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  • 来自专栏生信修炼手册

    肿瘤新抗原简介

    肿瘤免疫治疗是一个近年来研究得非常火热的领域,取得了多项突破性的进展,免疫检查点抑制剂PD-1/PD-L1抗体在晚期实体瘤患者的治疗中取得了明显收益,嵌合抗原受体T细胞疗法CAR-T在血液肿瘤的治疗上也疗效显著 肿瘤疫苗是通过机体识别肿瘤特异性抗原(tumor specific antigen,TAS)或者肿瘤相关抗原(tumor associated TAA)来激活抗原呈递细胞,引起特异免疫应答反应来杀伤肿瘤细胞 TSA也称之为肿瘤新抗原neoantigen, 是由肿瘤细胞的体细胞变异产生的一种异常蛋白。 新抗原通过MHC分子结合,从而被T细胞受体T-cell receptor(TCR)识别,引发免疫应答反应。 结合NGS和生信分析,可以快速预测肿瘤新抗原。 在进一步结合体外实验验证,筛选阳性的新抗原。 随着肿瘤新抗原检测和预测技术的不断发展,基于新抗原的免疫治疗也取得了突破性进展,在后续文章中会详细介绍相关软件的使用。

    1.3K20发布于 2019-12-19
  • 抗原设计与合成服务|定制抗原技术|高效多肽合成

    本篇详细介绍抗原设计与合成的技术要点、服务内容及质量控制措施,旨在为科研人员提供清晰的技术路线参考。一、抗原设计技术抗原设计是抗原合成的前提,科学合理的设计能够显著提高免疫应答的特异性和效率。 常用的抗原设计标准包括以下几个方面:免疫原性预测通过算法评估氨基酸序列中可能引发免疫应答的表位,重点考虑抗原决定簇的暴露性和疏水性,以确保其能被免疫系统有效识别。 严格的质控体系确保每批抗原产品均符合高标准:纯度检测HPLC纯度分析确保抗原的化学纯净度,通常要求≥90%。分子量确认通过质谱确认抗原分子量,验证合成准确性。 生物活性验证部分服务包括免疫活性测试,确保抗原能够有效激活免疫反应。内毒素检测尤其对重组蛋白抗原,严格控制内毒素含量,满足免疫学实验安全标准。 A: 抗原合成质量通过多种检测技术保障,包括高效液相色谱(HPLC)检测纯度,质谱(MS)确认分子量,SDS-PAGE分析结构完整性,以及必要时进行免疫活性验证和内毒素检测,确保抗原满足科研和临床研究标准

    17900编辑于 2025-07-29
  • 【免疫学实验】放射免疫法、酶联免疫吸附法和竞争抑制分析

    在这两种方法中,我们都需要一种已知抗原或抗体的纯制剂(或者两者都需要),以便制定标准曲线。根据标准曲线我们可以分析样品中特定抗原的量,如患者血清中的HIV p24 蛋白的量。 其原理是利用未知样本中特定抗原与一个标记的参考抗原竞争结合塑料板上附着的抗体,从而检测特定抗原的含量。 方法如下:首先通过添加各种已知的、未标记的标准制剂的量来构建标准曲线;再通过与标准的比较,就可以测定未知样品中抗原的含量。 图2 未知样品中抗原的竞争抑制分析:将未标记抗体固着于一组孔内,并将标记的抗原标准制剂与之结合。然后将未标记的标准或试验样品以不同剂量加入,测量标记的抗原标准取代的量,生成特征性的抑制曲线。 将已知剂量的未标记抗原标准生成的标准曲线与未标记的试验样品产生的曲线进行比较,即可计算出未知样本中的抗原量。图中的绿线表示不与抗A抗体反应的样品。

