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- 来自专栏Sentieon：文献解读
Sentieon | Genetic Disease-RAD51B 胚系突变与胰腺导管腺癌显著相关
其中，携带BRCA2突变的肿瘤表现出较高的HRD评分，而携带CHEK2突变的肿瘤 HRD评分则为零。值得关注的是，本研究中有4例PDAC患者携带RAD51B基因突变，且均为胚系突变。 基因变异中错义突变占大多数（9个）；预测均会导致蛋白提前截断，从而引起BRCA2和RAD51B功能丧失的移码突变共2个；无义突变占1个。 值得注意的是，1例患者携带BRCA2的体细胞突变，其VAF仅为0.06。基因变异频率分析显示RAD51B突变频率最高（n=4，占50%），其次是BRIP1和RAD54L。 RAD51B的重要发现在8例携带HR-DDR 变异的患者中，有4例携带RAD51B变异，且均为胚系突变。作为RAD51蛋白家族的重要成员，RAD51B在DNA同源重组修复中发挥关键作用。 研究总结该研究发现RAD51B在PDAC中具有较高的胚系突变频率，但在当前的临床遗传学检测Panel中往往未被涵盖。
23210编辑于 2025-12-10 - 来自专栏AI机器学习与深度学习算法
学习分类 2-3 感知机
要如何求出权重向量呢？基本做法和回归时相同，将权重向量用作参数，创建更新表达式来更新参数。这就需要一个被称为感知机的模型。
63110编辑于 2022-11-08 - 来自专栏算法无遗策
动画 | 什么是2-3树？
2-3树正是一种绝对平衡的树，任意节点到它所有的叶子节点的深度都是相等的。 2-3树的数字代表一个节点有2到3个子树。它也满足二分搜索树的基本性质，但它不属于二分搜索树。 2-3树查找元素 2-3树的查找类似二分搜索树的查找，根据元素的大小来决定查找的方向。 动画：2-3树插入 2-3树删除元素 2-3树删除元素相对比较复杂，删除元素也和插入元素一样先进行命中查找，查找成功才进行删除操作。 2-3树为满二叉树时，删除叶子节点 2-3树满二叉树的情况下，删除叶子节点是比较简单的。 动画：2-3树删除 -----END---
1K10发布于 2020-01-02 - 来自专栏我是攻城师
什么是2-3树
2-3树 VS 二叉搜索树 同样的一组数据，在2-3树和二叉搜索树里面的对比如下： ? 可以看到2-3树的节点分布非常均匀，且叶子节点的高度一致，并且如果这里即使是AVL树，那么树的高度也比2-3树高，而高度的降低则可以提升增删改的效率。 2-3树的插入 为了保持平衡性，2-3树的插入如果破坏了平衡性，那么树本身会产生分裂和合并，然后调整结构以维持平衡性，这一点和AVL树为了保持平衡而产生的节点旋转的作用一样，2-3树的插入分裂有几种情况如下 2-3树的删除 2-3树节点的删除也会破坏平衡性，同样树本身也会产生分裂和合并，如下： ? 总结 本篇文章，主要介绍了2-3树相关的知识，2-3树，2-3-4树以及B树都不是二叉树，但与二叉树的大致特点是类似的，它们是一种平衡的多路查找树，节点的孩子个数可以允许多于2个，虽然高度降低了，但编码相对复杂
2.3K20发布于 2019-04-28 - 来自专栏python3
2-3 选项卡控件
2-3 选项卡控件 u本节学习目标： n了解选项卡控件的基本属性 n掌握如何设置选项卡控件的属性 n掌握统计页面选项卡控件页面基本信息 n掌握选项卡控件的功能操作控制 2-3-1 简介 在 Windows 一般选项卡在Windows操作系统中的表现样式如图2-3所示。 ? 图2-3 图片框控件的属性及方法 2-3-2 选项卡控件的基本属性 图片框控件是使用频度最高的控件，主要用以显示窗体文本信息。 其基本的属性和方法定义如表2-3所示： 属性 说明 MultiLine 指定是否可以显示多行选项卡。如果可以显示多行选项卡，该值应为 True，否则为 False。 使用这个集合可以添加和删除TabPage对象 表2-3 选项卡控件的属性 2-3-3 选项卡控件实践操作 1．
