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  • 来自专栏生信技能树

    在ubuntu20上面安装R4

    sudo apt install --fix-missing libcurl4-openssl-dev libxml2-dev libgdal-dev libssl-dev libglu1-mesa-dev -dev sudo apt install -y openssl sudo apt install -y libssl-dev 安装最新版R语言 使用root权限(系统管理员)安装最新版的R,我们的 实际上还需要使用root权限(系统管理员)安装一些R包。 安装一些R包 这里我们使用root权限(系统管理员):sudo R options()$repos options()$BioC_mirror #options(BioC_mirror="https sudo chmod -R 2770 /var/www/html 同时,也需要管理ubuntu的端口,Nginx安装后,理论上IP可以在浏览器打开访问,但是要求网页端口80的开通的。

    1.7K32发布于 2020-08-11
  • 来自专栏R语言的基本操作

    R语言day4:再也不用担心R包的安装

    title: "day4note" output: html_document date: "2024-03-09" 1.R安装 R包理解为多个函数打包存放,包含函数、数据、帮助文件、描述文件 找所有 R包使用的规律 生物信息学R包的三个来源 install.packages("tidyr") #CRAN网站 install.packages('BiocManager') #Bioconductor library(tidyr)#安装后需加载 library(stringr) #library没有error,R安装成功 require(tidyr)#返回逻辑值 3.1 pheatmap::pheatmap (volcano)#已经安装的包,可以用::快速调用里面的函数 #当一个代码要复制三次,写成循环 4.安装包时存在提示信息 R语言版本只追求第二位最新 4.1问是否更新的、“不存在”的是依赖包 使用包里的函数 ,要先安装或加载包 更新一个包:取消加载,卸载,重启session,安装 如果是windows系统还会遇到,权限不够???

    68311编辑于 2024-03-11
  • 来自专栏编程

    R基础入门(4)——安装图形化操作界面

    R的图形化操作界面有多个,既包含基本统计分析的功能,又覆盖了高阶的数据挖掘功能。我们今天先来安装其中之一——R Commander,一个基本的统计分析图形界面,并同时顺带介绍一下程序包的安装过程。 要想安装R的数以千计的社区程序包,首先要选择好距离最近的镜像站点,以提高安装的速度。 再次打开“Tools”菜单,选择“Install Packages”,然后在弹出的界面中间的输入框输入“Rcmdr”,代表R Commander,并勾选下面的“同时安装依附运行包”选项。 确定之后,就是R Commander的安装过程了。根据网速的不同,这个过程长短不一。 程序包安装之后如何启动呢? R是用library()命令来调用程序包的,我们只需在命令行输入:library(Rcmdr),R Commander图形界面就启动了。

    2.8K110发布于 2018-03-02
  • 来自专栏企鹅号快讯

    C4D R14软件安装教程

    C4D R14(64位)下载地址: 链接:https://pan.baidu.com/s/1slwUuo1 密码:k88e C4D R14(MAC)下载地址: 链接:https://pan.baidu.com 安装有问题可直接在电脑学习公众号留言! 安装步骤: 注意:MAC苹果系统直接跳到第12步安装即可。 3.点击确认 4.点击下一步 5.选择我接受协议,点击下一步 6. 点击浏览更改软件安装路径:C盘不够时就是按照到别的磁盘。 12.返回文件夹,选择C4D_R14.iso,按下鼠标右键,点击装载到。 13.打开我的电脑找到BD-ROM驱动器 14.打开Cinema 4D R14文件夹后,双击打开Setup。 勾选“我已阅读并同意许可”点击安装 21.更改软件安装路径:建议安装到除C盘以外的磁盘,可在D盘或其它盘新建一个文件夹C4DR14,然后点击安装 22.安装完成后,点击结束。

    1.3K70发布于 2018-01-10
  • 来自专栏生信学习~~~

    R4R语言作图

    ---title: "note4"output: html_documentdate: "2023-05-16"---R Markdown#设置镜像options("repos"=c(CRAN="http ://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))#安装R包if(! require(patchwork))install.packages("patchwork",update = F,ask = F)#加载以检查是否安装成功library(ggplot2)library library(eoffice)library(patchwork)#作图分三类#1.基础包 略显陈旧 了解一下plot(iris[,1],iris[,3],col = iris[,5]) text(6.5,4, labels = 'hello')#在6.5,4坐标处加上hellodev.off() #关闭画板#2.ggplot2 中坚力量,语法有个性,theme_bw()+#把灰色主题背景去掉,theme_classic