    21210编辑于 2025-12-29
  • 来自专栏用户7627119的专栏

    肿瘤新抗原突变负荷分析

    肿瘤新抗原(Neoantigen)是由肿瘤细胞突变基因编码的新生抗原,主要由基因点突变、删除突变、基因融合等产生的与正常细胞表达的蛋白不一样的新的异常蛋白。一般来说,高TMB患者有更多的新抗原。 2.分析方法 (1)新抗原负荷评估 使用突变数据对肿瘤特异新抗原样本过滤,保留个812 Pan-Gyn样本。使用R包maftools对 MAF文件计算 Pan-Gyn NAL。 根据不同的免疫状态选取60%和80%的新抗原负荷区间,获得163个样本的新抗原负荷高(NAL-H)组,161个样本的新抗原负荷中(NAL-M)组,488个样本的新抗原负荷低(NAL-L)组。 新抗原负荷亚组的体细胞突变特征 三、新抗原负荷亚组与临床结果的关系 相比于NAL-M 和 NAL-L,NAL-H的生存最好(图3A)。比较了亚组之间的临床协变量的差异(表1)。 最近一篇论文报道了肿瘤抗原的特异性活性CD8C和CD4C T细胞在免疫治疗中可诱导抗肿瘤反应。辅助T细胞的免疫反应是CD4C T细胞能够识别MHC II抗原,在抗肿瘤活性中发挥重要作用。

    3.5K41发布于 2020-08-05
  • 来自专栏青青青山的学习笔记

    ELISA简介及基于夹心法的PK方法学开发实例

    如果一个ELISA方法需要达到精密,准确等验证需求,在定量方法的开发过程中包被抗原的量要远远大于标准(样品)的量,这样样品能够抵消抗原抗体可逆反应的影响,使得近似所有的抗体样品均被捕捉到,标准曲线如果做对数线性拟合能够得到非常好的线性 3.2 实验试剂的准备 标准 标准可以是商品化的已知浓度的蛋白分子,也可以是自制的、已知浓度的纯度较高的蛋白分子。 标准一般为7-8个浓度点,拟合成合适的浓度-信号剂量曲线作为标准曲线进行内控和样品的定量。此处选择商品化的PD1蛋白。 包被抗原 选择商品化的PD-L1蛋白(his标签),购自ACRO。 浓度水平覆盖标准曲线范围:定量下限,在不高 于定量下限浓度3倍的低浓度质控样品(LQC), 标准曲线范围中部附近的中浓度质控样 (MQC),以及标准曲线范围上限约 75%处的高浓度质控样品(HQC), 之前确定的标准曲线定量限为1.28µg/ml-0.02µg/ml,将标准(12.8mg/ml)分别稀释100、1000、20000、40000及70000倍,来考察稀释可靠性。

    2.1K50编辑于 2022-05-17
  • 来自专栏生信修炼手册

    人类白细胞抗原-HLA简介

    HLA 全称human leukocyte antigen, 表示人类白细胞抗原,是编码主要组织相容性复合体(MHC)的基因,位于6p21.31的区域,包含了一系列紧密连锁的基因座。 根据基因产物的结构,功能,细胞分布等因素,将HLA基因分成了3大类:HLA-I型基因,包括了HLA-A, HLA-B,HLA-C等经典的抗原基因,还有一些假基因;HLA-II 型基因,其编码产物都是双链蛋白质 代表基因名称,前缀和基因名称之间用短横线连接;*星号作为分隔符,分隔符之后是同一个基因的不同allel, 由冒号分隔的多个部分构成,最多包含4个部分,第一组02代表不同的血清学类型,根据血清学鉴定的结果对不同抗原进行分类

    1.9K10发布于 2020-05-11
  • 来自专栏生信修炼手册

    TSNAdb:肿瘤新抗原数据库

    TSNAdb是一个肿瘤特异性新抗原的数据库,从TCGA和TCIA数据库中收集了16种肿瘤共7748个肿瘤样本的体细胞突变和HLA alleles信息,然后分别使用NetMHCpan v2.8和NetMHCpan Browser 通过基因名称来查看相关的肿瘤新抗原,可以指定分析的软件和肿瘤类型,检索框示意如下 ? 结果示意如下 ? 2. Search 通过基因名称进行检索,检索框示意如下 ? 热图中的每个格子代表突变的肽段与HLA alleles之前的结合亲和性,亲和性从低到高,颜色从黄色过渡到红色,有颜色的单元格代表一个肿瘤新抗原,鼠标悬浮到对应的单元格上可以显示突变,HLA Allel, 通过TSNAdb可以快速检索肿瘤新抗原,分析查找多种肿瘤中共享的新抗原,有助于寻找新的免疫治疗靶点。