2.1K10发布于 2020-01-07 - 来自专栏python3
2-3 T-SQL函数
2-3 T-SQL函数 学习系统函数、行集函数和Ranking函数；重点掌握字符串函数、日期时间函数和数学函数的使用参数以及使用技巧 重点掌握用户定义的标量函数以及自定义函数的执行方法 掌握用户定义的内嵌表值函数以及与用户定义的标量函数的主要区别 我们首先运行一段SQL查询：select tno,name , salary From teacher，查询后的基本结构如图2-3所示。我们看见，分别有三位教师的薪水是一样高的。 图2-3 薪酬排序基本情况 图2-4 row_number函数排序 图2-5 row_number另一使用 我们可以使用Row_number函数来实现查询表中指定范围的记录，一般将其应用到Web应用程序的分页功能上
2K10发布于 2020-01-08 - 来自专栏刷题笔记
2-3 链表拼接 (20 分)
本文链接：https://blog.csdn.net/shiliang97/article/details/101050371 2-3 链表拼接 (20 分) 本题要求实现一个合并两个有序链表的简单函数
68240发布于 2019-11-08 - 来自专栏作图丫
NATURE|人类突变特征
背景介绍 单个癌症基因组的突变可能是由多个突变过程产生的，因此包含了多个叠加的突变特征。 因此，为了系统地描述导致癌症的突变过程，曾使用数学方法从体细胞突变目录中解释突变特征，并用每个特征产生的概率注释每个肿瘤中的每个突变类。 随后，包含聚类突变的SBS突变目录集进行了突变特征的从头提取。任何新的突变特征(以前在完整的SBS目录中没有看到的)都认为识聚集突变特征。 5. ID5突变的数量与SBS40突变的数量相关，因此，这两种年龄相关特征的突变过程可能包含共同的成分。 结果表明，多个突变过程在正常细胞中运行。 小编总结 癌症基因组中的体细胞突变是由多个突变过程引起的，每一个突变过程都产生一种特征性的突变特征。
2.9K20编辑于 2022-03-29 - 来自专栏机器学习入门
算法原理系列：2-3查找树
结构缘由 首先，搞清楚2-3查找树为什么会出来，它要解决什么样的问题？假设我们对它的基本已经有所了解了。先给它来个简单的定义： 2-3查找树： 一种保持有序结构的查找树。 而2-3树就是为了规避上述问题而设计发明出来的模型。现在请思考该如何设计它呢？ 这里我们从BST遇到的实际问题出发，提出设计指标，再去思考利用些潜在的性质来构建2-3树。 这部分内容，没有什么理论根据，而是我自己尝试去抓些字典的性质来构建，而2-3树的诞生过程并非真的如此，所以仅供参考。 构建2-3树 字典的两个主要操作为：查找和插入。 我就不卖关子了，直接给出2-3树的其中一个基本定义： 一棵2-3查找树或为一颗空树，或由以下节点组成： 2-节点：含有一个键和两条链接，左链接指向的2-3树中的键都小于该节点，右链接指向的2-3树中的键都大于该节点 3-节点：含有两个键和三条链接，左链接指向的2-3树中的键都小于该节点，中链接指向的2-3树中的键都位于该节点的两个键之间，右链接指向的2-3树中的键都大于该节点。 ！！！
1.1K20发布于 2019-05-26 - 来自专栏作图丫
deconstructSigs 突变 Signature 分析
