Day3—生信星球小组学习-LuKa

Day3生信星球小组学习-LuKaLinux环境下的软件安装Linuxe如何安装软件 在Linux环境下，有三种常用的安装软件的方法：源码安装、包管理器安装和二进制包安装。

生信星球Day3 数据结构

read.table() #从文件中读取数据，sep表示文件中的分隔符，header表示第一行是否为标题行

生信星球——生信入门DAY3：Linux环境下安装软件

今天这部分比较痛苦……因为我用的是自己的MacBook的terminal，第一个指令

生信星球学习小组-Day3学习笔记--conda

为了生信分析的需求，我们安装Miniconda即可。图片1. 首先，为了更加稳定、快速地获得Miniconda的安装包，我们需要从国内相关镜像网站下载，如清华、北外、国科大、阿里等镜像网站。

生信星球学习小组 DAY3 conda的使用

wget -c https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 下载miniconda安装包

生信星球 —— day 7

生信星球1. 一二三代测序每一代测序都是为了解决上一代的问题，但又不完美一代测序准确度高，但通量低二代测序即高通量测序，但读长短三代测序读长长，但准确度低2.

​生信星球--生信入门DAY1

R 语言与 C 语言都是贝尔实验室的研究成果，但两者有不同的侧重领域，R 语言是一种解释型的面向数学理论研究工作者的语言，而 C 语言是为计算机软件工程师设计的。

生信星球 day 6

by = 'x')5.反连接：返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join6.简单连接：bind_rows()函数需要两个表格列数相同，而bind_cols()函数则需要两个数据框有相同的行数生信星球

生信学习day3

一、conda--“linux的应用商店”1.软件管理Miniconda，相当于App store，最方便快捷的软件下载器知识星球conda是大Boss，最初为管理python包而建立，它是一个大的涵盖许多领域的软件包管理器 anaconda是总管，职务比conda低，但干的活不少，也是个有内涵的家伙miniconda是区域经理，说白了就是干事的，而且比较专一，主要负责生信领域二、如何下载软件1.创建biosoft（mkdir 从某链接下载软件：wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh生信星球 然后出现这个界面：3.下载完成后，运行 ：bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh,然后开始安装过程4.激活：source ~/.bashrc（注意空格）生信星球：激活不成功就将 add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/conda config --set show_channel_urls yes生信星球三

生信提升day3

environment”为了满足不同项目需要的相同软件的不同版本1.查看conda有哪些环境（带*已激活）2.创建也成功了3.成功成功，芜湖~4.退出当前环境conda deactivate 代码引用生信星球 ，说明部分引用生信星球心得，感觉今天比昨天简单，嘻嘻~

生信星球 Day 4 —— 橙子🍊

源自生信星球，由于有R基础，内容1、2、3跳过了基础代码1、显示文件列表（右下角窗口file直接有显示，在R中其实不那么重要）dir()list.files()图片2、显示历史命令（右上角history

生信星球——生信入门DAY7:测序

关于测序的入门，零基础的非常推荐【陈巍学基因】视频1，讲的很清晰，可以对二代测序有一个最基本的了解。

生信星球 day 5 ——橙子🍊

生信星球数据结构 向量vector 标量：1个元素 向量：多个元素 从向量中提取元素 x[4] x[x==10] 位置、逻辑值 数据框 a <- read.table(file='huahua.txt'

生信星球 day 3 —— 橙子🍊

安装一切顺利，愉快学习的一天，感谢生信星球，感恩豆豆花花，继续磕cp安装操作记录1.

生信星球 DAY 1 —— 橙子🍊

搜狗微信、搜狗知乎、github*STEP 2：高效学习1. 高效软件chrome浏览器|沙拉查词*、scholarscopesnipaste2. clinical,KLRB1_tr,by='CGGA_ID')View(CGGA_325_KLRB1)write.csv(CGGA_325_KLRB1,file = 'CGGA_325_KLRB1.csv')生信星球学习小组第

生信星球 day 2 —— 橙子🍊

n3 … #显示前3行|3可替换tail -n3 … #显示后3行cp file1 file2 #复制file1，命名file2mv #移动或重命名图片生信星球学习小组

生信星球——生信入门DAY4:R语言

rnorm(n,mean,sd)函数用于从具有特定均值和标准差的正态分布生成n个随机值。

生信星球--生信学习DAY2：适应Linux

权限控制多用户的权限控制命令行模式linux的操作靠命令行来实现目录结构文件系统呈树状，宿主目录放在home目录下2.为什么学生信要用linux？

生信星球Day5 Linux

生信星球Day6 conda

今日学习内容：了解conda下载和安装miniconda下载个软件看看---condaconda是linux的软件商店minconda包含了Python和conda，可用于生信使用装载miniconda