    1.2K20编辑于 2023-05-17
  • 来自专栏微信公众号:小白课代表

    软件分享 | C4D R14 安装教程

    C4D全名CINEMA 4D,德国MAXON出的3D动画软体。Cinema4D是一个老牌的三维软件。能够进行顶级的建模、动画和渲染的3D工具包。 3、Mac用户请直接双击C4D R14镜像文件安装,Windows用户请解压安装镜像,双击setup.exe ? ? 4、在非系统盘新建一个文件夹(不包含中文) ? 5、双击安装程序,选择中文CN-Chinese,再点击OK ? 6、一直继续 ? ? ? ? 7、同意许可并继续 ? 8、更改软件安装路径到之前新建的文件夹,安装 ? ? 9、经过耐心地等待,安装好以后,点击结束 ? ? C4D R14 Windows+Mac 下载链接: 链接:https://pan.baidu.com/s/1dL60wQ 密码:cyge 或者在公众号后台回复『027』或『C4D』获取下载链接。

    1.4K20发布于 2018-06-29
  • 来自专栏微信公众号:小白课代表

    软件分享 | C4D R16 安装教程

    C4D全名CINEMA 4D,德国MAXON出的3D动画软体。Cinema4D是一个老牌的三维软件。能够进行顶级的建模、动画和渲染的3D工具包。 安装步骤:Mac+Windows下载链接在文末 1、Mac用户请直接双击C4D R16镜像文件安装,Windows用户请解压或用虚拟光驱装载安装镜像,双击MAXON-Start.exe ? ? 3、双击安装程序,选择中文CN-Chinese,再点击OK ? 4、继续 ? 5、姓名公司随意填写,打开注册机,点击Generate生成序列号。 7、更改软件安装路径到之前新建的文件夹,安装 ? ? 8、经过耐心地等待,安装好以后,点击结束 ? C4D R16 Windows+Mac 下载链接: 链接:https://pan.baidu.com/s/1dL60wQ 密码:cyge 或者在公众号后台回复『027』或『C4D』获取下载链接。

    1.9K50发布于 2018-06-29
  • 来自专栏微信公众号:小白课代表

    软件分享 | C4D R18 安装教程

    C4D全名CINEMA 4D,德国MAXON出的3D动画软体。Cinema4D是一个老牌的三维软件。能够进行顶级的建模、动画和渲染的3D工具包。 安装步骤:Mac+Windows下载链接在文末 1、Mac用户请直接双击C4D R17镜像文件安装,Windows用户请解压或用虚拟光驱装载安装镜像,双击MAXON-Start.exe ? ? 3、双击安装程序,选择中文CN-Chinese,再点击OK ? 4、继续 ? 5、姓名公司随意填写,序列号从解压到的序列号文件里随意复制一行。继续。 ? ? ? 6、同意许可并继续 ? 7、更改软件安装路径到之前新建的文件夹,安装 ? ? 8、经过耐心地等待,安装好以后,点击结束 ? C4D R18 Windows+Mac 下载链接: 链接:https://pan.baidu.com/s/1dL60wQ 密码:cyge 或者在公众号后台回复『027』或『C4D』获取下载链接。

    1.7K30发布于 2018-06-29
  • 来自专栏微信公众号:小白课代表

    软件分享 | C4D R15 安装教程

    C4D全名CINEMA 4D,德国MAXON出的3D动画软体。Cinema4D是一个老牌的三维软件。能够进行顶级的建模、动画和渲染的3D工具包。 安装步骤:Mac+Windows下载链接在文末 1、Mac用户请直接双击C4D R15镜像文件安装,Windows用户请解压或用虚拟光驱装载安装镜像,双击MAXON-Start.exe ? ? 3、双击安装程序,选择中文CN-Chinese,再点击OK ? 4、继续 ? 5、姓名公司随意填写,序列号从解压到的序列号文件里随意复制一行。继续。 ? ? ? 6、同意许可并继续 ? 7、更改软件安装路径到之前新建的文件夹,安装 ? ? 8、经过耐心地等待,安装好以后,点击结束 ? C4D R15 Windows+Mac 下载链接: 链接:https://pan.baidu.com/s/1dL60wQ 密码:cyge 或者在公众号后台回复『027』或『C4D』获取下载链接。