面对大量的SNV突变数据你是否还觉得无从下手，不知道怎么分析合适？今天给大家介绍一个R包-deconstructSigs。这款R包是基于大样本量预测的signature解析突变特征。 sample.id # 突变文件中的样品列名 chr # 突变文件中的染色体列名 pos # 突变文件中的突变位置列名 ref # 突变文件中的参考基因组碱基列名 alt # 突变文件中的突变碱基列名 TRUE, tri.counts.method = 'default') whichSignatures参数释义 tumor.ref # 上一步生成突变文件 ，数据为数据框或文本，横行是样本，纵行是突变碱基上下文序列 sample.id # 样品名称，tumor.ref文件的行名 signatures.ref # 预测的已知signatures参考文件 signatures.limit # 关联的signature上限，默认无限制 signature.cutoff # 舍弃小于此阈值的关联signature contexts.needed # 是否需要突变上下文
1.7K30编辑于 2022-03-29 - 来自专栏coding for love
2-3 webpack的正确安装方式
webpack是基于node开发的环境打包工具。首先需要安装node环境。 进入node官网，尽量安装最新版本的稳定版node。因为提高webpack打包速度有两个重要的点：
60320发布于 2019-05-14 - 来自专栏用户7627119的专栏
基因突变类型
狭义突变通常特指基因突变，它包括单个碱基改变所引起的点突变（point mutation），或多个碱基的缺失、重复和插入。 基因突变可发生在个体发育的任何阶段，以及体细胞或生殖细胞周期的任何时期。 如果突变发生在体细胞中，则变异不能直接遗传给下一代。如果突变发生在某一个配子中，那么，子代中只有某一个个体有可能继承这个突变基因。 如果按照DNA碱基顺序改变的类型区分，突变还可以分为碱基置换突变、移码突变、整码突变、染色体错误配对和不等交换4种。 1.碱基置换突变 一个碱基被另一个碱基取代而造成的突变称为碱基置换突变。 根据碱基置换对肽链中氨基酸顺序的影响，可以将突变分为同义突变、错义突变、无义突变和终止密码突变4种类型。 此外，还有抑制基因突变。如果基因内部不同位置上的不同碱基分别发生突变，使其中一次突变抑制了另一次突变的遗传效应，这种突变称为抑制基因突变（suppressor gene mutation）。
2.1K10编辑于 2022-09-21 - 来自专栏U3D技术分享
《游戏引擎架构》阅读笔记-第2-3章
本系列博客为《游戏引擎架构》一书的阅读笔记，旨在精炼相关内容知识点，记录笔记，以及根据目前（2022年）的行业技术制作相关补充总结。 本书籍无硬性阅读门槛，但推荐拥有一定线性代数，高等数学以及编程基础，最好为制作过完整的小型游戏demo再来阅读。 本系列博客会记录知识点在书中出现的具体位置。并约定（Pa b），其中a为书籍中的页数，b为从上往下数的段落号，如有lastb字样则为从下往上数第b段。 本系列博客会约定用【】来区别本人所书写的与书中观点不一致或者未提及的观点，该部分观点受限于个人以及当前时代的视角
93910编辑于 2022-10-28 - 来自专栏InCerry
.NET周刊【4月第2-3期】
https://www.cnblogs.com/hez2010/p/18813775/dotnet-nativeaot-distroless-statically-linked-app
77410编辑于 2025-05-04 - 来自专栏生信修炼手册
TMB:肿瘤突变负荷简介
肿瘤突变负荷 tumor mutation burden, 简称TMB，代表蛋白编码区的非同义突变分布的密度，用蛋白编码区的非同义突变位点总数除以蛋白编码区的总长度, 单位为mutations/mb。 肿瘤的发生是体细胞突变引起的，体细胞在致癌因子的作用下发生基因突变，部分突变细胞经过DNA自我修饰恢复正常，一部分细胞死亡，还有部分突变细胞在其表面表达出新的抗原。 正常情况下下，机体的免疫系统可以识别这些抗原，然后通过免疫应答反应来清楚这些突变的细胞，但是肿瘤细胞可以通过抗原的异常表达或者肿瘤微环境的调节，来实现免疫逃逸，继续分裂生长，形成肿瘤。 TMB的概念中只针对了蛋白编码区的非同义突变，因为只有这些突变才有可能使得肿瘤细胞产生新抗原。