    3.1K40发布于 2019-12-19
  • 来自专栏ELISA试剂盒产品推文

    特异性无交叉反应!Elabscience人主要组织相容性复合体G(MHCG/HLA-G)ELISA试剂盒守护科研准确性

    体积不足时需通过预实验确定稀释倍数避免随意稀释或改变试剂用量导致检测体系失衡储存条件与有效期2-8℃避光储存,有效期 12 个月需严格遵循储存条件,避免反复冻融影响试剂活性配套试剂洗涤液 (25×)、标准 检测原理基于双抗体夹心 ELISA 技术,具体流程如下:包被:将抗人 MHCG/HLA-G 单克隆抗体包被于酶标板孔内,形成固相抗体,封闭非特异性结合位点;样本结合:加入待检样本或梯度稀释的 MHCG/HLA-G 标准 ,样本中 MHCG/HLA-G 与固相抗体特异性结合,室温孵育后洗涤去除未结合成分;检测抗体结合:加入生物素化抗人 MHCG/HLA-G 抗体,与固相抗体 - 抗原复合物结合,形成 “固相抗体 - 抗原 亲和力常数 Kd≈10⁻¹⁵mol/L),形成稳定免疫复合物;加入 TMB 底物,HRP 催化 TMB 氧化呈蓝色,加入硫酸终止液后反应体系转为黄色;定量计算:酶标仪 450nm 波长下测定 OD 值,根据标准 洗涤步骤需充分(每孔洗涤 3-5 次,每次浸泡 30 秒),避免未结合成分残留导致背景信号升高;TMB 底物需避光保存,显色过程中避免强光照射,终止反应后 10 分钟内完成 OD 值测定,防止颜色消退影响结果;标准需按照说明书梯度稀释

    22600编辑于 2025-09-23
  • 来自专栏数商云贸

    MRO工业采购管理系统标准化企业采购流程,降低MRO采购成本

    传统MRO工业的采购和运输管理成本非常高,随着行业竞争加剧,企业面临生存危机,降本增效、提升竞争力成为企业的核心诉求,数字化转型成为大势所趋。 集“产、研、销”一体化的MRO工业采购管理系统,可为企业配置一键溯源、商品管理、价格比对、智能推荐、物流监控等功能,提升采购效率,量化并挖掘客户需求,匹配服务商及产品,MRO采购系统一站式解决工业企业采购难题 MRO工业采购管理系统价值优势 1、扩大供应商范围,提高采购效率 MRO采购商城系统有利于工业企业扩大供应商范围,提高MRO工业采购效率,降低采购成本,扩大规模效益。 2、规范采供行为,保障交付质量 搭建MRO采购系统有利于实现工业采购业务程序的标准化,规范采供双方的行为,保障产品交付质量,管控采购交易市场。 3、缩短决策周期,标准化采购流程 MRO工业采购平台系统以大数据、云计算等数字化技术预测客户购买需求,实时分析客户购买习惯、补货速率及产业工况,实现采购决策周期缩短,大幅提升企业运作效率。

    1.4K10编辑于 2022-05-09
  • 来自专栏生信修炼手册

    使用NetMHCpan进行肿瘤新抗原预测分析

    第二步选择切割肽段的方式,抗原通过抗原表位与MHC分子结合,MHC I型分子可以结合的抗原表位长度为8到11个氨基酸,对应这里的8-11mer,先将蛋白质序列切分成短的肽段之后在进行MHC分子亲和性的预测 通过该软件可以从突变之后的氨基酸序列中预测到与MHC I型分子亲和力较强的肽段,作为候选的肿瘤新抗原。 通过上述的数据分析,可以快速定位出候选的新抗原,然而其中的假阳性率还是非常高的,后续还需要结合体外实验来进一步筛选和过滤。

    9.9K30发布于 2019-12-19
  • 来自专栏聊点学术

    如何看待IHC实验的抗原修复环节?

    . ---- 01 — 抗原修复的重要性 抗原修复为什么这么重要呢? 首先,由于甲醛固定导致组织上很多抗原的免疫活性丢失,无法直接标记染色。 为了更好地恢复这些抗原的活性,我们必须要进行抗原修复这一步。 其次,在IHC实验中,我们使用的抗体是要与组织上的抗原直接结合的。 02 — 抗原修复的技术 抗原修复的技术过程,归结起来就一句话。 甲醛固定、石蜡包埋的组织抗原,在水溶性介质中随着加热时间的变化而出现的变化。 一定时间的加热处理是抗原修复的根本因素。 03 — 抗原修复的原理 甲醛固定后,组织抗原到底发生了什么? 综合来看,对于较难处理的抗原,如细胞核抗原,我们要选择更激烈的PH6.0枸橼酸钠+高温高压抗原修复法,而比较容易修复的胞质抗原则可考虑使用温和的微波+EDTA法修复。