    1.1K30发布于 2018-06-29
  • 来自专栏微信公众号:小白课代表

    软件分享 | C4D R17 安装教程

    C4D全名CINEMA 4D,德国MAXON出的3D动画软体。Cinema4D是一个老牌的三维软件。能够进行顶级的建模、动画和渲染的3D工具包。 安装步骤:Mac+Windows下载链接在文末 1、Mac用户请直接双击C4D R17镜像文件安装,Windows用户请解压或用虚拟光驱装载安装镜像,双击MAXON-Start.exe ? ? 3、双击安装程序,选择中文CN-Chinese,再点击OK ? 4、继续 ? 5、姓名公司随意填写,序列号从解压到的序列号文件里随意复制一行。继续。 ? ? ? 6、同意许可并继续 ? 7、更改软件安装路径到之前新建的文件夹,安装 ? ? 8、经过耐心地等待,安装好以后,点击结束 ? C4D R17 Windows+Mac 下载链接: 链接:https://pan.baidu.com/s/1dL60wQ 密码:cyge 或者在公众号后台回复『027』或『C4D』获取下载链接

    1.6K40发布于 2018-06-29
  • 来自专栏全栈程序员必看

    R语言安装~R,Rstudio

    一、R语言安装 首先进入官网:https://cran.r-project.org 下载相应版本的安装包 点击base 点击Download R4.1.2 for Windows,即可开始下载 下载完成后,点击该安装包,开始下载 我要安装的是64bit,把32bit的勾划掉,继续点击下一步,直到安装完成 二、Rstudio安装 下载地址为:Download the RStudio IDE – RStudio 点击free下的download 选择合适的版本,开始下载安装包 下载完成后,点击安装包,开始安装 点击下一步,直到安装完成 发布者:全栈程序员栈长,转载请注明出处:

    3.6K20编辑于 2022-09-14
  • 来自专栏生信矿工

    R语言笔记-4

    生信技能树-数据挖掘课程笔记 文件读写 #读取csv文件 csv = read.csv(“test.csv”) csv = read.csv("test.csv",header = T) #将第一行作为列名 csv = read.csv("test.csv",row.names = 1,check.names = F) #将第一列作为行名,并不检查特殊符号 # 数据框不允许有重复的行名 #读取txt文件 txt = read.table("test.txt") txt = read.table("test

    50910编辑于 2023-05-21
  • 来自专栏我的生物信息菜鸟学习笔记

    day4-R

    1、认识R和RstudioR是一种编程语言,主要用于统计计算和绘图,有很多函数。Rstudio是开源集成开发环境,让R的“内饰”更好。 2、设置字体大小Tools-Global Options-Appearance-editor foot size-Apply3、R语言基本操作1、用Rproject管理目录file-new project-new 文件的前缀)-选择位置-create project来自生信技能树2、显示文件列表dir()这条代码可以显示工作目录3、加减乘除3+53-53*53/53^5sqrt(9)abs(-3)log2(8)4、 赋值x<-1#给x赋值为1x#输出x5、删除变量a<-3b <- 1c <- 4u <- 5+6rm(b)rm(u,c) rm(list = ls())#清空所有变量6、列出历史命令history()

    24210编辑于 2024-10-25
  • 来自专栏Hank’s Blog

    4-4 R语言函数 tapply

    #对向量的子集进行操作 #tapply(参数):tapply(向量,因子/因子列表,函数/函数名) > x <- c(rnorm(5),runif(5),rnorm(5,1)) > f <- gl(3,5) > f [1] 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 3 3 3 3 3 Levels: 1 2 3 > tapply(x,f,mean) 1 2 3 -0.5004154 0.4044779 0.9769996 > tapply

    37310发布于 2020-09-16
  • day4-啦啦啦-R语言基础(安装,简单命令)