2.7K31发布于 2019-12-19 - 来自专栏五分钟学算法
数据结构与算法——2-3树
因此，引入了 2-3 树来提升效率。2-3 树本质也是一种平衡搜索树，但 2-3 树已经不是一棵二叉树了，因为 2-3 树允许存在 3 这种节点，3- 节点中可以存放两个元素，并且可以有三个子节点。 2-3 树定义 2-3 树的定义如下： （1）2-3 树要么为空要么具有以下性质： （2）对于 2- 节点，和普通的 BST 节点一样，有一个数据域和两个子节点指针，两个子节点要么为空，要么也是一个2 例如图 2.1 所示的树为一棵 2-3 树： ? 图2.1 2-3 树性质 性质： （1）对于每一个结点有 1 或者 2 个关键码。 （2）当节点有一个关键码的时，节点有 2 个子树。 2-3树查找 2-3 树的查找类似二叉搜索树的查找过程，根据键值的比较来决定查找的方向。 例如在图 2.1 所示的 2-3 树中查找键为H的节点： ? img 2-3树为满二叉树，删除叶子节点 操作步骤：若2-3树是一颗满二叉树，将2-3树层树减少，并将当前删除节点的兄弟节点合并到父节点中，同时将父节点的所有兄弟节点合并到父节点的父节点中，如果生成了4
80010发布于 2019-09-03 - 来自专栏育种数据分析之放飞自我
笔记GWAS 操作流程2-3：MAF过滤
因为这里是人的数据，所以染色体只需要去1~22的常染色体，提取它的家系ID和个体ID，后面用于提取。
6.1K20发布于 2020-04-14 - 来自专栏生信技能树
突变位点生存分析
一个简单突变位点做生存分析居然拖了一两个月才有人提交笔记！ 前面的题目见：学徒作业-两个基因突变联合看生存效应 （2020-04-26出题），下面看其中一个学徒的答案哦，同时也欢迎大家继续提交笔记给我哈，有机会认识我！ 加油哈，广大粉丝们 1 主要流程 1.本次选用BRCA的maf数据和临床数据，主要使用其中的varscan数据 2.使用R包maftools读取maf文件，并可视化top10突变基因 3.选取两基因对BRCA 临床样本进行分组 所选取两基因都未发生突变的样本为一组 剩余样本为一组 4.使用logrank进行生存分析 2 代码及结果图 1.读取maf文件并对数据进行可视化 options(download.file.method group_list<-ifelse(group_list=="TP53/KMT2C+","TP53/KMT2C+","TP53/KMT2C-") table(group_list) 4.针对基因突变与否
1.9K31发布于 2020-06-19 - 来自专栏算法无遗策
（基于2-3树）
学习过2-3树之后就知道应怎样去理解红黑树了，如果直接看「算法导论」里的红黑树的性质，是看不出所以然。 此时我们借着2-3树去理解基本的红黑树，当然我会在后几篇文章介绍2-3-4树以及基于2-3-4树的红黑树。 红黑是指被指向节点的链接颜色，对于一颗2-3树，因为3-节点的存在有很多不同的二叉树的表示，所以我们只考虑左倾的情况。 （和2-3树等价的，任意节点到其叶子节点的高度都是相同的）。 因为2-3树不存在永久的4-节点，4-节点终归要分解的（在2-3-4树中，为了更好地插入和删除，4-节点可存在于叶子节点和非叶子节点）2-3树一样不行，所以在2-3树中没有任何一个节点能同时和两条红链接相连
1K20发布于 2020-01-02 - 来自专栏静之森
记录折腾路上用到的教程 自2-3开始
netdata: Real-time performance monitoring
68320编辑于 2021-12-28
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