器——R仙府擅长推演可视化，plink宝刃专精基因型数据淬炼，二者相辅相成，缺一不可。
邓飞 5小时前2026-03-12 17:23:37
系统、pca、脚本、可视化、数据
我用"小龙虾"打开了电脑，还写了一篇读书笔记 | 附带小龙虾配置教程
Openclaw这个AI应用如今特别火，听说腾讯也准备释放自己的Qclaw，网页：
邓飞 6小时前2026-03-12 17:11:45
公众号、教程、配置、手机、读书笔记
如何用 GCTA软件进行PCA分析并进行可视化
GRM = sum{[(xij- 2pi)*(xik- 2pi)] / [2pi(1-pi)]}/N
邓飞 2025-11-192025-11-19 16:32:08
pca、兼容性、可视化、软件、数据
群体遗传三剑客：PCA、Admixture、进化树
群体遗传学中常用的三大分析工具：主成分分析（PCA）、Admixture分析和进化树（Phylogenetic Tree），它们在分析基因型数据时各有侧重，互为...
邓飞 2025-11-192025-11-19 16:31:11
工具、可视化、数据、原理、pca
一文搞定单倍型Haploview分析（万字详解）
我们做完GWAS分析，得到了显著性位点，注释到了上下游的基因，这时，一个想法浮现在眼前：你如何证明你找到的基因不是假阳性？？？
邓飞 2025-11-192025-11-19 16:28:17
配置、软件、数据、系统、终端
如何从遗传力的角度来看待提升育种效率
家好，我是邓飞。最近翻遗传力相关的资料时突然想到：咱们研究任何概念，最终都是为了 “用起来”。那遗传力这东西，到底怎么帮咱们提升育种效率？
邓飞 2025-11-192025-11-19 16:18:32
数据、统计、效率、芯片、数据分析
为何要计算杂合度以及如何计算杂合度
好久没有更新了，最近的感受：沉淀的结果是，蓦然回首，一无所有。负重前行，走的更远，轻装上阵，原地打转。用通俗的话讲就是：不写公众号，就可以有更多的时间积累和学习...
邓飞 2025-11-192025-11-19 16:16:48
数据、file、mean、公众号、函数

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个人简介

北京康普森农业科技有限公司 | 育种数据分析师
育种数据分析之放飞自我
python 数据分析编程算法大数据机器学习
河南农业大学 | 作物遗传育种（硕士）
http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=2577109
北京
加入社区时间：2019-05-07

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