    2.9K10发布于 2020-07-20
  • Alexa Fluor 647-Labeled Her2 His Tag 蛋白:精准检测与前沿研究的重要工具

    三、核心应用领域1.流式细胞术分析-标准曲线建立与绝对定量:作为定量标准,用于建立细胞表面Her2抗原表达数量的标准曲线,实现Her2表达的绝对定量,为临床分型(如Her2低表达)提供精确依据。 3.生物传感器与体外诊断开发-诊断试剂校准:作为标准抗原,用于校准基于Her2检测的免疫诊断试剂盒(如ELISA、化学发光),确保检测结果的准确性与可比性。 4.药物筛选与功能研究-抗体药物效价评估:作为靶点抗原,用于高通量筛选或评价靶向Her2的抗体药物、抗体偶联药物或小分子抑制剂的结合活性与功能性效力。 四、总结与展望AlexaFluor647-LabeledHer2HisTag蛋白集成了高纯度抗原、便利的纯化标签和高性能荧光报告基团,是进行Her2定量检测、机制研究和药物开发的高效、可靠的标准化工具。 未来,此类标准化的荧光标记蛋白工具,结合自动化分析平台与人工智能图像分析算法,将在推动肿瘤精准分型、指导个体化治疗及加速新型靶向药物研发中发挥越来越关键的作用。

    10810编辑于 2026-02-06
  • 【辰辉创聚生物】深度解析:肠道病毒71型(EV71)重组蛋白——科研的关键工具与抗原标准

    作为高纯度、高特异性的生物试剂,EV71重组蛋白为病毒基础研究、疫苗评价及药物筛选提供了标准化、安全可靠的核心材料。 EV71 VP1 重组蛋白作为最重要的抗原蛋白,重组VP1蛋白是EV71科研中的“明星分子”。 其技术优势在于:抗原代表性:完整保留了天然病毒颗粒表面的主要构象性与线性抗原表位,可作为病毒抗原标准,用于评估免疫血清的中和效价。 它们的重组形式:抗原互补:与VP1蛋白联合使用,可以更全面地模拟病毒衣壳的抗原复杂性,用于多表位抗体反应分析或疫苗免疫原性评价。结构研究辅助:作为蛋白支架或辅助组件,用于研究病毒衣壳的组装过程。3. EV71 抗原片段/多肽针对VP1等蛋白上的特异性抗原表位(如SP70表位)设计合成的重组多肽。其特点是特异性强、背景清晰,常用于表位定位、特异性T细胞免疫应答研究以及高特异性诊断试剂的开发。

    23410编辑于 2025-12-18
  • 人TNF-β试剂盒(HICA)的技术原理与应用研究

    该技术利用两种针对TNF-β不同抗原表位的特异性单克隆抗体,分别作为捕获抗体和检测抗体,实现对样本中TNF-β的定量检测。 (二)核心组件与反应流程试剂盒的主要组成包括:预包被捕获抗体的微孔板、生物素标记检测抗体、链霉亲和素-辣根过氧化物酶(HRP)结合物、标准、质控及显色底物等。 检测流程如下:将待测样本或标准加入微孔板,样本中的TNF-β与固相捕获抗体结合;洗涤去除未结合物质后加入检测抗体,形成抗体-抗原-抗体复合物;再次洗涤后加入酶结合物,与检测抗体上的生物素结合;最后加入底物显色 通过标准曲线计算样本中TNF-β的浓度。 研究者借此探讨T细胞亚群分化、抗原呈递细胞与淋巴细胞相互作用,以及不同刺激条件下TNF-β产生的动力学特征。

    9310编辑于 2026-02-25
  • 来自专栏运维开发故事

    运维是必需,安全是奢侈

    作者:乔克 公众号:运维开发故事 博客:www.jokerbai.com 最近在某群听到这句话:运维是必需,安全是奢侈。 ‍ 安全,一直是大部分公司想引起重视,又不引起重视的存在。 系统安全 如果按着等保 3 级的标准,系统安全要做的就比较多,比如要开启防火墙,要备份审计日志,要配置各种策略。