    R语言介绍R是一种编程语言,主要用于统计计算和绘图;RStudio是R的集成开发环境,是图形界面,易操作。 RStudio包括4部分:脚本编辑器--写代码;控制台--脚本运行和结果显示;environment(对象和变量列表)/history(历史命令)文件/图片/帮助/包R语言的简单出图命令注意输入括号时的输入法 ))boxplot(iris$sepal1.length~iris$species,col=c("lightblue","yellow","pink"))作图最主要是要知道要画的是什么图,然后用对应的R包生成 ;要注意R包中对应的参数;R语言的基本操作

    29510编辑于 2024-01-19
  • 来自专栏优雅R

    R」CentOS 从源安装 R

    安装R编译依赖 yum-builddep R 消灭界面configure警告:configure: WARNING: neither inconsolata.sty nor zi4.sty found wget -c https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.6.1.tar.gz tar zxvf R-3.6.1.tar.gz 编译安装 cd R-3.6.1 sudo ln -s /home/public/R/R-basebin/R /bin/R 整个过程最容易出错的地方就是编译,使用 configure 可能会爆出很多库找不到的情况,这也是为什么先使用 yum-builddep R 安装编译依赖。 其他 Linux 上的操作过程是类似的,但如果缺少库,最好还是必应或谷歌一下对应系统的库名然后安装它们。

    1.7K20发布于 2020-07-06
  • 来自专栏优雅R

    R安装和使用 R

    问题 你想安装和使用一个 R 包。 如果想要将所有已安装的软件包更新为可用的最新版本,使用以下命令: update.packages() 如果你在 Linux 系统上使用 R ,管理员可能已经在系统上安装了一些 R 包,由于普通用户没有更改权限 下表显示了 R安装相关的命令及描述。 R包 remove.packages 移除一系列已安装R包 installed.packages 将已经安装R包更新到最新版本 setRepositories 设定当前的R包的资源库列表 通过命令行安装 RR CMD INSTALL aplpack_1.1.1.tgz # 安装aplpack包 从其他资源库安装 R 包 devtools 包提供了从其他流行的 Git 资源库或其他 URL 上安装

    2.4K30发布于 2020-07-03
  • 来自专栏毛利学Python

    R环境安装

    anaconda安装R 最开始接触Anaconda,应该是18年3月,还是在机器学习的时候用过,Anaconda是一个用于科学计算的Python发行版,支持 Linux, Mac, Windows系统 IRkernel::installspec() # 或者是在系统下安装 IRkernel::installspec(user = FALSE) 最好的方法直接 conda install -c r R语言的注释 “#”后面的内容表示注释; 如果有多行注释则在每一行注释前加上“#” 在注释行结尾加上4个“#”,则这一行会被当做一个节标题 2.函数调用 head(iris) # R语言语法 CO2") #对函数使用help,查看函数使用方法 help(ggplot) #对内置数据集使用帮助文档,查看数据集的信息 example(ggplot) # 查看ggplot函数用法示例 4. 安装rstudio 一行命令搞定 conda install -c r rstudio 如下图 在这里插入图片描述 命令行输入 rstudio

    2K10发布于 2019-11-24
  • 来自专栏生信小驿站

    R语言安装

    1找到并打开打开R语言官网 2点击主页面上的download R 3在跳转的镜像界面,下拉选择中国的镜像,这里选择第一个清华大学地址。 4根据自己的操作系统选择相应的版本,选择 Download R for Windows 5在base一行,点击 install R for the first time 6 点击Download R 3.3.3 for Windows,保存,然后双击安装程序像其他软件一样按照提示进行正常安装即可。 7 选择下载地址,尽量安装在非C盘 8 安装地址不要出现中文,否则会有意外错误。其他安装按照默认即可。 9 打开R软件,看到这个页面即代表安装成功。 image.png

    2.1K00发布于 2019-04-18
  • 来自专栏优雅R

    R」MacOS 安装 R4.0

    前往 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ 下载新的版本,鼠标点击安装。 ? 安装完以后启动(重启)RStudio: R version 4.0.0 (2020-04-24) -- "Arbor Day" Copyright (C) 2020 The R Foundation for ; invoking 'abort' restart 可能有些包之前跟系统包装到了一起,更新后找不到了,重新安装下即可。 stats tools Matrix cluster foreign lattice nnet rpart stats4 Resources/library KernSmooth boot compiler graphics mgcv rpart stats4

    2.3K10发布于 2020-07-03
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