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lncRNA组装流程的软件介绍之gffcompare

1.输出文件六个,前四个文件可以指定保存位置，后两个文件是跟输入的gtf文件保存在一个位置，并且都是以-o提供的前缀开头的

生信技能树 2021-07-062021-07-06 15:50:38

class、code、conda、na、软件

lncRNA组装流程的软件介绍之Stringtie

该软件的官网：https://ccb.jhu.edu/software/stringtie/index.shtml。

生信技能树 2021-07-062021-07-06 16:00:25

linux、数据结构、编程算法

lncRNA的一些基础知识

同样的策略，我们也可以应用到lncRNA的学习。以前我在：miRNA、LncRNA、CircRNA靠谱小结也提到过一些基础知识，但还不够丰满！其实读一篇综述是...

生信技能树 2019-12-312019-12-31 16:42:13

编程算法、https、网络安全、数据库、sql

lncRNA-seq数据分析之新lncRNA鉴定和注释视频课程众筹

不过对于其它物种，猫狗猪，甚至其它你叫不出来名字的昆虫，鱼类，这个分析策略还是蛮常见的。比如发表在Front. Genet., 18 March 2019 | ...

生信技能树 2020-03-172020-03-17 16:16:02

linux、https、网络安全、微信

鉴定lncRNA流程全套代码整理

前两期周更我们通过一篇文章的复现整理了mRNA和lncRNA分析基本流程，但并没有涉及新lncRNA的鉴定，本周的推文本质上是我个人学习鉴定lncRNA的全套流...

生信菜鸟团 2023-08-232023-08-23 09:08:19

数据库、软件、视频、数据、索引

转录组分析 | 使用Hisat2进行序列比对

转录组分析 | 使用trim-galore去除低质量的reads和adaptor

DoubleHelix 2020-09-232020-09-23 12:47:26

github、https、git、开源、网络安全

转录组分析 | 使用Stringtie对数据进行下游处理

StringTie 是用于 RNA-seq 的转录本组装和定量软件，StringTie 可以看做是cufflinks软件的升级版本，其功能和Cufflinks是...

DoubleHelix 2020-09-232020-09-23 12:06:15

数据结构、flink、大数据、编程算法、node.js

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TA 很懒，什么都没有留下╮（╯＿╰）╭

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