    1.2K10编辑于 2022-12-06
  • 来自专栏生信菜鸟团

    新工具:新抗原分析一步到位

    5.基于机器学习 ML 算法和 rule-based 方法分别筛选或排序 HLA-I 新抗原和HLA-II 新抗原、TAA 、癌病毒 6.NeoDisc 支持来自同一人的多个样本的数据集成,提供对肿瘤异质性和进化的见解 在默认设置中,用于免疫肽组学搜索的个性化蛋白质组中包括低置信度和高置信度变异,而新抗原预测仅考虑高置信度变异。突变数量较多的肿瘤往往对免疫疗法反应更好,这可能是因为它们呈递更多的新抗原。 免疫原性肿瘤特异性抗原(TSA)的检测:在 CESC-1数据集中,NeoDisc 检测新抗原的结果要优于其他算法(图2abc),在NPC-1数据集中, NeoDisc 在所有五个肿瘤样本中都检测到了 Epstein-Barr 在NCI数据集中,NeoDisc 的 HLA CN 估计与 LOHHLA 和Sequenza的结果非常相似 (图4) 肿瘤新抗原异质性:对于多病灶样本 MEL-4 数据集,NeoDisc 发现不同样本来源的抗原异质性 总结 NeoDisc作为一个先进的计算框架,通过整合多组学数据,除了提高HLA-I限制性新抗原的检测外,NeoDisc还能够识别和优先级排序来自多种来源的免疫原性抗原肽。

    46910编辑于 2024-11-23
  • Cathepsin F His Tag 蛋白:结构与功能研究的关键工具

    CathepsinF在细胞内主要参与抗原提呈、细胞凋亡调控、细胞外基质重塑等生理过程,其表达异常与多种疾病状态相关,包括神经退行性疾病、肿瘤转移和自身免疫性疾病等。 4.多功能应用:既可用于酶学性质研究,也可作为抗原用于抗体开发,或作为标准用于活性测定。 -免疫调节功能:研究其在抗原提呈细胞中对抗原处理的影响及其在自身免疫反应中的作用。3.药物开发应用-药物靶点验证:作为治疗靶点用于新型抑制剂的设计和优化。 -质量控制标准:每批次蛋白需进行纯度、浓度和活性三项指标的标准化检测。

    10010编辑于 2026-02-06
  • 来自专栏趣谈前端

    《运营笔记》

    嗨, 大家好, 我是徐小夕, 又到了我们每半年复盘一本 非技术 书籍的时候了, 记得上次写读书笔记还是1年前, 那本书叫《影响力》,我觉得对于提升技术人的格局和职场关系非常有价值, 所以写了一篇读书笔记:

    56410编辑于 2022-09-27
  • 来自专栏用户10341667的专栏

    申请WERCS注册需要提供符合最新标准的MSDSSDS 化学安全技术说明书

    图片一、MSDS/SDS 化学安全技术说明书是什么意思Material Safety Data Sheets (MSDS) and /or Safety DataSheets (SDS) 化学安全技术说明书 /安全技术说明书 MSDS (Material Safety Data Sheet) 即物质安全说明书,亦可译为化学安全技术说明书或化学安全数据说明书。 MSDS提供了化学在安全、健康和环境保护等方面的信息,推荐了防护措施和紧急情况下的应对措施,是化学供应商向下游用户传递化学基本危害信息的重要载体。 国标《化学安全技术说明书 内容和项目顺序》 (GB 16483)和《化学安全技术说明书编写指南》 (GB 17519)规定了MSDS编写的内容和方法。 二、申请WERCS注册需要提供符合最新标准的MSDS/SDS 化学安全技术说明书的相关问题Q: What if I don’t have an SDS for myproduct?

    53720编辑于 2023-03-27
  • 免疫球蛋白G在抗病毒感染中的核心作用及其定量评估价值

    其主要功能机制包括:中和作用------直接与病毒表面抗原结合,阻断其与宿主细胞受体的相互作用,从而阻止病毒入侵与复制;调理作用------通过Fc段介导巨噬细胞、中性粒细胞等免疫细胞对病原体的吞噬清除 在初次感染或疫苗接种后,B淋巴细胞被激活并分化形成浆细胞,特异性分泌针对该病毒抗原的IgG抗体。这些抗体是获得性免疫记忆的重要组成部分。 然而,病毒亦可通过抗原漂移或抗原转换等机制发生变异,以逃避既有抗体的识别与中和。 以TotalIgG试剂盒(AssayPro)为例,此类基于酶联免疫吸附法(ELISA)的试剂盒具有以下优势:-标准化与可靠性:提供标准化的操作流程与经过校准的参考,确保实验结果的准确性与批次间的一致性

    12810编辑于 2026-01-27
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