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比 Boltz-2 快十倍: Nesso-1 的粗粒化共折叠路线
Nesso-1 是一个面向结合亲和力预测的粗粒化共折叠模型。它删除了 Boltz-2 一类模型中计算最昂贵的全原子扩散生成模块，用蛋白残基中心、配体重原子及其成...
DrugIntel 8小时前2026-07-27 20:28:57
论文、模型、排序、数据、测试
Nature | AlphaFold3接触建模实现精准DNA碱基编辑
DNA碱基编辑技术能够在不引入DNA双链断裂的情况下实现单碱基精确修饰，是当前基因治疗和遗传疾病研究的重要工具。然而，脱靶编辑始终限制着其进一步应用。传统提高编...
DrugIntel 3天前2026-07-24 20:05:31
人工智能、编辑器、框架、数据、优化
Proc. Natl. Acad. Sci. | AI蛋白质结构预测模型对静电相互作用的刻画精度
近年来，以AlphaFold2、RoseTTAFold、ESMFold和OmegaFold为代表的人工智能蛋白质结构预测模型极大推动了结构生物学的发展。然而，这...
DrugIntel 4天前2026-07-23 20:26:01
proc、模型、设计、数据、深度学习
Cell | 利用MSA Pairformer将蛋白质语言模型拓展至蛋白质相互作用预测
蛋白质之间的相互作用构成了几乎所有生命活动的基础，因此准确理解蛋白质复合体的协同进化规律，对于解析生命过程、预测突变效应以及设计新型蛋白具有重要意义。近年来，蛋...
DrugIntel 4天前2026-07-23 20:25:40
基础、模型、设计、数据、cell
依原子之境，塑蛋白之序：LigandMPNN 的蛋白序列设计之道
论文题目： Atomic context-conditioned protein sequence design using LigandMPNN 期刊： Na...
DrugIntel 4天前2026-07-23 20:25:28
论文、模型、设计、搜索、统计
AIDD Idea Atlas | 重新蒸馏了 15000 个 AIDD idea
当时的平台收录了 15,000 个由 AI 协助生成和整理的 AIDD 研究想法，希望先尽可能展开这个领域的选题范围，为不同方向的研究者提供一张可以自由浏览的研...
DrugIntel 6天前2026-07-21 12:47:59
数据、网站、基础、模型、设计
Nature | Chroma：把蛋白质设计变成可编程生成问题
论文题目：Illuminating protein space with a programmable generative model 期刊：Nature 发...
DrugIntel 6天前2026-07-21 12:47:25
神经网络、论文、模型、设计、统计
Science | 蛋白质的语言、结构与功能：ESM3 的方法逻辑、实验验证与局限
论文题目： Simulating 500 million years of evolution with a language model 期刊： Scienc...
DrugIntel 6天前2026-07-21 12:47:07
数据、优化、论文、模型、设计
BoltzDesign1：把全原子结构预测模型反过来做通用 binder 设计
论文标题： BoltzDesign1: Inverting All-Atom Structure Prediction Model for Generalize...
DrugIntel 6天前2026-07-21 12:46:48
设计、优化、翻译、论文、模型
AlphaFold3 到底有多可靠？五类应用揭示其能力边界、特异性缺口与训练数据依赖
论文题目：Capabilities, specificity gaps and training-data dependence of AlphaFold3 a...
DrugIntel 10天前2026-07-17 20:45:53
论文、模型、排序、数据、连接
Sci. Adv. | YuelDesign 解读：面向柔性蛋白口袋的 3D 分子扩散生成框架
论文题目： A diffusion-based framework for designing molecules in flexible protein po...
DrugIntel 11天前2026-07-16 21:50:20
论文、模型、设计、系统、框架
AlphaFold 不只是预测结构：它如何把蛋白 binder 设计成功率提高近 10 倍？
论文题目： Improving de novo protein binder design with deep learning 期刊： Nature Comm...
DrugIntel 12天前2026-07-15 14:28:10
设计、效率、优化、论文、模型
Nature | 深度网络幻觉设计：蛋白结构预测模型的另一种打开方式
这篇 Nature 文章提出了一个非常直接但影响深远的问题：一个训练来预测蛋白结构的深度网络，是否不仅能读懂天然蛋白，也能反过来设计从未在自然界出现过的新蛋白？...
DrugIntel 13天前2026-07-14 14:03:29
优化、函数、模型、设计、网络
Nature | 把 RoseTTAFold 变成生成模型：RFdiffusion 的方法细节、实验结果与局限
RFdiffusion 是 AI 蛋白设计领域非常值得精读的一篇工作。它的核心贡献不是简单把扩散模型搬到蛋白上，而是把 RoseTTAFold 这类结构预测网络...
DrugIntel 14天前2026-07-13 16:22:21
框架、论文、模型、设计、网络
J. Am. Chem. Soc. | 自动化平行合成加速虚拟筛选苗头化合物发现
这项工作构建了一个基于现有肽合成设备的自动化并行小分子合成平台，将2290万规模的可计算化学空间约束为具有明确反应路线的可执行化学空间，并通过CCR2前瞻性虚拟...
DrugIntel 14天前2026-07-13 16:22:12
模型、数据、优化、自动化、论文
AAAI | AI 扩散分子生成走向动态口袋：Apo2Mol 的方法逻辑、实验结果与局限
论文题目： Apo2Mol: 3D Molecule Generation via Dynamic Pocket-Aware Diffusion Models ...
DrugIntel 14天前2026-07-13 16:22:00
模型、设计、数据、测试、论文
NeurIPS | 柔性蛋白建模进入 3D 分子生成：FlexSBDD 的技术逻辑与局限
论文题目： FlexSBDD: Structure-Based Drug Design with Flexible Protein Modeling 作者： Z...
DrugIntel 14天前2026-07-13 16:21:52
设计、数据、变量、论文、模型
Nat. Protoc. | AI 对接终于走向可用平台？浙大团队打造CVSP-AIE 把AI虚拟筛选做成工作流
论文题目： Facilitating structure-based drug discovery with an artificial intelligenc...
DrugIntel 14天前2026-07-13 16:21:46
模型、排序、nat、工作流、论文
PNAS | AI 蛋白结构预测的中间里程碑：trRosetta 方法全解析
论文题目：Improved protein structure prediction using predicted interresidue orientat...
DrugIntel 19天前2026-07-08 16:53:57
深度学习、模型、设计、网络、优化
ICML | SynLaD：药效团导引下的可合成分子扩散生成
论文题目： SynLaD: Latent Diffusion for Generating Synthesizable Molecules Conditione...
DrugIntel 20天前2026-07-07 18:12:57
论文、模型、设计、数据、工具

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